MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis EAI5

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021740	GCCCTT	2	12	30990	31001	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021740	ACCGCG	2	12	31092	31103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021740	CGTCGG	2	12	66739	66750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021740	CAACGG	2	12	76224	76235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021740	TCACCT	2	12	80399	80410	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021740	TGGTCG	2	12	82853	82864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021740	ATGCGC	2	12	82964	82975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021740	GCACAT	2	12	83422	83433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021740	TCGGTG	2	12	104535	104546	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021740	GCGGTG	2	12	104746	104757	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021740	GACGCG	2	12	139191	139202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021740	CTCGGT	2	12	149378	149389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021740	CGGTGG	2	12	150268	150279	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021740	ACGGCG	2	12	150291	150302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021740	GCCGCG	2	12	180936	180947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021740	ACAGCC	2	12	218486	218497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021740	TGCACA	2	12	264131	264142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021740	CGCCAC	2	12	264789	264800	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021740	CCCCGA	2	12	293639	293650	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021740	AGATTC	2	12	330372	330383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021740	TGCCGC	2	12	336275	336286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021740	GGTCGC	2	12	342070	342081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021740	CACGAC	2	12	344046	344057	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021740	CGGCCT	2	12	344774	344785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021740	TGCCGG	2	12	366728	366739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021740	CCGATC	2	12	366841	366852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021740	CCGGTG	2	12	368371	368382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021740	TCCCGA	2	12	368564	368575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021740	GGTGTT	2	12	369381	369392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021740	GTGCTG	2	12	369502	369513	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021740	TGCCGA	2	12	369521	369532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021740	CCGGTG	2	12	369538	369549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021740	TGCCGA	2	12	369551	369562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021740	CCCGAT	2	12	373641	373652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021740	CCGCCA	2	12	375596	375607	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021740	TGCCGA	2	12	400706	400717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021740	CGCGGG	2	12	409627	409638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021740	CTGGGT	2	12	409895	409906	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021740	CGGTGT	2	12	410242	410253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021740	AGCCGA	2	12	424499	424510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021740	GGTGTT	2	12	425037	425048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021740	TGCCGG	2	12	425192	425203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021740	TGCCGG	2	12	425222	425233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021740	GTTTCC	2	12	425316	425327	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021740	TGCCGG	2	12	425348	425359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021740	TGCCGA	2	12	425363	425374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021740	GTTTCC	2	12	425376	425387	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021740	GCCGGC	2	12	425976	425987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021740	GATGGT	2	12	426285	426296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021740	TGCCGG	2	12	426590	426601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021740	TGCCGA	2	12	426605	426616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021740	TGCCGA	2	12	426635	426646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021740	TGCCGA	2	12	426761	426772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021740	TGCCGG	2	12	426806	426817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021740	GCCGAT	2	12	427104	427115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021740	TGCCGG	2	12	427673	427684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021740	CGGTAC	2	12	429116	429127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021740	TGCCGA	2	12	429830	429841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021740	TGCCGA	2	12	431237	431248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021740	GGTGTT	2	12	432399	432410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021740	TGCCGA	2	12	433736	433747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021740	GTTGCC	2	12	434013	434024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021740	GCCGCG	2	12	434131	434142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021740	CGGCCG	2	12	467805	467816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021740	CCGATA	2	12	476490	476501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021740	ATAGTC	2	12	542983	542994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021740	ACCAGT	2	12	591007	591018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021740	TGCCGA	2	12	607065	607076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021740	CGGGTG	2	12	623045	623056	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021740	ACGGCG	2	12	623450	623461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021740	CGGTGG	2	12	623955	623966	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021740	CGGCAG	2	12	624027	624038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021740	ACGGCG	2	12	624200	624211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021740	CGCCGT	2	12	719936	719947	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021740	CGCGGG	2	12	829832	829843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021740	CCGGCG	2	12	863169	863180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021740	ACCGGG	2	12	869890	869901	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021740	GCGGCC	2	12	906781	906792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021740	ACAGCA	2	12	908154	908165	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021740	CTGGGT	2	12	922993	923004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021740	CAGTCG	2	12	930731	930742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021740	TCGGGT	2	12	964230	964241	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021740	GCCGAT	2	12	968398	968409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021740	GTTGCC	2	12	976116	976127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021740	GCGGCC	2	12	976636	976647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021740	ACCGCG	2	12	988820	988831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021740	GCCTCG	2	12	989556	989567	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021740	CTCGGT	2	12	990545	990556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021740	ATCGAC	2	12	990840	990851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021740	GAGCGG	2	12	1022869	1022880	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021740	CAACGG	2	12	1028009	1028020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021740	GATCGA	2	12	1028060	1028071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021740	GACTGC	2	12	1032464	1032475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021740	CGCCGG	2	12	1051327	1051338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021740	CTACAA	2	12	1091177	1091188	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021740	GGCGCA	2	12	1093111	1093122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021740	CGGCCG	2	12	1119932	1119943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021740	GATGCC	2	12	1120314	1120325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021740	GATGCC	2	12	1120329	1120340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021740	GATGCC	2	12	1120344	1120355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021740	CAATGC	2	12	1122298	1122309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021740	TTCCGT	2	12	1161126	1161137	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021740	GTTGGC	2	12	1167689	1167700	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021740	TAGCCA	2	12	1194898	1194909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021740	AGTTAC	2	12	1220593	1220604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021740	CGTGGT	2	12	1230342	1230353	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021740	CCGGCG	2	12	1263376	1263387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021740	GCGGTG	2	12	1309754	1309765	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021740	GCGCGT	2	12	1310868	1310879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021740	AGGCCA	2	12	1339948	1339959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021740	TCGACA	2	12	1367399	1367410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021740	GGCCAG	2	12	1413684	1413695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021740	CCGAGT	2	12	1418478	1418489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021740	CACGCG	2	12	1523661	1523672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021740	ATATTC	2	12	1558688	1558699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021740	ACCCCG	2	12	1570560	1570571	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021740	GCCCCT	2	12	1631944	1631955	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021740	GCCCCT	2	12	1635546	1635557	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021740	GGTGGC	2	12	1695883	1695894	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021740	GGCGCC	2	12	1723694	1723705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021740	CTGGGC	2	12	1744231	1744242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021740	CGCCGG	2	12	1783590	1783601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021740	TCGGTG	2	12	1786565	1786576	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021740	GCGGTG	2	12	1786776	1786787	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021740	CGAGTG	2	12	1787405	1787416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021740	GGCGCC	2	12	1833630	1833641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021740	CCGCGG	2	12	1897344	1897355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021740	TAGCGG	2	12	1924449	1924460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021740	TCGTCA	2	12	1960190	1960201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021740	CGTCGC	2	12	1961354	1961365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021740	GCTGGG	2	12	1983354	1983365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021740	CACCAG	2	12	1992071	1992082	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021740	GGTTCG	2	12	1992660	1992671	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021740	GGTGAT	2	12	2036324	2036335	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021740	TTCGGC	2	12	2050233	2050244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021740	AGAGGG	2	12	2070414	2070425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021740	GCCGCA	2	12	2084002	2084013	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021740	ACCGTG	2	12	2136867	2136878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021740	TCGATG	2	12	2138016	2138027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_021740	GCTGGG	2	12	2139499	2139510	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_021740	GGCCCG	2	12	2153586	2153597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021740	CGCGAG	2	12	2171112	2171123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_021740	CGGCCA	2	12	2255426	2255437	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_021740	GGTTTC	2	12	2289216	2289227	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_021740	TCCCAT	2	12	2293776	2293787	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021740	CCGACT	2	12	2294051	2294062	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_021740	GTGAAA	2	12	2295518	2295529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021740	CACCGC	2	12	2295810	2295821	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_021740	GGTCCC	2	12	2300544	2300555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
160	NC_021740	CGATCG	2	12	2301452	2301463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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240	NC_021740	GCCGTT	2	12	3724542	3724553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_021740	CCCGAA	2	12	3727617	3727628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
242	NC_021740	AGGTTG	2	12	3727747	3727758	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_021740	TGCCGA	2	12	3729389	3729400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_021740	GCCCGC	2	12	3729777	3729788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
246	NC_021740	GGTGTT	2	12	3730800	3730811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021740	TGCCGG	2	12	3730985	3730996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_021740	AGGTTG	2	12	3731305	3731316	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021740	TCCCGG	2	12	3732800	3732811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
250	NC_021740	TGCCGG	2	12	3732830	3732841	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_021740	AACCCG	2	12	3733400	3733411	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
252	NC_021740	CAGCGG	2	12	3733680	3733691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_021740	GGTGTT	2	12	3734322	3734333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021740	TGCCGG	2	12	3734567	3734578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_021740	CCCGAT	2	12	3734649	3734660	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
256	NC_021740	CCGAAA	2	12	3734818	3734829	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_021740	ACCGCC	2	12	3735205	3735216	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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260	NC_021740	TGTACA	2	12	3780111	3780122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_021740	GAAGTC	2	12	3825404	3825415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_021740	TCCTCT	2	12	3861074	3861085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
263	NC_021740	ACCGCC	3	18	3864860	3864877	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_021740	CACCGA	2	12	3865076	3865087	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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268	NC_021740	CGGCCG	2	12	3906162	3906173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_021740	TGACGG	2	12	3920205	3920216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
270	NC_021740	GCGCCG	2	12	3920384	3920395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
271	NC_021740	TGGCGG	2	12	3920553	3920564	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
272	NC_021740	CGCCGG	2	12	3920997	3921008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_021740	GGCACC	2	12	3921175	3921186	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
274	NC_021740	CGCCGG	2	12	3921333	3921344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
275	NC_021740	CAACGG	2	12	3923392	3923403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_021740	CGAACA	2	12	3996066	3996077	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_021740	CCGGGT	2	12	4056403	4056414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_021740	GGCGAG	2	12	4090421	4090432	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
281	NC_021740	GTCGGA	2	12	4172718	4172729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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287	NC_021740	ACCGCG	2	12	4281625	4281636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.