MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021743	ACTGAA	2	12	1340	1351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021743	GATATA	2	12	4232	4243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021743	CAAATA	2	12	20968	20979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021743	TCGATT	2	12	59908	59919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021743	TGTGAT	2	12	101725	101736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021743	TGCCTA	2	12	103161	103172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021743	TAAAAC	2	12	135524	135535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021743	AACAAA	2	12	164821	164832	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021743	TAATCT	2	12	215385	215396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021743	GATATA	2	12	215493	215504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021743	TAAAAA	2	12	235885	235896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021743	AAAAGT	2	12	257314	257325	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021743	TTTTAT	2	12	287586	287597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021743	GGCTAA	2	12	333885	333896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021743	TATTAA	2	12	365935	365946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021743	TTGAGC	2	12	378273	378284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021743	AAAAAT	2	12	388544	388555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021743	TATTTT	2	12	388586	388597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021743	TTACAA	2	12	415485	415496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021743	CATATA	2	12	428710	428721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021743	CTATCA	2	12	458663	458674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021743	TAGCTT	2	12	489467	489478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021743	CTTTAA	2	12	491696	491707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021743	GCAATC	2	12	520804	520815	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021743	TTAAAT	2	12	521033	521044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021743	AAAAGT	2	12	551058	551069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021743	TGCACT	2	12	584027	584038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021743	CGGCTC	2	12	585997	586008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021743	AAATCA	2	12	589845	589856	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021743	ATTGTT	2	12	592457	592468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021743	AAAAAT	2	12	644287	644298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021743	TCTGTT	2	12	650441	650452	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021743	TAAAGA	2	12	667283	667294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021743	TCTTTA	2	12	668407	668418	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021743	AAAATA	2	12	671788	671799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021743	AAAACA	2	12	671859	671870	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021743	GCAATG	2	12	674588	674599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021743	ATGGAA	2	12	678329	678340	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021743	AGCACA	2	12	694273	694284	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021743	AAATTT	2	12	730569	730580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021743	TTTTGC	2	12	800704	800715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021743	ATTTCA	2	12	801925	801936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021743	GCCTTC	2	12	805239	805250	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021743	AATTAA	2	12	806028	806039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021743	TCTATT	2	12	851145	851156	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021743	TTTTAT	2	12	855061	855072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021743	ATATTC	2	12	870794	870805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021743	AAAATT	2	12	874683	874694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021743	TTTTCG	2	12	882732	882743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021743	AGCCAT	3	18	904584	904601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021743	TTTTAT	2	12	927327	927338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021743	GATAAA	2	12	1003391	1003402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021743	AGTTTA	2	12	1050332	1050343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021743	AATGAA	2	12	1066910	1066921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021743	AGTGAC	2	12	1080194	1080205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021743	CTGTAT	2	12	1124340	1124351	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021743	TAAACT	2	12	1139949	1139960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021743	CACCCA	2	12	1165314	1165325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021743	CTTGAA	2	12	1170765	1170776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021743	TGCTTT	2	12	1211281	1211292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021743	AAGAGC	2	12	1211349	1211360	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021743	TATAGG	2	12	1216046	1216057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021743	TATAAA	2	12	1242965	1242976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021743	ATTTTA	2	12	1246705	1246716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021743	GTTTTT	2	12	1258324	1258335	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021743	TATTTT	2	12	1261193	1261204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021743	TTGAAA	2	12	1261276	1261287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021743	TTTTGC	2	12	1276400	1276411	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021743	ATTTCA	2	12	1277621	1277632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021743	GCCTTC	2	12	1281051	1281062	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021743	AATTAA	2	12	1281840	1281851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021743	TAAATA	2	12	1324839	1324850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021743	AAAAGC	2	12	1333735	1333746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021743	ATAAAA	2	12	1340031	1340042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021743	GTTTAA	2	12	1375014	1375025	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021743	AGGGGG	2	12	1400725	1400736	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021743	AATAAA	2	12	1436348	1436359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021743	AAATCA	2	12	1437009	1437020	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021743	TTAAAT	2	12	1475669	1475680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021743	TTTTAT	2	12	1549671	1549682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021743	TTTTCG	2	12	1555486	1555497	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021743	TGCGAT	2	12	1583920	1583931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021743	GAATAG	2	12	1590043	1590054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021743	TTTAAA	2	12	1594609	1594620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021743	TTAATT	2	12	1597878	1597889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021743	CGAAGG	2	12	1598666	1598677	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021743	TGAAAT	2	12	1601981	1601992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021743	AAAGAG	2	12	1620042	1620053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021743	TTAATT	2	12	1656091	1656102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021743	CGAAGG	2	12	1656879	1656890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021743	AAGCGA	2	12	1657863	1657874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021743	TGAAAT	2	12	1660310	1660321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021743	AAAAGA	2	12	1668239	1668250	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021743	GGCAAC	2	12	1685933	1685944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021743	TAAAGT	2	12	1706423	1706434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021743	GAAGGG	2	12	1720146	1720157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021743	AAAAAC	2	12	1759040	1759051	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021743	GTTGAA	2	12	1765907	1765918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021743	GAAAGC	2	12	1788802	1788813	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021743	TGCGTT	2	12	1791022	1791033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021743	TTAATT	2	12	1797169	1797180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021743	CGAAGG	2	12	1797957	1797968	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021743	AAGCGA	2	12	1798949	1798960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021743	TGAAAT	2	12	1801396	1801407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021743	AAGCAA	2	12	1802615	1802626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021743	GGTAAA	2	12	1802705	1802716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021743	AAAAAT	2	12	1804378	1804389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021743	TTAAAA	2	12	1817002	1817013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021743	TGAAAG	2	12	1861187	1861198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021743	TAAAAA	2	12	1864471	1864482	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021743	CTATTG	2	12	1893569	1893580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021743	AATATT	2	12	1910598	1910609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021743	TATTTA	2	12	1920124	1920135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021743	AATTTG	2	12	1940800	1940811	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021743	ATACAA	2	12	1943002	1943013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021743	CAAATA	2	12	1979735	1979746	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021743	AATTGA	2	12	2027650	2027661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021743	TAATGA	2	12	2027750	2027761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021743	TTAATT	2	12	2037633	2037644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021743	CGAAGG	2	12	2038421	2038432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021743	AAGCGA	2	12	2039405	2039416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021743	TGAAAT	2	12	2041852	2041863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021743	AAGCAA	2	12	2043071	2043082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021743	GGTAAA	2	12	2043161	2043172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021743	TGAGAA	2	12	2079149	2079160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021743	CACCAA	2	12	2092486	2092497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021743	AGCATT	2	12	2177570	2177581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021743	TAAGGG	2	12	2178983	2178994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021743	AAATGA	2	12	2181095	2181106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021743	TAGAAA	2	12	2225127	2225138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021743	GAAGAT	2	12	2241017	2241028	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021743	TTTTTA	2	12	2286191	2286202	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021743	TCAAAG	2	12	2303040	2303051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021743	GAATAT	2	12	2316964	2316975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021743	TCCCTC	2	12	2384277	2384288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021743	GGATAA	2	12	2417727	2417738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021743	AAACAT	2	12	2417768	2417779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_021743	TTTCGT	2	12	2503551	2503562	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_021743	GAAATG	2	12	2639256	2639267	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.