MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 2006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	TCAAC	2	10	3163	3172	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021739	TAAAT	2	10	3257	3266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021739	ATTCA	2	10	9733	9742	40 %	40 %	0 %	20 %	525662566
4	NC_021739	CTGTA	2	10	9924	9933	20 %	40 %	20 %	20 %	525662566
5	NC_021739	AATAC	2	10	11477	11486	60 %	20 %	0 %	20 %	525662380
6	NC_021739	TGAAT	2	10	14771	14780	40 %	40 %	20 %	0 %	525662569
7	NC_021739	ATACC	2	10	15694	15703	40 %	20 %	0 %	40 %	525662569
8	NC_021739	AAATT	2	10	16507	16516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021739	ATTTT	2	10	16610	16619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021739	TTGGC	2	10	17387	17396	0 %	40 %	40 %	20 %	525662570
11	NC_021739	AGCTG	2	10	19595	19604	20 %	20 %	40 %	20 %	525662574
12	NC_021739	AAGTG	2	10	19898	19907	40 %	20 %	40 %	0 %	525662574
13	NC_021739	TTCAC	2	10	20568	20577	20 %	40 %	0 %	40 %	525662574
14	NC_021739	CTTAT	2	10	21040	21049	20 %	60 %	0 %	20 %	525662575
15	NC_021739	TTTTA	2	10	22287	22296	20 %	80 %	0 %	0 %	525662577
16	NC_021739	GTTTC	2	10	22616	22625	0 %	60 %	20 %	20 %	525662577
17	NC_021739	AATCC	2	10	24149	24158	40 %	20 %	0 %	40 %	525662578
18	NC_021739	GTTTC	2	10	24302	24311	0 %	60 %	20 %	20 %	525662578
19	NC_021739	GCAAC	2	10	25434	25443	40 %	0 %	20 %	40 %	525662580
20	NC_021739	GTGGC	2	10	27950	27959	0 %	20 %	60 %	20 %	525662582
21	NC_021739	TTAAA	2	10	33290	33299	60 %	40 %	0 %	0 %	525662584
22	NC_021739	AAACT	2	10	34286	34295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021739	CATTT	2	10	34630	34639	20 %	60 %	0 %	20 %	525662585
24	NC_021739	GTTTT	2	10	35064	35073	0 %	80 %	20 %	0 %	525662585
25	NC_021739	GTTTT	2	10	36775	36784	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021739	TTGCA	2	10	37987	37996	20 %	40 %	20 %	20 %	525662588
27	NC_021739	TAAAT	2	10	38084	38093	60 %	40 %	0 %	0 %	525662588
28	NC_021739	ATTAA	2	10	38479	38488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021739	CCAAG	2	10	40783	40792	40 %	0 %	20 %	40 %	525662591
30	NC_021739	CGTTT	2	10	42368	42377	0 %	60 %	20 %	20 %	525662592
31	NC_021739	AATGA	2	10	42565	42574	60 %	20 %	20 %	0 %	525662592
32	NC_021739	ACCCA	2	10	42853	42862	40 %	0 %	0 %	60 %	525662592
33	NC_021739	AATCA	2	10	44020	44029	60 %	20 %	0 %	20 %	525662593
34	NC_021739	AGCAC	2	10	46966	46975	40 %	0 %	20 %	40 %	525662596
35	NC_021739	TAAGT	2	10	47025	47034	40 %	40 %	20 %	0 %	525662596
36	NC_021739	TAAAA	2	10	47604	47613	80 %	20 %	0 %	0 %	525662596
37	NC_021739	ACATC	2	10	48295	48304	40 %	20 %	0 %	40 %	525662597
38	NC_021739	GTAAT	2	10	48346	48355	40 %	40 %	20 %	0 %	525662597
39	NC_021739	AAATT	2	10	48970	48979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021739	ATAGA	2	10	49176	49185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021739	CCGGC	2	10	49240	49249	0 %	0 %	40 %	60 %	525662598
42	NC_021739	ACCCA	2	10	52469	52478	40 %	0 %	0 %	60 %	525662600
43	NC_021739	TAAAT	2	10	54064	54073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021739	AAATC	2	10	54572	54581	60 %	20 %	0 %	20 %	525662601
45	NC_021739	TCCAA	2	10	55367	55376	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021739	ATACC	2	10	56664	56673	40 %	20 %	0 %	40 %	525662603
47	NC_021739	TTTGG	2	10	57358	57367	0 %	60 %	40 %	0 %	525662604
48	NC_021739	TACCG	2	10	57601	57610	20 %	20 %	20 %	40 %	525662604
49	NC_021739	TAAGA	2	10	57639	57648	60 %	20 %	20 %	0 %	525662604
50	NC_021739	TTTAA	2	10	59638	59647	40 %	60 %	0 %	0 %	525662605
51	NC_021739	TCAAA	2	10	60396	60405	60 %	20 %	0 %	20 %	525662607
52	NC_021739	AAATG	2	10	61510	61519	60 %	20 %	20 %	0 %	525662609
53	NC_021739	GTTTT	2	10	61962	61971	0 %	80 %	20 %	0 %	525662609
54	NC_021739	CATAA	2	10	62752	62761	60 %	20 %	0 %	20 %	525662609
55	NC_021739	ATCTC	2	10	63020	63029	20 %	40 %	0 %	40 %	525662609
56	NC_021739	AAATC	2	10	63275	63284	60 %	20 %	0 %	20 %	525662609
57	NC_021739	ATTTA	2	10	63961	63970	40 %	60 %	0 %	0 %	525662609
58	NC_021739	ATTGC	2	10	64728	64737	20 %	40 %	20 %	20 %	525662609
59	NC_021739	ATTGT	2	10	64801	64810	20 %	60 %	20 %	0 %	525662609
60	NC_021739	TGTAA	2	10	70388	70397	40 %	40 %	20 %	0 %	525662616
61	NC_021739	GGATA	2	10	73030	73039	40 %	20 %	40 %	0 %	525662618
62	NC_021739	ATTTA	2	10	74012	74021	40 %	60 %	0 %	0 %	525662619
63	NC_021739	AAAGT	2	10	74895	74904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021739	GCTTT	2	10	76420	76429	0 %	60 %	20 %	20 %	525662621
65	NC_021739	ACACC	2	10	78975	78984	40 %	0 %	0 %	60 %	525662624
66	NC_021739	TAGAA	2	10	82699	82708	60 %	20 %	20 %	0 %	525662630
67	NC_021739	CGGTA	2	10	83165	83174	20 %	20 %	40 %	20 %	525662631
68	NC_021739	CTTCA	2	10	83831	83840	20 %	40 %	0 %	40 %	525662631
69	NC_021739	ACCGA	2	10	84069	84078	40 %	0 %	20 %	40 %	525662631
70	NC_021739	TAAAA	2	10	85135	85144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021739	GATTG	2	10	86477	86486	20 %	40 %	40 %	0 %	525662633
72	NC_021739	TAAGC	2	10	88171	88180	40 %	20 %	20 %	20 %	525662636
73	NC_021739	AATTA	2	10	88313	88322	60 %	40 %	0 %	0 %	525662637
74	NC_021739	ACCAT	2	10	92821	92830	40 %	20 %	0 %	40 %	525662640
75	NC_021739	TATAA	2	10	93099	93108	60 %	40 %	0 %	0 %	525662640
76	NC_021739	ATTTT	2	10	93979	93988	20 %	80 %	0 %	0 %	525662641
77	NC_021739	AATAA	2	10	94351	94360	80 %	20 %	0 %	0 %	525662642
78	NC_021739	AATAG	2	10	95099	95108	60 %	20 %	20 %	0 %	525662643
79	NC_021739	TTAAT	2	10	95275	95284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021739	CGCTA	2	10	98340	98349	20 %	20 %	20 %	40 %	525662648
81	NC_021739	GGCAA	2	10	98529	98538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021739	TTTGA	2	10	98926	98935	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021739	ATAAA	2	10	99252	99261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021739	TCTAT	2	10	99373	99382	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021739	TGGTT	2	10	103433	103442	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021739	ATTTG	2	10	104415	104424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021739	AAATA	2	10	105599	105608	80 %	20 %	0 %	0 %	525662659
88	NC_021739	TTGTT	2	10	107368	107377	0 %	80 %	20 %	0 %	525662662
89	NC_021739	TTGGT	2	10	109053	109062	0 %	60 %	40 %	0 %	525662663
90	NC_021739	AACTG	2	10	110306	110315	40 %	20 %	20 %	20 %	525662665
91	NC_021739	TTAGC	2	10	113028	113037	20 %	40 %	20 %	20 %	525662668
92	NC_021739	TAGAT	2	10	113770	113779	40 %	40 %	20 %	0 %	525662668
93	NC_021739	TTAGA	2	10	114170	114179	40 %	40 %	20 %	0 %	525662669
94	NC_021739	ACGCT	2	10	114180	114189	20 %	20 %	20 %	40 %	525662669
95	NC_021739	AGTTA	2	10	114205	114214	40 %	40 %	20 %	0 %	525662669
96	NC_021739	GCACG	2	10	117709	117718	20 %	0 %	40 %	40 %	525662672
97	NC_021739	AACCC	2	10	118752	118761	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_021739	TCAAA	2	10	119506	119515	60 %	20 %	0 %	20 %	525662675
99	NC_021739	AAAAG	2	10	123269	123278	80 %	0 %	20 %	0 %	525662383
100	NC_021739	CACGA	2	10	123303	123312	40 %	0 %	20 %	40 %	525662383
101	NC_021739	AAATT	2	10	124457	124466	60 %	40 %	0 %	0 %	525662679
102	NC_021739	ATTCC	2	10	127780	127789	20 %	40 %	0 %	40 %	525662685
103	NC_021739	TGAAG	2	10	129244	129253	40 %	20 %	40 %	0 %	525662687
104	NC_021739	TTTCA	2	10	129889	129898	20 %	60 %	0 %	20 %	525662688
105	NC_021739	TCAAT	2	10	132248	132257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021739	GAAAA	2	10	133093	133102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021739	GTCCG	2	10	135555	135564	0 %	20 %	40 %	40 %	525662698
108	NC_021739	ATTTT	2	10	137622	137631	20 %	80 %	0 %	0 %	525662702
109	NC_021739	GCAAT	2	10	139068	139077	40 %	20 %	20 %	20 %	525662703
110	NC_021739	ATTCT	2	10	139236	139245	20 %	60 %	0 %	20 %	525662386
111	NC_021739	AGTTG	2	10	139525	139534	20 %	40 %	40 %	0 %	525662386
112	NC_021739	GGATT	2	10	141693	141702	20 %	40 %	40 %	0 %	525662707
113	NC_021739	AGAAA	2	10	141933	141942	80 %	0 %	20 %	0 %	525662707
114	NC_021739	CAAAC	2	10	144199	144208	60 %	0 %	0 %	40 %	525662391
115	NC_021739	TTTTG	2	10	144272	144281	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021739	GTGAT	2	10	144355	144364	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021739	GAGAA	2	10	144768	144777	60 %	0 %	40 %	0 %	525662392
118	NC_021739	AGGCG	2	10	146318	146327	20 %	0 %	60 %	20 %	525662393
119	NC_021739	ACAAA	2	10	149209	149218	80 %	0 %	0 %	20 %	525662712
120	NC_021739	AAATC	2	10	149871	149880	60 %	20 %	0 %	20 %	525662396
121	NC_021739	AGCCT	2	10	150005	150014	20 %	20 %	20 %	40 %	525662396
122	NC_021739	GGAAA	2	10	150201	150210	60 %	0 %	40 %	0 %	525662397
123	NC_021739	AATGG	2	10	153416	153425	40 %	20 %	40 %	0 %	525662716
124	NC_021739	CAAGA	2	10	154645	154654	60 %	0 %	20 %	20 %	525662718
125	NC_021739	GATTG	2	10	155343	155352	20 %	40 %	40 %	0 %	525662719
126	NC_021739	AATGC	2	10	160002	160011	40 %	20 %	20 %	20 %	525662400
127	NC_021739	TAAAT	2	10	161490	161499	60 %	40 %	0 %	0 %	525662723
128	NC_021739	CCCGA	2	10	162944	162953	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_021739	TACAA	2	10	167030	167039	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021739	GGTAA	2	10	168806	168815	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021739	ACTCA	2	10	169484	169493	40 %	20 %	0 %	40 %	525662724
132	NC_021739	TGTAG	2	10	169716	169725	20 %	40 %	40 %	0 %	525662724
133	NC_021739	ATTTT	2	10	170512	170521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021739	ATGGA	2	10	173050	173059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021739	TTTAA	2	10	173957	173966	40 %	60 %	0 %	0 %	525662729
136	NC_021739	AAATG	2	10	174184	174193	60 %	20 %	20 %	0 %	525662729
137	NC_021739	TTTAG	2	10	176171	176180	20 %	60 %	20 %	0 %	525662731
138	NC_021739	GGTTT	2	10	176702	176711	0 %	60 %	40 %	0 %	525662731
139	NC_021739	GAGCG	2	10	177861	177870	20 %	0 %	60 %	20 %	525662732
140	NC_021739	CAGTC	2	10	181018	181027	20 %	20 %	20 %	40 %	525662734
141	NC_021739	TCTTG	2	10	181629	181638	0 %	60 %	20 %	20 %	525662734
142	NC_021739	GACCT	2	10	182657	182666	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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152	NC_021739	TGATT	2	10	196659	196668	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021739	CAATG	2	10	198441	198450	40 %	20 %	20 %	20 %	525662749
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155	NC_021739	TACCG	2	10	201346	201355	20 %	20 %	20 %	40 %	525662752
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176	NC_021739	TTGAT	2	10	228255	228264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_021739	TGGTT	2	10	256440	256449	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
196	NC_021739	TATTT	2	10	258659	258668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_021739	TATTC	2	10	328572	328581	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_021739	GTTTA	2	10	343782	343791	20 %	60 %	20 %	0 %	525662852
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267	NC_021739	ACAAG	2	10	347512	347521	60 %	0 %	20 %	20 %	525662854
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384	NC_021739	CCTTA	2	10	498753	498762	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
385	NC_021739	AATTT	2	10	499535	499544	40 %	60 %	0 %	0 %	525662997
386	NC_021739	ATTCT	2	10	504600	504609	20 %	60 %	0 %	20 %	525663003
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393	NC_021739	TAGCG	2	10	513869	513878	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
394	NC_021739	AAATC	2	10	521222	521231	60 %	20 %	0 %	20 %	525663022
395	NC_021739	AAAAT	2	10	521756	521765	80 %	20 %	0 %	0 %	525663022
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397	NC_021739	TACCT	2	10	523113	523122	20 %	40 %	0 %	40 %	525663024
398	NC_021739	ATTCC	2	10	523303	523312	20 %	40 %	0 %	40 %	525663024
399	NC_021739	AAAAC	2	10	523727	523736	80 %	0 %	0 %	20 %	525663024
400	NC_021739	CCCTT	2	10	528881	528890	0 %	40 %	0 %	60 %	525663028
401	NC_021739	GGATT	2	10	529520	529529	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
402	NC_021739	AGCTA	2	10	531155	531164	40 %	20 %	20 %	20 %	525663030
403	NC_021739	CAAAA	2	10	531727	531736	80 %	0 %	0 %	20 %	525663030
404	NC_021739	AATTA	2	10	532964	532973	60 %	40 %	0 %	0 %	525663031
405	NC_021739	ACGGC	2	10	534998	535007	20 %	0 %	40 %	40 %	525663034
406	NC_021739	TGAAG	2	10	535830	535839	40 %	20 %	40 %	0 %	525663034
407	NC_021739	CGCCT	2	10	536853	536862	0 %	20 %	20 %	60 %	525663035
408	NC_021739	TTATA	2	10	537304	537313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_021739	TTTGG	2	10	537530	537539	0 %	60 %	40 %	0 %	525663036
410	NC_021739	GAATC	2	10	537630	537639	40 %	20 %	20 %	20 %	525663036
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431	NC_021739	AAAAG	2	10	569029	569038	80 %	0 %	20 %	0 %	525663056
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433	NC_021739	ATTGG	2	10	574453	574462	20 %	40 %	40 %	0 %	525663061
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437	NC_021739	GGCTA	2	10	578530	578539	20 %	20 %	40 %	20 %	525663064
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440	NC_021739	TGTGA	2	10	584011	584020	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
441	NC_021739	AAGTA	2	10	584693	584702	60 %	20 %	20 %	0 %	525663069
442	NC_021739	CCCCT	2	10	584850	584859	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
443	NC_021739	ATCAA	2	10	588522	588531	60 %	20 %	0 %	20 %	525663073
444	NC_021739	CCCTG	2	10	589293	589302	0 %	20 %	20 %	60 %	525663073
445	NC_021739	CCAAA	2	10	590052	590061	60 %	0 %	0 %	40 %	525663074
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451	NC_021739	TTGTA	2	10	601273	601282	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
452	NC_021739	TCGGG	2	10	605356	605365	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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467	NC_021739	ATTTT	2	10	632574	632583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021739	AACCG	2	10	634879	634888	40 %	0 %	20 %	40 %	525662475
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472	NC_021739	TAAAC	2	10	638239	638248	60 %	20 %	0 %	20 %	525663118
473	NC_021739	ATACA	2	10	639461	639470	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
474	NC_021739	TTTAG	2	10	640925	640934	20 %	60 %	20 %	0 %	525663121
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481	NC_021739	TCATT	2	10	650257	650266	20 %	60 %	0 %	20 %	525663128
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487	NC_021739	TGCCC	2	10	655325	655334	0 %	20 %	20 %	60 %	525663134
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493	NC_021739	GATTG	2	10	662296	662305	20 %	40 %	40 %	0 %	525663137
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497	NC_021739	TAAAA	2	10	665485	665494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_021739	TAAAA	2	10	665954	665963	80 %	20 %	0 %	0 %	525663142
499	NC_021739	AAAAT	2	10	666064	666073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_021739	GCTTT	2	10	670403	670412	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

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