MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 32424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021743	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021743	GAT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701271
3	NC_021743	ATC	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701271
4	NC_021743	GAT	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701271
5	NC_021743	GAA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701271
6	NC_021743	ATT	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701271
7	NC_021743	TAG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701271
8	NC_021743	TTG	2	6	622	627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701271
9	NC_021743	AGC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701271
10	NC_021743	GCA	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701271
11	NC_021743	AAT	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701272
12	NC_021743	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701272
13	NC_021743	ACA	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021743	GAT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701273
15	NC_021743	ATT	2	6	1462	1467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701273
16	NC_021743	TGA	2	6	1487	1492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701273
17	NC_021743	TAC	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701273
18	NC_021743	TGA	2	6	1538	1543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701273
19	NC_021743	ACC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021743	TTG	2	6	1706	1711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701274
21	NC_021743	CTG	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701274
22	NC_021743	CGG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701274
23	NC_021743	TGA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701274
24	NC_021743	TGA	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701274
25	NC_021743	TAA	2	6	2040	2045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701274
26	NC_021743	AAC	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701274
27	NC_021743	AAT	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701274
28	NC_021743	GAG	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701274
29	NC_021743	GCG	2	6	2473	2478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701274
30	NC_021743	AGA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701274
31	NC_021743	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701274
32	NC_021743	GCT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701274
33	NC_021743	TTA	2	6	2761	2766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701275
34	NC_021743	ATG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701275
35	NC_021743	TAT	2	6	2811	2816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701275
36	NC_021743	TCG	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701275
37	NC_021743	TGA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701276
38	NC_021743	GAT	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701276
39	NC_021743	TTA	2	6	3175	3180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701276
40	NC_021743	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701278
41	NC_021743	TCT	2	6	3515	3520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701278
42	NC_021743	ATT	2	6	3653	3658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021743	TGA	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701279
44	NC_021743	TAT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
45	NC_021743	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701279
46	NC_021743	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
47	NC_021743	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
48	NC_021743	ATA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701279
49	NC_021743	ATA	3	9	3980	3988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701279
50	NC_021743	TAT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
51	NC_021743	TAT	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
52	NC_021743	ATT	2	6	4155	4160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701279
53	NC_021743	TAA	2	6	4266	4271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021743	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021743	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021743	ACT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701280
57	NC_021743	CAT	3	9	4940	4948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701280
58	NC_021743	CGG	2	6	4957	4962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701280
59	NC_021743	GAA	2	6	5045	5050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
60	NC_021743	ACC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701280
61	NC_021743	AGG	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701280
62	NC_021743	TTC	2	6	5317	5322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701280
63	NC_021743	CTG	3	9	5580	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701280
64	NC_021743	ATA	2	6	5589	5594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701280
65	NC_021743	TGA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701280
66	NC_021743	AGA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
67	NC_021743	TGG	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701280
68	NC_021743	ATT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701280
69	NC_021743	ATT	2	6	5814	5819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701280
70	NC_021743	AGA	2	6	5854	5859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
71	NC_021743	ATT	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701280
72	NC_021743	AAG	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
73	NC_021743	ATC	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701280
74	NC_021743	ATG	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701280
75	NC_021743	CCT	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525701280
76	NC_021743	TGA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701280
77	NC_021743	AAG	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701280
78	NC_021743	CAA	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701280
79	NC_021743	TTG	2	6	6342	6347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701280
80	NC_021743	ACC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701280
81	NC_021743	TAA	2	6	6430	6435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701280
82	NC_021743	AAT	2	6	6614	6619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701280
83	NC_021743	CTA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021743	ACA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021743	ACC	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021743	TTG	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701281
87	NC_021743	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701281
88	NC_021743	AAT	2	6	7027	7032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701281
89	NC_021743	ATT	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701281
90	NC_021743	TTA	2	6	7253	7258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701281
91	NC_021743	GAA	2	6	7331	7336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701281
92	NC_021743	TCA	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701281
93	NC_021743	GAA	2	6	7452	7457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701281
94	NC_021743	ATA	2	6	7622	7627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701282
95	NC_021743	TCT	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701282
96	NC_021743	AAT	2	6	7793	7798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701282
97	NC_021743	GAT	2	6	7886	7891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701282
98	NC_021743	GAT	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701282
99	NC_021743	CTG	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701282
100	NC_021743	ATT	2	6	8047	8052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701282
101	NC_021743	ATA	2	6	8265	8270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701282
102	NC_021743	TCA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701282
103	NC_021743	AGA	2	6	8562	8567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021743	TTA	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701283
105	NC_021743	TTA	2	6	8703	8708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701283
106	NC_021743	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701283
107	NC_021743	GGT	2	6	8973	8978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701283
108	NC_021743	GGT	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701283
109	NC_021743	GGT	2	6	9011	9016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701283
110	NC_021743	GGT	2	6	9030	9035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701283
111	NC_021743	TGG	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701283
112	NC_021743	ATT	2	6	9120	9125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701283
113	NC_021743	GAA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701283
114	NC_021743	AGA	2	6	9164	9169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701283
115	NC_021743	CTG	3	9	9340	9348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701283
116	NC_021743	TAT	2	6	9645	9650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701283
117	NC_021743	CAT	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701283
118	NC_021743	GAA	2	6	9688	9693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701283
119	NC_021743	TTC	2	6	9840	9845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021743	AGT	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021743	AAT	2	6	9954	9959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701284
122	NC_021743	ATC	2	6	10002	10007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701284
123	NC_021743	TTA	2	6	10092	10097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701284
124	NC_021743	CGC	2	6	10127	10132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701284
125	NC_021743	GGT	2	6	10176	10181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701284
126	NC_021743	TTG	2	6	10314	10319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701284
127	NC_021743	GGT	2	6	10386	10391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701284
128	NC_021743	TAA	2	6	10397	10402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701284
129	NC_021743	GAA	2	6	10527	10532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701284
130	NC_021743	TGA	2	6	10634	10639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701284
131	NC_021743	TCG	2	6	10805	10810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701284
132	NC_021743	GAA	2	6	10982	10987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701284
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260	NC_021743	GGT	2	6	21698	21703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701291
261	NC_021743	GGT	2	6	21725	21730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701291
262	NC_021743	ATT	2	6	21815	21820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701291
263	NC_021743	ATT	2	6	21839	21844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701291
264	NC_021743	TTC	2	6	21863	21868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701291
265	NC_021743	TGG	2	6	21948	21953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701291
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268	NC_021743	GTG	2	6	22168	22173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701292
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272	NC_021743	CAA	2	6	22755	22760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701292
273	NC_021743	ATT	2	6	22790	22795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701292
274	NC_021743	ATA	2	6	22869	22874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021743	AGG	2	6	22883	22888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021743	ATT	2	6	23044	23049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701293
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281	NC_021743	GTT	2	6	23250	23255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021743	ACG	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701295
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298	NC_021743	ATG	2	6	24748	24753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701295
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304	NC_021743	CCG	2	6	25165	25170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701295
305	NC_021743	TTG	2	6	25283	25288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_021743	TGT	2	6	25299	25304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701296
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372	NC_021743	ACT	2	6	30786	30791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
373	NC_021743	CTC	2	6	31065	31070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525701302
374	NC_021743	ATT	2	6	31127	31132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701302
375	NC_021743	TAA	3	9	31147	31155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701302
376	NC_021743	TAG	2	6	31170	31175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701302
377	NC_021743	TGA	2	6	31258	31263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701302
378	NC_021743	TCA	2	6	31322	31327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701302
379	NC_021743	GAT	2	6	31373	31378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701302
380	NC_021743	TGC	2	6	31380	31385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701302
381	NC_021743	GAA	2	6	31475	31480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701302
382	NC_021743	TAC	2	6	31540	31545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701302
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