MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia liquefaciens ATCC 27592

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021741	AAACCT	2	12	96400	96411	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021741	AGGTTT	2	12	96448	96459	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021741	GCAGCC	2	12	136629	136640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021741	TCTAAA	2	12	144422	144433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021741	GTTTTA	2	12	207859	207870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021741	CCAACG	2	12	231613	231624	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021741	CAACTG	2	12	231956	231967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021741	CAGTGA	2	12	236400	236411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021741	TAAGAC	2	12	269174	269185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021741	ACATCG	2	12	274159	274170	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021741	TTATCT	2	12	281465	281476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021741	TGGCGG	2	12	298890	298901	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021741	ATACAG	2	12	299045	299056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021741	TTTTGT	2	12	305153	305164	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021741	ATTTTT	2	12	320062	320073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021741	GGCAGT	2	12	364361	364372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021741	TGGAAA	2	12	425654	425665	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021741	TAAAAA	2	12	444293	444304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021741	CCGTGC	2	12	469854	469865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021741	TTATCA	2	12	553775	553786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021741	AGCGGC	2	12	568267	568278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021741	TTAACC	2	12	607999	608010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021741	CCCACG	2	12	652986	652997	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021741	CTAAAA	2	12	655859	655870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021741	TTAAAA	2	12	670043	670054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021741	CATTAA	2	12	713016	713027	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021741	CCGTTG	2	12	790429	790440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021741	TTGGCA	2	12	791003	791014	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021741	TAAGAC	2	12	807453	807464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021741	GTACCG	2	12	858633	858644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021741	CTTTCT	2	12	865303	865314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021741	GGTTAG	2	12	881870	881881	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021741	TAAAAA	2	12	887268	887279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021741	ATAGCT	2	12	888756	888767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021741	TCATTT	2	12	892117	892128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021741	CTTGAT	2	12	915128	915139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021741	TACATC	2	12	1031343	1031354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021741	CTTTTT	2	12	1036945	1036956	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021741	ACTGCC	2	12	1072975	1072986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021741	TGTACA	2	12	1105968	1105979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021741	TAAAAA	2	12	1111635	1111646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021741	AGGGCC	2	12	1114159	1114170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021741	TTGCGT	2	12	1127680	1127691	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021741	GAGAAA	2	12	1127706	1127717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021741	GTTAAT	2	12	1147588	1147599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021741	AGTAAA	2	12	1165499	1165510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021741	GCTGGC	2	12	1245239	1245250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021741	GGGTTG	2	12	1269462	1269473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021741	ACCCGC	2	12	1317255	1317266	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021741	AAATCA	2	12	1381591	1381602	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021741	CCAAAC	2	12	1386875	1386886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021741	AACATC	2	12	1399464	1399475	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021741	TCCTGA	2	12	1409224	1409235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021741	TATCAA	2	12	1410524	1410535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021741	GTAAGG	2	12	1472587	1472598	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021741	AAAATG	2	12	1520492	1520503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021741	TGGAAG	2	12	1530509	1530520	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021741	ACGAAT	2	12	1530722	1530733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021741	CCAATT	2	12	1580719	1580730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021741	TTATCG	2	12	1606484	1606495	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021741	CAATAA	2	12	1630140	1630151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021741	ACATGG	2	12	1661969	1661980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021741	GGTGCA	2	12	1699571	1699582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021741	CGTTGC	2	12	1705427	1705438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021741	CAATAA	2	12	1705511	1705522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021741	GCTCCA	2	12	1719722	1719733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021741	GTGCCG	2	12	1734725	1734736	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021741	CAAAAA	2	12	1751443	1751454	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021741	AAAGGG	2	12	1780747	1780758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021741	CACACC	2	12	1842170	1842181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021741	ACGGTG	2	12	1873889	1873900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021741	ACGTTA	2	12	1901931	1901942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021741	GCGTGA	2	12	2018269	2018280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021741	TATTGT	2	12	2028886	2028897	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021741	TTTTTA	2	12	2028912	2028923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021741	TTTTTC	2	12	2045907	2045918	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021741	CCGAAA	2	12	2049761	2049772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021741	ATCACC	2	12	2085043	2085054	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021741	CAGAAA	2	12	2115961	2115972	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021741	GTTAAC	2	12	2128507	2128518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021741	GTTAAC	2	12	2128571	2128582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021741	TATTTT	2	12	2143649	2143660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021741	GGCTGG	2	12	2165350	2165361	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021741	AAATGA	2	12	2182387	2182398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021741	TATCAA	2	12	2182400	2182411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021741	ATCATT	2	12	2197473	2197484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021741	AGAGGA	2	12	2225862	2225873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021741	CTTTTT	2	12	2229600	2229611	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021741	ATAACT	2	12	2233289	2233300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021741	TTTCTT	2	12	2254713	2254724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021741	ATGGAT	2	12	2257847	2257858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021741	GGAAAA	2	12	2307080	2307091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021741	TAGCAT	2	12	2376651	2376662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021741	TCATTT	2	12	2381445	2381456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021741	TATATC	2	12	2411082	2411093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021741	ATTTTG	2	12	2422079	2422090	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021741	TTGCTA	2	12	2434009	2434020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021741	TTGCCG	2	12	2522229	2522240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021741	AGTTTC	2	12	2700008	2700019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021741	TTTACC	2	12	2801302	2801313	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021741	TTAATT	2	12	2810940	2810951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021741	TTGGTT	2	12	2826686	2826697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021741	TAAAAA	2	12	2930128	2930139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021741	TAATTT	2	12	3046170	3046181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021741	AAATAA	2	12	3104811	3104822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021741	TGAAAA	2	12	3106327	3106338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021741	GCTTTT	2	12	3125087	3125098	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021741	TAAATA	2	12	3125160	3125171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021741	AAATAA	2	12	3127562	3127573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021741	TTTGAT	2	12	3127639	3127650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021741	AAAGGT	2	12	3180169	3180180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021741	AAACAA	2	12	3220821	3220832	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021741	CTTTTT	2	12	3234155	3234166	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021741	GGCCTG	2	12	3240511	3240522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021741	AAAATC	2	12	3248390	3248401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021741	CAGCCG	2	12	3314703	3314714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021741	GCTTTA	2	12	3352043	3352054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021741	GTTATC	2	12	3352196	3352207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021741	AACAAT	2	12	3454833	3454844	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021741	AACAAA	2	12	3455723	3455734	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021741	ATTAAA	2	12	3517572	3517583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021741	AGAAAA	2	12	3574298	3574309	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021741	ACCAGC	2	12	3594571	3594582	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021741	CAGCGT	2	12	3595793	3595804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021741	AGCGCC	2	12	3613398	3613409	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021741	AAATCG	2	12	3725557	3725568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021741	TATTGT	2	12	3757333	3757344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021741	TGATAT	2	12	3766786	3766797	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021741	CTTTGT	2	12	3792271	3792282	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021741	CTTAAA	2	12	3925415	3925426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021741	CAAGCT	2	12	3938705	3938716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021741	CAAGCT	2	12	3938983	3938994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021741	AAACTA	2	12	3953029	3953040	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021741	AGCGTT	2	12	3964091	3964102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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136	NC_021741	GACGGC	2	12	3983165	3983176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021741	GTCTTA	2	12	4078049	4078060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_021741	TGATTT	2	12	4099088	4099099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021741	CCCGCT	2	12	4121884	4121895	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021741	AGTATT	2	12	4122660	4122671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021741	AAAAAC	2	12	4175746	4175757	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_021741	TTCACC	2	12	4219471	4219482	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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146	NC_021741	TTGATT	2	12	4223352	4223363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021741	ATGCCA	2	12	4224028	4224039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_021741	AATAAA	2	12	4227526	4227537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.