MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Serratia liquefaciens ATCC 27592 plasmid

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021742	GTAC	2	8	88	95	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021742	GTCA	2	8	171	178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021742	TCGC	2	8	360	367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021742	AGGC	2	8	863	870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021742	CTAC	2	8	1185	1192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021742	TGCG	2	8	2045	2052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021742	GTGA	2	8	4479	4486	25 %	25 %	50 %	0 %	525695033
8	NC_021742	CCAG	2	8	4784	4791	25 %	0 %	25 %	50 %	525695033
9	NC_021742	CGTG	2	8	5696	5703	0 %	25 %	50 %	25 %	525695037
10	NC_021742	AACG	2	8	7002	7009	50 %	0 %	25 %	25 %	525695034
11	NC_021742	ACCA	2	8	7104	7111	50 %	0 %	0 %	50 %	525695034
12	NC_021742	ATCA	2	8	7218	7225	50 %	25 %	0 %	25 %	525695034
13	NC_021742	GCTG	2	8	7807	7814	0 %	25 %	50 %	25 %	525695039
14	NC_021742	GCAG	2	8	7906	7913	25 %	0 %	50 %	25 %	525695039
15	NC_021742	ATAC	2	8	7931	7938	50 %	25 %	0 %	25 %	525695039
16	NC_021742	GGCC	2	8	8111	8118	0 %	0 %	50 %	50 %	525695040
17	NC_021742	TGGC	2	8	8400	8407	0 %	25 %	50 %	25 %	525695040
18	NC_021742	TATC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	525695040
19	NC_021742	AATG	2	8	8839	8846	50 %	25 %	25 %	0 %	525695041
20	NC_021742	GTCG	2	8	9008	9015	0 %	25 %	50 %	25 %	525695041
21	NC_021742	TCAT	2	8	9822	9829	25 %	50 %	0 %	25 %	525695041
22	NC_021742	CCAG	2	8	10469	10476	25 %	0 %	25 %	50 %	525695042
23	NC_021742	TTAC	2	8	10719	10726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021742	GCAA	2	8	10813	10820	50 %	0 %	25 %	25 %	525695043
25	NC_021742	TGAA	2	8	10882	10889	50 %	25 %	25 %	0 %	525695043
26	NC_021742	CAAG	2	8	10967	10974	50 %	0 %	25 %	25 %	525695043
27	NC_021742	CAGG	2	8	11407	11414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021742	CTCC	2	8	11459	11466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_021742	TTCG	2	8	12127	12134	0 %	50 %	25 %	25 %	525695044
30	NC_021742	CATC	2	8	12263	12270	25 %	25 %	0 %	50 %	525695044
31	NC_021742	CTAT	2	8	12407	12414	25 %	50 %	0 %	25 %	525695044
32	NC_021742	GCAG	2	8	12486	12493	25 %	0 %	50 %	25 %	525695044
33	NC_021742	GGTT	2	8	12979	12986	0 %	50 %	50 %	0 %	525695044
34	NC_021742	CCGC	2	8	13205	13212	0 %	0 %	25 %	75 %	525695044
35	NC_021742	ATCG	2	8	13964	13971	25 %	25 %	25 %	25 %	525695045
36	NC_021742	GGCA	2	8	14726	14733	25 %	0 %	50 %	25 %	525695046
37	NC_021742	CACT	2	8	15314	15321	25 %	25 %	0 %	50 %	525695048
38	NC_021742	CTTT	2	8	16712	16719	0 %	75 %	0 %	25 %	525695049
39	NC_021742	GCCG	2	8	17057	17064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021742	GCCG	2	8	17076	17083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021742	CCTT	2	8	17158	17165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021742	GTCA	2	8	17495	17502	25 %	25 %	25 %	25 %	525695050
43	NC_021742	CTGC	2	8	17819	17826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021742	GCAG	2	8	17846	17853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021742	TAAT	2	8	17909	17916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021742	CATA	2	8	18343	18350	50 %	25 %	0 %	25 %	525695051
47	NC_021742	TTGA	2	8	18815	18822	25 %	50 %	25 %	0 %	525695051
48	NC_021742	GCAA	2	8	18892	18899	50 %	0 %	25 %	25 %	525695052
49	NC_021742	CACC	2	8	19267	19274	25 %	0 %	0 %	75 %	525695052
50	NC_021742	GATA	2	8	20228	20235	50 %	25 %	25 %	0 %	525695053
51	NC_021742	ACCC	2	8	20670	20677	25 %	0 %	0 %	75 %	525695054
52	NC_021742	AACA	2	8	20816	20823	75 %	0 %	0 %	25 %	525695054
53	NC_021742	TGAT	2	8	20910	20917	25 %	50 %	25 %	0 %	525695054
54	NC_021742	ACGA	2	8	21674	21681	50 %	0 %	25 %	25 %	525695055
55	NC_021742	CACT	2	8	22351	22358	25 %	25 %	0 %	50 %	525695055
56	NC_021742	CTTT	2	8	22467	22474	0 %	75 %	0 %	25 %	525695055
57	NC_021742	CGTG	2	8	23116	23123	0 %	25 %	50 %	25 %	525695055
58	NC_021742	CGTT	2	8	23373	23380	0 %	50 %	25 %	25 %	525695055
59	NC_021742	ACGC	2	8	24001	24008	25 %	0 %	25 %	50 %	525695055
60	NC_021742	TCAG	2	8	24963	24970	25 %	25 %	25 %	25 %	525695055
61	NC_021742	CGAG	2	8	25595	25602	25 %	0 %	50 %	25 %	525695056
62	NC_021742	TTTC	2	8	25607	25614	0 %	75 %	0 %	25 %	525695056
63	NC_021742	TGAA	2	8	26158	26165	50 %	25 %	25 %	0 %	525695056
64	NC_021742	CCAG	2	8	26600	26607	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
65	NC_021742	TCTT	2	8	26719	26726	0 %	75 %	0 %	25 %	525695056
66	NC_021742	ACGC	2	8	26759	26766	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
67	NC_021742	CGCA	2	8	26883	26890	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
68	NC_021742	ATGG	2	8	27099	27106	25 %	25 %	50 %	0 %	525695056
69	NC_021742	TACC	2	8	27491	27498	25 %	25 %	0 %	50 %	525695056
70	NC_021742	CAGA	2	8	27773	27780	50 %	0 %	25 %	25 %	525695056
71	NC_021742	CACG	2	8	27809	27816	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
72	NC_021742	GCTG	2	8	28064	28071	0 %	25 %	50 %	25 %	525695056
73	NC_021742	CAGA	2	8	28400	28407	50 %	0 %	25 %	25 %	525695056
74	NC_021742	GTCC	2	8	29631	29638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021742	AGAA	2	8	29789	29796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021742	GTTA	2	8	29893	29900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021742	ACAG	2	8	30245	30252	50 %	0 %	25 %	25 %	525695057
78	NC_021742	AAGA	2	8	30345	30352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021742	TTGT	2	8	30828	30835	0 %	75 %	25 %	0 %	525695058
80	NC_021742	AGGA	2	8	31012	31019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021742	TTTC	2	8	31328	31335	0 %	75 %	0 %	25 %	525695035
82	NC_021742	TACC	2	8	31601	31608	25 %	25 %	0 %	50 %	525695035
83	NC_021742	CACC	2	8	32672	32679	25 %	0 %	0 %	75 %	525695059
84	NC_021742	CAAC	2	8	33333	33340	50 %	0 %	0 %	50 %	525695060
85	NC_021742	AACC	2	8	33416	33423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021742	TTGA	2	8	33959	33966	25 %	50 %	25 %	0 %	525695061
87	NC_021742	CAGA	2	8	34380	34387	50 %	0 %	25 %	25 %	525695061
88	NC_021742	CTTT	2	8	35696	35703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021742	GCCT	2	8	36058	36065	0 %	25 %	25 %	50 %	525695062
90	NC_021742	GCAG	2	8	36289	36296	25 %	0 %	50 %	25 %	525695062
91	NC_021742	GAAC	2	8	37082	37089	50 %	0 %	25 %	25 %	525695063
92	NC_021742	AATG	2	8	37704	37711	50 %	25 %	25 %	0 %	525695064
93	NC_021742	CGAT	2	8	37930	37937	25 %	25 %	25 %	25 %	525695064
94	NC_021742	TTGG	2	8	38358	38365	0 %	50 %	50 %	0 %	525695064
95	NC_021742	GCAG	2	8	38449	38456	25 %	0 %	50 %	25 %	525695064
96	NC_021742	GATC	2	8	38848	38855	25 %	25 %	25 %	25 %	525695065
97	NC_021742	CCAG	2	8	38858	38865	25 %	0 %	25 %	50 %	525695065
98	NC_021742	TTGT	2	8	39110	39117	0 %	75 %	25 %	0 %	525695065
99	NC_021742	CGAT	2	8	39216	39223	25 %	25 %	25 %	25 %	525695065
100	NC_021742	ATTG	2	8	39460	39467	25 %	50 %	25 %	0 %	525695065
101	NC_021742	CTTC	2	8	39510	39517	0 %	50 %	0 %	50 %	525695065
102	NC_021742	AATT	2	8	39819	39826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021742	TTTC	2	8	40057	40064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021742	AGCT	2	8	40894	40901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021742	CAGC	2	8	41469	41476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021742	CTTT	2	8	42151	42158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021742	GTAC	2	8	42714	42721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021742	GTCA	2	8	42797	42804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021742	TCGC	2	8	42986	42993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021742	ACTG	2	8	43578	43585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021742	CTAC	2	8	43807	43814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.