MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 32614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	ATT	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021739	GAT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662556
3	NC_021739	ATC	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662556
4	NC_021739	GAT	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662556
5	NC_021739	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662556
6	NC_021739	ATT	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662556
7	NC_021739	TAG	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662556
8	NC_021739	TTG	2	6	618	623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662556
9	NC_021739	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662556
10	NC_021739	GCA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662556
11	NC_021739	ACA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662557
12	NC_021739	GAT	2	6	1449	1454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662558
13	NC_021739	ATT	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662558
14	NC_021739	TAC	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662558
15	NC_021739	AAG	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662559
16	NC_021739	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662559
17	NC_021739	TGG	2	6	1779	1784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662559
18	NC_021739	AGC	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662559
19	NC_021739	GAT	3	9	1984	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662559
20	NC_021739	GAG	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662559
21	NC_021739	TAC	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662559
22	NC_021739	CAC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662559
23	NC_021739	TGC	2	6	2303	2308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662559
24	NC_021739	GAA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662559
25	NC_021739	GAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662559
26	NC_021739	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662559
27	NC_021739	TGA	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662560
28	NC_021739	TTG	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662560
29	NC_021739	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662561
30	NC_021739	TGG	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021739	ATC	2	6	3141	3146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021739	TCC	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021739	CAT	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021739	ACT	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662562
35	NC_021739	CAT	3	9	3715	3723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662562
36	NC_021739	CGG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662562
37	NC_021739	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
38	NC_021739	ACC	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662562
39	NC_021739	AGG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662562
40	NC_021739	TTC	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662562
41	NC_021739	CTG	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662562
42	NC_021739	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662562
43	NC_021739	TGA	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662562
44	NC_021739	AGA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
45	NC_021739	TGG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662562
46	NC_021739	ATT	2	6	4536	4541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662562
47	NC_021739	ATT	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662562
48	NC_021739	AGA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
49	NC_021739	ATT	2	6	4714	4719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662562
50	NC_021739	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
51	NC_021739	ATC	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662562
52	NC_021739	ATG	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662562
53	NC_021739	CCT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525662562
54	NC_021739	TGA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662562
55	NC_021739	AAG	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
56	NC_021739	CAA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662562
57	NC_021739	TTG	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662562
58	NC_021739	ACC	2	6	5126	5131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662562
59	NC_021739	TAA	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662562
60	NC_021739	AAT	2	6	5389	5394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662562
61	NC_021739	CTA	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021739	ACA	2	6	5515	5520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021739	ACC	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021739	TTG	2	6	5608	5613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662563
65	NC_021739	AAT	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662563
66	NC_021739	AAT	2	6	5802	5807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662563
67	NC_021739	ATT	2	6	5856	5861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662563
68	NC_021739	TTA	2	6	6028	6033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662563
69	NC_021739	GAA	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662563
70	NC_021739	TCA	2	6	6183	6188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662563
71	NC_021739	GAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662563
72	NC_021739	ATA	2	6	6397	6402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662564
73	NC_021739	TCT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662564
74	NC_021739	AAT	2	6	6568	6573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662564
75	NC_021739	GAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662564
76	NC_021739	GAT	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662564
77	NC_021739	CTG	2	6	6803	6808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662564
78	NC_021739	ATT	2	6	6822	6827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662564
79	NC_021739	ATA	2	6	7040	7045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662564
80	NC_021739	TCA	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662564
81	NC_021739	AGA	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021739	TTA	2	6	7458	7463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021739	TTA	2	6	7478	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021739	AGA	2	6	7492	7497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021739	CAA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662565
86	NC_021739	GGT	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662565
87	NC_021739	TGA	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662565
88	NC_021739	TGT	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662565
89	NC_021739	CAG	2	6	7744	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662565
90	NC_021739	TCA	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662565
91	NC_021739	TAT	2	6	7838	7843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662565
92	NC_021739	CAA	2	6	7989	7994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662565
93	NC_021739	TGC	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662565
94	NC_021739	GAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662565
95	NC_021739	TAT	2	6	8364	8369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662565
96	NC_021739	TCT	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021739	CAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021739	TTA	2	6	8818	8823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021739	GAT	2	6	8856	8861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021739	ATT	2	6	8956	8961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662566
101	NC_021739	TCA	2	6	8978	8983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662566
102	NC_021739	TTG	2	6	8998	9003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662566
103	NC_021739	ATA	2	6	9129	9134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662566
104	NC_021739	ATC	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662566
105	NC_021739	TTC	2	6	9213	9218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662566
106	NC_021739	ATA	2	6	9310	9315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662566
107	NC_021739	ATC	2	6	9493	9498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662566
108	NC_021739	GAC	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662566
109	NC_021739	AAT	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662566
110	NC_021739	TGC	2	6	9658	9663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662566
111	NC_021739	GTG	3	9	9690	9698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662566
112	NC_021739	TAT	2	6	9711	9716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662566
113	NC_021739	CTG	2	6	9970	9975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662566
114	NC_021739	AGA	2	6	10045	10050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662566
115	NC_021739	TCA	2	6	10116	10121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662566
116	NC_021739	TAA	2	6	10131	10136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662567
117	NC_021739	TCA	2	6	10165	10170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662567
118	NC_021739	GTA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662567
119	NC_021739	AAT	2	6	10306	10311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662567
120	NC_021739	ATT	3	9	10420	10428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662567
121	NC_021739	GTA	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021739	CCG	2	6	10760	10765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_021739	CAC	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_021739	TAT	2	6	10844	10849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021739	AAT	2	6	10934	10939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021739	TTA	2	6	10959	10964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021739	TTA	2	6	11013	11018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021739	TAT	2	6	11034	11039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021739	ATC	3	9	11146	11154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662380
130	NC_021739	GCA	2	6	11204	11209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662380
131	NC_021739	GGT	2	6	11356	11361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662380
132	NC_021739	CGG	2	6	11468	11473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662380
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259	NC_021739	TGA	2	6	21729	21734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662576
260	NC_021739	GCT	2	6	21824	21829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662576
261	NC_021739	TCT	2	6	21920	21925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662576
262	NC_021739	TAA	2	6	22245	22250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662577
263	NC_021739	GTA	2	6	22279	22284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662577
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271	NC_021739	CGT	2	6	22780	22785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662577
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274	NC_021739	TGA	2	6	22892	22897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662577
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279	NC_021739	GGT	2	6	23331	23336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662577
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288	NC_021739	AAT	2	6	23890	23895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021739	CAA	2	6	23996	24001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662578
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362	NC_021739	TCG	2	6	29826	29831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662582
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375	NC_021739	AAG	2	6	30657	30662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
376	NC_021739	ATT	2	6	30771	30776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662583
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