MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 7066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021743	CGTT	2	8	789	796	0 %	50 %	25 %	25 %	525701271
2	NC_021743	AGGA	2	8	2003	2010	50 %	0 %	50 %	0 %	525701274
3	NC_021743	CAGG	2	8	3182	3189	25 %	0 %	50 %	25 %	525701276
4	NC_021743	GAAA	2	8	3998	4005	75 %	0 %	25 %	0 %	525701279
5	NC_021743	TTTA	2	8	4029	4036	25 %	75 %	0 %	0 %	525701279
6	NC_021743	GATT	2	8	4083	4090	25 %	50 %	25 %	0 %	525701279
7	NC_021743	AATA	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021743	TCAT	2	8	4295	4302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021743	CTTT	2	8	4626	4633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021743	TAAA	2	8	5427	5434	75 %	25 %	0 %	0 %	525701280
11	NC_021743	GGTT	2	8	5540	5547	0 %	50 %	50 %	0 %	525701280
12	NC_021743	AGGA	2	8	5553	5560	50 %	0 %	50 %	0 %	525701280
13	NC_021743	CTTA	2	8	5601	5608	25 %	50 %	0 %	25 %	525701280
14	NC_021743	ATTC	2	8	6464	6471	25 %	50 %	0 %	25 %	525701280
15	NC_021743	TTAT	2	8	6952	6959	25 %	75 %	0 %	0 %	525701281
16	NC_021743	GAAA	2	8	6977	6984	75 %	0 %	25 %	0 %	525701281
17	NC_021743	AAAC	2	8	7276	7283	75 %	0 %	0 %	25 %	525701281
18	NC_021743	ATTT	2	8	7310	7317	25 %	75 %	0 %	0 %	525701281
19	NC_021743	CTCA	2	8	8095	8102	25 %	25 %	0 %	50 %	525701282
20	NC_021743	CATT	2	8	8211	8218	25 %	50 %	0 %	25 %	525701282
21	NC_021743	ACAT	2	8	8315	8322	50 %	25 %	0 %	25 %	525701282
22	NC_021743	AATC	2	8	8633	8640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021743	GAGT	2	8	8929	8936	25 %	25 %	50 %	0 %	525701283
24	NC_021743	TGAG	2	8	9127	9134	25 %	25 %	50 %	0 %	525701283
25	NC_021743	CAAA	2	8	9519	9526	75 %	0 %	0 %	25 %	525701283
26	NC_021743	CTTT	2	8	9824	9831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021743	CTAT	2	8	9918	9925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021743	TTAA	2	8	10254	10261	50 %	50 %	0 %	0 %	525701284
29	NC_021743	CCAA	2	8	11580	11587	50 %	0 %	0 %	50 %	525701284
30	NC_021743	AATC	2	8	11788	11795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021743	AAGA	2	8	12257	12264	75 %	0 %	25 %	0 %	525701285
32	NC_021743	TTTA	2	8	12564	12571	25 %	75 %	0 %	0 %	525701285
33	NC_021743	GACA	2	8	12860	12867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021743	TGCC	2	8	13127	13134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021743	TTTC	2	8	13343	13350	0 %	75 %	0 %	25 %	525701286
36	NC_021743	CTGT	2	8	13444	13451	0 %	50 %	25 %	25 %	525701286
37	NC_021743	CTAG	2	8	14214	14221	25 %	25 %	25 %	25 %	525701287
38	NC_021743	CGGA	2	8	15040	15047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021743	ATTA	2	8	15363	15370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021743	ATTA	2	8	15372	15379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021743	CGCC	2	8	16361	16368	0 %	0 %	25 %	75 %	525701289
42	NC_021743	GGAA	2	8	16610	16617	50 %	0 %	50 %	0 %	525701289
43	NC_021743	GTTT	2	8	17249	17256	0 %	75 %	25 %	0 %	525701289
44	NC_021743	AGAA	2	8	17530	17537	75 %	0 %	25 %	0 %	525701289
45	NC_021743	GCCA	2	8	17670	17677	25 %	0 %	25 %	50 %	525701289
46	NC_021743	ATGT	2	8	17703	17710	25 %	50 %	25 %	0 %	525701289
47	NC_021743	GCAA	2	8	17959	17966	50 %	0 %	25 %	25 %	525701289
48	NC_021743	GGTT	2	8	18071	18078	0 %	50 %	50 %	0 %	525701289
49	NC_021743	GAAC	2	8	19778	19785	50 %	0 %	25 %	25 %	525701290
50	NC_021743	ATTT	2	8	20823	20830	25 %	75 %	0 %	0 %	525701290
51	NC_021743	TGGC	2	8	21284	21291	0 %	25 %	50 %	25 %	525701291
52	NC_021743	TTGC	2	8	21371	21378	0 %	50 %	25 %	25 %	525701291
53	NC_021743	GTTT	2	8	21552	21559	0 %	75 %	25 %	0 %	525701291
54	NC_021743	TTAT	2	8	22029	22036	25 %	75 %	0 %	0 %	525701292
55	NC_021743	TGGC	2	8	22279	22286	0 %	25 %	50 %	25 %	525701292
56	NC_021743	AATT	2	8	22803	22810	50 %	50 %	0 %	0 %	525701292
57	NC_021743	AGAA	2	8	22923	22930	75 %	0 %	25 %	0 %	525701293
58	NC_021743	GCAT	2	8	23325	23332	25 %	25 %	25 %	25 %	525701295
59	NC_021743	AGTT	2	8	23798	23805	25 %	50 %	25 %	0 %	525701295
60	NC_021743	GCCA	2	8	24019	24026	25 %	0 %	25 %	50 %	525701295
61	NC_021743	TTGG	2	8	24491	24498	0 %	50 %	50 %	0 %	525701295
62	NC_021743	TTTA	2	8	25353	25360	25 %	75 %	0 %	0 %	525701296
63	NC_021743	TTCC	2	8	25511	25518	0 %	50 %	0 %	50 %	525701296
64	NC_021743	ACTT	2	8	25846	25853	25 %	50 %	0 %	25 %	525701297
65	NC_021743	TATC	2	8	26578	26585	25 %	50 %	0 %	25 %	525701298
66	NC_021743	TTGT	2	8	26912	26919	0 %	75 %	25 %	0 %	525701298
67	NC_021743	TTCA	2	8	27295	27302	25 %	50 %	0 %	25 %	525701298
68	NC_021743	TCAC	2	8	27347	27354	25 %	25 %	0 %	50 %	525701298
69	NC_021743	TTTC	2	8	27534	27541	0 %	75 %	0 %	25 %	525701298
70	NC_021743	TTGG	2	8	27569	27576	0 %	50 %	50 %	0 %	525701298
71	NC_021743	TGAC	2	8	27633	27640	25 %	25 %	25 %	25 %	525701298
72	NC_021743	TGAA	2	8	28750	28757	50 %	25 %	25 %	0 %	525701299
73	NC_021743	AAGC	2	8	28807	28814	50 %	0 %	25 %	25 %	525701299
74	NC_021743	AATT	2	8	29076	29083	50 %	50 %	0 %	0 %	525701300
75	NC_021743	AGAC	2	8	30077	30084	50 %	0 %	25 %	25 %	525701301
76	NC_021743	GCGT	2	8	30085	30092	0 %	25 %	50 %	25 %	525701301
77	NC_021743	TAGA	2	8	30151	30158	50 %	25 %	25 %	0 %	525701301
78	NC_021743	TAAA	2	8	30640	30647	75 %	25 %	0 %	0 %	525701301
79	NC_021743	TGTA	2	8	30812	30819	25 %	50 %	25 %	0 %	525701302
80	NC_021743	TTTG	2	8	31272	31279	0 %	75 %	25 %	0 %	525701302
81	NC_021743	CTAT	2	8	31899	31906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021743	CAAA	3	12	32120	32131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021743	TTAT	2	8	32148	32155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021743	TATG	2	8	32533	32540	25 %	50 %	25 %	0 %	525701303
85	NC_021743	GTAT	2	8	32625	32632	25 %	50 %	25 %	0 %	525701303
86	NC_021743	TATG	2	8	34210	34217	25 %	50 %	25 %	0 %	525701303
87	NC_021743	CGTG	2	8	34396	34403	0 %	25 %	50 %	25 %	525701303
88	NC_021743	TCCC	2	8	35005	35012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_021743	ATCA	2	8	35141	35148	50 %	25 %	0 %	25 %	525701304
90	NC_021743	ATTA	2	8	35850	35857	50 %	50 %	0 %	0 %	525701304
91	NC_021743	TGAT	2	8	37070	37077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021743	GATT	2	8	37399	37406	25 %	50 %	25 %	0 %	525701305
93	NC_021743	CAAA	2	8	37831	37838	75 %	0 %	0 %	25 %	525701305
94	NC_021743	AATT	2	8	37992	37999	50 %	50 %	0 %	0 %	525701305
95	NC_021743	GTTT	2	8	39053	39060	0 %	75 %	25 %	0 %	525701306
96	NC_021743	CGTG	2	8	39593	39600	0 %	25 %	50 %	25 %	525701307
97	NC_021743	AAAT	2	8	39651	39658	75 %	25 %	0 %	0 %	525701307
98	NC_021743	TTAT	2	8	39707	39714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021743	ATAC	2	8	42566	42573	50 %	25 %	0 %	25 %	525701309
100	NC_021743	TGTT	2	8	42746	42753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021743	ACAA	2	8	42946	42953	75 %	0 %	0 %	25 %	525701310
102	NC_021743	TATC	2	8	43064	43071	25 %	50 %	0 %	25 %	525701310
103	NC_021743	GTTA	2	8	43567	43574	25 %	50 %	25 %	0 %	525701310
104	NC_021743	ATTA	2	8	43589	43596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021743	AATT	2	8	43669	43676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021743	ACCG	2	8	43821	43828	25 %	0 %	25 %	50 %	525701311
107	NC_021743	CGCT	2	8	44223	44230	0 %	25 %	25 %	50 %	525701311
108	NC_021743	CAAG	2	8	44323	44330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021743	CAAC	2	8	45337	45344	50 %	0 %	0 %	50 %	525701312
110	NC_021743	ATTG	2	8	46058	46065	25 %	50 %	25 %	0 %	525701312
111	NC_021743	AGCA	2	8	46185	46192	50 %	0 %	25 %	25 %	525701312
112	NC_021743	GGTG	2	8	46220	46227	0 %	25 %	75 %	0 %	525701312
113	NC_021743	TCTT	2	8	46571	46578	0 %	75 %	0 %	25 %	525701313
114	NC_021743	GCAA	2	8	47810	47817	50 %	0 %	25 %	25 %	525701313
115	NC_021743	TTTC	2	8	48048	48055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021743	CGAA	2	8	48261	48268	50 %	0 %	25 %	25 %	525701314
117	NC_021743	AATT	2	8	48612	48619	50 %	50 %	0 %	0 %	525701314
118	NC_021743	AATG	2	8	48946	48953	50 %	25 %	25 %	0 %	525701314
119	NC_021743	AACT	2	8	49290	49297	50 %	25 %	0 %	25 %	525701315
120	NC_021743	ACCG	2	8	50318	50325	25 %	0 %	25 %	50 %	525701315
121	NC_021743	ACTT	2	8	50543	50550	25 %	50 %	0 %	25 %	525701315
122	NC_021743	ATTG	2	8	52551	52558	25 %	50 %	25 %	0 %	525701317
123	NC_021743	ATAA	2	8	53029	53036	75 %	25 %	0 %	0 %	525701318
124	NC_021743	GTTT	2	8	53376	53383	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021743	AATG	2	8	54477	54484	50 %	25 %	25 %	0 %	525701319
126	NC_021743	TCAC	2	8	55090	55097	25 %	25 %	0 %	50 %	525701320
127	NC_021743	AAAT	2	8	55761	55768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021743	AAAT	2	8	55781	55788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021743	GACA	2	8	56601	56608	50 %	0 %	25 %	25 %	525701321
130	NC_021743	TTGT	2	8	56817	56824	0 %	75 %	25 %	0 %	525701321
131	NC_021743	TAAT	2	8	58249	58256	50 %	50 %	0 %	0 %	525701321
132	NC_021743	TGAA	2	8	58382	58389	50 %	25 %	25 %	0 %	525701321
133	NC_021743	ATTA	2	8	58541	58548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021743	ATAA	2	8	59367	59374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021743	TGCC	2	8	59445	59452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021743	AATA	2	8	60312	60319	75 %	25 %	0 %	0 %	525701324
137	NC_021743	GCAG	2	8	60441	60448	25 %	0 %	50 %	25 %	525701324
138	NC_021743	TTTG	2	8	60583	60590	0 %	75 %	25 %	0 %	525701324
139	NC_021743	GTTA	2	8	61361	61368	25 %	50 %	25 %	0 %	525701325
140	NC_021743	ACAA	2	8	61533	61540	75 %	0 %	0 %	25 %	525701325
141	NC_021743	TTAA	2	8	62349	62356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021743	CTCG	2	8	62962	62969	0 %	25 %	25 %	50 %	525701101
143	NC_021743	ACCG	2	8	63408	63415	25 %	0 %	25 %	50 %	525701101
144	NC_021743	CGAG	2	8	63427	63434	25 %	0 %	50 %	25 %	525701101
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