MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	CAAATA	2	12	16628	16639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021738	TCAGCA	2	12	35688	35699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021738	AACGGT	2	12	69572	69583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021738	AATAGT	2	12	101584	101595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021738	TAATCT	2	12	154403	154414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021738	GATATA	2	12	154511	154522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021738	AAAAGT	2	12	194933	194944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021738	TATTAA	2	12	298084	298095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021738	TTGAGC	2	12	310461	310472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021738	AAAAAT	2	12	321935	321946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021738	TATTTT	2	12	321977	321988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021738	TTTTCA	2	12	395282	395293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021738	GTAATC	2	12	457602	457613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021738	CTAAAT	2	12	466018	466029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021738	CTGATA	2	12	468319	468330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021738	ATGTTT	2	12	477810	477821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021738	AAAAGT	2	12	492820	492831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021738	CTGTTG	2	12	501129	501140	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021738	TTTTAT	2	12	514897	514908	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021738	AAAAAT	2	12	557851	557862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021738	TCTGTT	2	12	564005	564016	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021738	TAAAGA	2	12	581037	581048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021738	TCTTTA	2	12	582161	582172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021738	AAAATA	2	12	585552	585563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021738	AAAACA	2	12	585623	585634	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021738	TTTTAC	2	12	597094	597105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021738	AAATTT	2	12	629796	629807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021738	TTTTCA	2	12	666972	666983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021738	TTTACG	2	12	689171	689182	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021738	TTTTGC	2	12	699252	699263	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021738	ATTTCA	2	12	700473	700484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021738	GCCTTC	2	12	703787	703798	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021738	AATTAA	2	12	704576	704587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021738	AAAAAC	2	12	704786	704797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021738	TCTATT	2	12	749699	749710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021738	TTTTAT	2	12	753615	753626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021738	AAAATT	2	12	772989	773000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021738	TTTTCG	2	12	781028	781039	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021738	TTTTAT	2	12	825599	825610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021738	ATACAT	2	12	877344	877355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021738	GATAAA	2	12	949448	949459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021738	AGTTTA	2	12	998541	998552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021738	AATGAA	2	12	1016375	1016386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021738	AGTGAC	2	12	1030037	1030048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021738	CCTGAA	2	12	1051698	1051709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021738	CACAAA	2	12	1053448	1053459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021738	TGCTAC	2	12	1063388	1063399	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021738	GCTCTT	2	12	1075938	1075949	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021738	AAAAGC	2	12	1076005	1076016	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021738	TCTCGT	2	12	1126701	1126712	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021738	TAAAAG	2	12	1136307	1136318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021738	CTTGAA	2	12	1161593	1161604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021738	TATAAA	2	12	1204173	1204184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021738	ATTTTA	2	12	1207913	1207924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021738	CCGAAA	2	12	1207981	1207992	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021738	GCGATT	2	12	1208076	1208087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021738	TTTTGC	2	12	1236142	1236153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021738	ATTTCA	2	12	1237363	1237374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021738	GCCTTC	2	12	1240793	1240804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021738	AATTAA	2	12	1241582	1241593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021738	GCTTTC	2	12	1249949	1249960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021738	TCTTAT	2	12	1253663	1253674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021738	CTAATA	2	12	1253757	1253768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021738	TTCAAC	2	12	1272831	1272842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021738	ACTTTA	2	12	1298618	1298629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021738	CTATAA	2	12	1309672	1309683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021738	ACGGCT	2	12	1319841	1319852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021738	CGTTGC	2	12	1320347	1320358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021738	TTCGAT	2	12	1336476	1336487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021738	ATTTCA	2	12	1345985	1345996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021738	GCCTTC	2	12	1349299	1349310	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021738	AATTAA	2	12	1350088	1350099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021738	AAAAAC	2	12	1350298	1350309	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021738	ACGAAA	2	12	1363504	1363515	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021738	CGCCAT	2	12	1364658	1364669	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021738	ATTTCA	2	12	1404731	1404742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021738	GCCTTC	2	12	1408045	1408056	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021738	AATTAA	2	12	1408834	1408845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021738	ACGAAA	2	12	1434316	1434327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021738	TTTTGC	2	12	1434784	1434795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021738	ATTTCA	2	12	1436004	1436015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021738	GCCTTC	2	12	1439433	1439444	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021738	AATTAA	2	12	1440222	1440233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021738	TTTAAA	2	12	1443491	1443502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021738	CTATTC	2	12	1448077	1448088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021738	ATTGAA	2	12	1464503	1464514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021738	ATAAAA	2	12	1464557	1464568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021738	CAAAAA	2	12	1473895	1473906	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021738	CGAAAA	2	12	1479579	1479590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021738	AATTTT	2	12	1503665	1503676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021738	ATAATT	2	12	1518278	1518289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021738	ATTTAA	2	12	1551590	1551601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021738	TGATTT	2	12	1563222	1563233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021738	TGATTT	2	12	1595861	1595872	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021738	CTTTTA	2	12	1651799	1651810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021738	TTAAAC	2	12	1657605	1657616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021738	TTTTAT	2	12	1692576	1692587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021738	GCTTTT	2	12	1698874	1698885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021738	TGAAAG	2	12	1757448	1757459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021738	TAAAAA	2	12	1760732	1760743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021738	CTATTG	2	12	1788572	1788583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021738	AATATT	2	12	1805439	1805450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021738	TATTTA	2	12	1814965	1814976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021738	AATTTG	2	12	1832293	1832304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021738	ATACAA	2	12	1834495	1834506	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021738	CAAATA	2	12	1868648	1868659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021738	AATTGA	2	12	1917306	1917317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021738	TAATGA	2	12	1917406	1917417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021738	TTAATT	2	12	1927281	1927292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021738	CGAAGG	2	12	1928069	1928080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021738	AAGCGA	2	12	1929053	1929064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021738	TGAAAT	2	12	1931501	1931512	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021738	AAGCAA	2	12	1932720	1932731	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021738	TGAGAA	2	12	1968921	1968932	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021738	CACCAA	2	12	1982262	1982273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021738	AAATGA	2	12	2034379	2034390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021738	ACTCAC	2	12	2036196	2036207	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021738	TCTCTT	2	12	2037718	2037729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021738	GAAGAC	2	12	2039391	2039402	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021738	TAATCA	2	12	2044074	2044085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021738	TTGCAT	2	12	2069603	2069614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021738	TAGAAA	2	12	2078441	2078452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021738	GAAGAT	2	12	2094321	2094332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021738	TTTTTA	2	12	2146809	2146820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021738	AATTGT	2	12	2146849	2146860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021738	TCAAAG	2	12	2163655	2163666	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021738	TTGATC	2	12	2309003	2309014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021738	GGATAA	2	12	2324151	2324162	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021738	GGCAAA	2	12	2352904	2352915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021738	ATTGAA	2	12	2363023	2363034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021738	GCCTTA	2	12	2402694	2402705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021738	TTTGTG	2	12	2423980	2423991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021738	GCGTTT	2	12	2484945	2484956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021738	GAAATG	2	12	2491164	2491175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.