MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Serratia liquefaciens ATCC 27592 plasmid

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021742	GTGA	2	8	4479	4486	25 %	25 %	50 %	0 %	525695033
2	NC_021742	CCAG	2	8	4784	4791	25 %	0 %	25 %	50 %	525695033
3	NC_021742	CGTG	2	8	5696	5703	0 %	25 %	50 %	25 %	525695037
4	NC_021742	AACG	2	8	7002	7009	50 %	0 %	25 %	25 %	525695034
5	NC_021742	ACCA	2	8	7104	7111	50 %	0 %	0 %	50 %	525695034
6	NC_021742	ATCA	2	8	7218	7225	50 %	25 %	0 %	25 %	525695034
7	NC_021742	GCTG	2	8	7807	7814	0 %	25 %	50 %	25 %	525695039
8	NC_021742	GCAG	2	8	7906	7913	25 %	0 %	50 %	25 %	525695039
9	NC_021742	ATAC	2	8	7931	7938	50 %	25 %	0 %	25 %	525695039
10	NC_021742	GGCC	2	8	8111	8118	0 %	0 %	50 %	50 %	525695040
11	NC_021742	TGGC	2	8	8400	8407	0 %	25 %	50 %	25 %	525695040
12	NC_021742	TATC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	525695040
13	NC_021742	AATG	2	8	8839	8846	50 %	25 %	25 %	0 %	525695041
14	NC_021742	GTCG	2	8	9008	9015	0 %	25 %	50 %	25 %	525695041
15	NC_021742	TCAT	2	8	9822	9829	25 %	50 %	0 %	25 %	525695041
16	NC_021742	CCAG	2	8	10469	10476	25 %	0 %	25 %	50 %	525695042
17	NC_021742	GCAA	2	8	10813	10820	50 %	0 %	25 %	25 %	525695043
18	NC_021742	TGAA	2	8	10882	10889	50 %	25 %	25 %	0 %	525695043
19	NC_021742	CAAG	2	8	10967	10974	50 %	0 %	25 %	25 %	525695043
20	NC_021742	TTCG	2	8	12127	12134	0 %	50 %	25 %	25 %	525695044
21	NC_021742	CATC	2	8	12263	12270	25 %	25 %	0 %	50 %	525695044
22	NC_021742	CTAT	2	8	12407	12414	25 %	50 %	0 %	25 %	525695044
23	NC_021742	GCAG	2	8	12486	12493	25 %	0 %	50 %	25 %	525695044
24	NC_021742	GGTT	2	8	12979	12986	0 %	50 %	50 %	0 %	525695044
25	NC_021742	CCGC	2	8	13205	13212	0 %	0 %	25 %	75 %	525695044
26	NC_021742	ATCG	2	8	13964	13971	25 %	25 %	25 %	25 %	525695045
27	NC_021742	GGCA	2	8	14726	14733	25 %	0 %	50 %	25 %	525695046
28	NC_021742	CACT	2	8	15314	15321	25 %	25 %	0 %	50 %	525695048
29	NC_021742	CTTT	2	8	16712	16719	0 %	75 %	0 %	25 %	525695049
30	NC_021742	GTCA	2	8	17495	17502	25 %	25 %	25 %	25 %	525695050
31	NC_021742	CATA	2	8	18343	18350	50 %	25 %	0 %	25 %	525695051
32	NC_021742	TTGA	2	8	18815	18822	25 %	50 %	25 %	0 %	525695051
33	NC_021742	GCAA	2	8	18892	18899	50 %	0 %	25 %	25 %	525695052
34	NC_021742	CACC	2	8	19267	19274	25 %	0 %	0 %	75 %	525695052
35	NC_021742	GATA	2	8	20228	20235	50 %	25 %	25 %	0 %	525695053
36	NC_021742	ACCC	2	8	20670	20677	25 %	0 %	0 %	75 %	525695054
37	NC_021742	AACA	2	8	20816	20823	75 %	0 %	0 %	25 %	525695054
38	NC_021742	TGAT	2	8	20910	20917	25 %	50 %	25 %	0 %	525695054
39	NC_021742	ACGA	2	8	21674	21681	50 %	0 %	25 %	25 %	525695055
40	NC_021742	CACT	2	8	22351	22358	25 %	25 %	0 %	50 %	525695055
41	NC_021742	CTTT	2	8	22467	22474	0 %	75 %	0 %	25 %	525695055
42	NC_021742	CGTG	2	8	23116	23123	0 %	25 %	50 %	25 %	525695055
43	NC_021742	CGTT	2	8	23373	23380	0 %	50 %	25 %	25 %	525695055
44	NC_021742	ACGC	2	8	24001	24008	25 %	0 %	25 %	50 %	525695055
45	NC_021742	TCAG	2	8	24963	24970	25 %	25 %	25 %	25 %	525695055
46	NC_021742	CGAG	2	8	25595	25602	25 %	0 %	50 %	25 %	525695056
47	NC_021742	TTTC	2	8	25607	25614	0 %	75 %	0 %	25 %	525695056
48	NC_021742	TGAA	2	8	26158	26165	50 %	25 %	25 %	0 %	525695056
49	NC_021742	CCAG	2	8	26600	26607	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
50	NC_021742	TCTT	2	8	26719	26726	0 %	75 %	0 %	25 %	525695056
51	NC_021742	ACGC	2	8	26759	26766	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
52	NC_021742	CGCA	2	8	26883	26890	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
53	NC_021742	ATGG	2	8	27099	27106	25 %	25 %	50 %	0 %	525695056
54	NC_021742	TACC	2	8	27491	27498	25 %	25 %	0 %	50 %	525695056
55	NC_021742	CAGA	2	8	27773	27780	50 %	0 %	25 %	25 %	525695056
56	NC_021742	CACG	2	8	27809	27816	25 %	0 %	25 %	50 %	525695056
57	NC_021742	GCTG	2	8	28064	28071	0 %	25 %	50 %	25 %	525695056
58	NC_021742	CAGA	2	8	28400	28407	50 %	0 %	25 %	25 %	525695056
59	NC_021742	ACAG	2	8	30245	30252	50 %	0 %	25 %	25 %	525695057
60	NC_021742	TTGT	2	8	30828	30835	0 %	75 %	25 %	0 %	525695058
61	NC_021742	TTTC	2	8	31328	31335	0 %	75 %	0 %	25 %	525695035
62	NC_021742	TACC	2	8	31601	31608	25 %	25 %	0 %	50 %	525695035
63	NC_021742	CACC	2	8	32672	32679	25 %	0 %	0 %	75 %	525695059
64	NC_021742	CAAC	2	8	33333	33340	50 %	0 %	0 %	50 %	525695060
65	NC_021742	TTGA	2	8	33959	33966	25 %	50 %	25 %	0 %	525695061
66	NC_021742	CAGA	2	8	34380	34387	50 %	0 %	25 %	25 %	525695061
67	NC_021742	GCCT	2	8	36058	36065	0 %	25 %	25 %	50 %	525695062
68	NC_021742	GCAG	2	8	36289	36296	25 %	0 %	50 %	25 %	525695062
69	NC_021742	GAAC	2	8	37082	37089	50 %	0 %	25 %	25 %	525695063
70	NC_021742	AATG	2	8	37704	37711	50 %	25 %	25 %	0 %	525695064
71	NC_021742	CGAT	2	8	37930	37937	25 %	25 %	25 %	25 %	525695064
72	NC_021742	TTGG	2	8	38358	38365	0 %	50 %	50 %	0 %	525695064
73	NC_021742	GCAG	2	8	38449	38456	25 %	0 %	50 %	25 %	525695064
74	NC_021742	GATC	2	8	38848	38855	25 %	25 %	25 %	25 %	525695065
75	NC_021742	CCAG	2	8	38858	38865	25 %	0 %	25 %	50 %	525695065
76	NC_021742	TTGT	2	8	39110	39117	0 %	75 %	25 %	0 %	525695065
77	NC_021742	CGAT	2	8	39216	39223	25 %	25 %	25 %	25 %	525695065
78	NC_021742	ATTG	2	8	39460	39467	25 %	50 %	25 %	0 %	525695065
79	NC_021742	CTTC	2	8	39510	39517	0 %	50 %	0 %	50 %	525695065

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.