MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus CNRZ32

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021744	CCAAAA	2	12	31400	31411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021744	AAAAAT	2	12	31690	31701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021744	ATAAAT	2	12	35154	35165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021744	AAAGTA	2	12	41778	41789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021744	TTTTAT	2	12	45839	45850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021744	AAATAC	2	12	56828	56839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021744	ATATTT	2	12	65402	65413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021744	AGACAA	2	12	70673	70684	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021744	CTTTTT	2	12	73571	73582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021744	ATTGCA	2	12	75219	75230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021744	CGGAGC	2	12	83983	83994	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021744	TACTTT	2	12	88335	88346	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021744	CACGGT	2	12	88875	88886	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021744	ATTTTA	2	12	98674	98685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021744	TATTTT	2	12	99250	99261	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021744	ACTGCT	2	12	103458	103469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021744	CCAAAA	2	12	106005	106016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021744	AAAAAT	2	12	106295	106306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021744	AAAGAA	2	12	117460	117471	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021744	GCTTAA	2	12	131520	131531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021744	AATTTT	2	12	133350	133361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021744	TTATTT	2	12	140419	140430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021744	TGTGGT	2	12	184274	184285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021744	CAATAG	2	12	184938	184949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021744	GTAACA	2	12	185654	185665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021744	ATATAG	2	12	192307	192318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021744	TTTGCA	2	12	198118	198129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021744	TTTCTT	2	12	199780	199791	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021744	AAATCA	2	12	216277	216288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021744	TGCCAT	2	12	217372	217383	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021744	AATTTT	2	12	217586	217597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021744	CAAAGG	2	12	218306	218317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021744	TCTTAT	2	12	219231	219242	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021744	ATTGTG	2	12	229260	229271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021744	CACTAA	2	12	236689	236700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021744	TTTAAA	2	12	243588	243599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021744	GTTGTG	2	12	244605	244616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021744	ATTAAA	2	12	245965	245976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021744	TAATTA	2	12	276008	276019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021744	TTCTTT	2	12	282829	282840	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021744	AAAGAA	2	12	291333	291344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021744	TTTTAA	2	12	296771	296782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021744	TCAGCA	2	12	308485	308496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021744	ATCCCA	2	12	313683	313694	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021744	TCCCCG	2	12	314743	314754	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021744	TGACTA	2	12	319905	319916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021744	CCAAAA	2	12	325197	325208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021744	AAAAAT	2	12	327757	327768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021744	CCAAAA	2	12	351155	351166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021744	AAAAAT	2	12	351445	351456	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021744	TCTTTT	2	12	355229	355240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021744	AATTTT	2	12	375740	375751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021744	TTCTTT	2	12	410089	410100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021744	CTTAAG	2	12	415101	415112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021744	GAAAAA	2	12	426989	427000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021744	CAAAAG	2	12	434510	434521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021744	GCGACA	2	12	434676	434687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021744	ATAATT	2	12	438889	438900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021744	AAAGAA	2	12	459080	459091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021744	AATTTT	2	12	480192	480203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021744	CTTAAG	2	12	490012	490023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021744	CAATTA	2	12	494019	494030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021744	GCATCT	2	12	494833	494844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021744	TTGATT	2	12	508532	508543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021744	CTTAAG	2	12	521377	521388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021744	CGGAGC	2	12	544268	544279	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021744	TATGAA	2	12	547446	547457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021744	TTCCTT	2	12	547482	547493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021744	ACAAGG	2	12	561330	561341	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021744	AAAAAG	2	12	562360	562371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021744	GAAGTA	2	12	566634	566645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021744	TAAGTA	2	12	569912	569923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021744	AAAGCA	2	12	578818	578829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021744	AAAGAG	2	12	579636	579647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021744	TAAAAA	2	12	589026	589037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021744	AAGTGC	2	12	590494	590505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021744	ATGGTG	2	12	604219	604230	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021744	ATAAAA	2	12	612075	612086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021744	CTTAAG	2	12	621070	621081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021744	CAATGT	2	12	622004	622015	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021744	TGGCTC	2	12	625394	625405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021744	CTTAAG	2	12	625527	625538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021744	TAAATT	2	12	632519	632530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021744	TTTAAT	2	12	639546	639557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021744	GGCAAT	2	12	639657	639668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021744	ATGAAA	2	12	641815	641826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021744	GAGATA	2	12	642077	642088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021744	AATGAC	2	12	649754	649765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021744	ATTTTT	2	12	658743	658754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021744	TTTTGG	2	12	661303	661314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021744	CTTTTC	2	12	661517	661528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021744	GCTTAA	2	12	673206	673217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021744	TAATGA	2	12	676326	676337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021744	AAAGAA	2	12	688919	688930	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021744	CGCTTC	2	12	693266	693277	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021744	GTAACT	2	12	718154	718165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021744	AACCGT	2	12	719365	719376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021744	TAACTA	2	12	721629	721640	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021744	AATCAA	2	12	724164	724175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021744	CTTAAG	2	12	733664	733675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021744	ATATCA	2	12	745313	745324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021744	AAAAAG	2	12	768256	768267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021744	TAGTCA	2	12	805693	805704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021744	TAAAAA	2	12	813654	813665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021744	AATACT	2	12	814192	814203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021744	AAGAAT	2	12	814714	814725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021744	CTTTTC	2	12	815575	815586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021744	ATCTAT	2	12	824075	824086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021744	TATTTA	2	12	846402	846413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021744	TTTTAT	2	12	857532	857543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021744	TTTTAA	2	12	866950	866961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021744	ATTTTT	2	12	869718	869729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021744	GATTTT	2	12	893889	893900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021744	CCAAAA	2	12	897088	897099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021744	AAAAAT	2	12	897378	897389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021744	TATTTT	2	12	898026	898037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021744	CAAAAG	2	12	898265	898276	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021744	TACTTT	2	12	908935	908946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021744	AAAATG	2	12	909809	909820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021744	GCTCAG	2	12	927619	927630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021744	GTTCAG	2	12	945163	945174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021744	AGCTAA	2	12	945963	945974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021744	ATAAAA	2	12	947235	947246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021744	TTCCTG	2	12	967641	967652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021744	CAAACT	2	12	985634	985645	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021744	TAGTCA	2	12	993724	993735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021744	TAGATT	2	12	1007645	1007656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021744	CCAAAA	2	12	1011869	1011880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021744	AAAAAT	2	12	1012159	1012170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_021744	CAGCAC	2	12	1962544	1962555	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.