MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB0715 plasmid pBJAB0715

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021734	AATC	2	8	160	167	50 %	25 %	0 %	25 %	523532971
2	NC_021734	TTAA	2	8	471	478	50 %	50 %	0 %	0 %	523532971
3	NC_021734	TCTT	2	8	506	513	0 %	75 %	0 %	25 %	523532971
4	NC_021734	CATT	2	8	688	695	25 %	50 %	0 %	25 %	523532971
5	NC_021734	ATTA	2	8	1045	1052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021734	TCTT	2	8	1353	1360	0 %	75 %	0 %	25 %	523532972
7	NC_021734	AAAT	2	8	1511	1518	75 %	25 %	0 %	0 %	523532972
8	NC_021734	CAAT	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	523532972
9	NC_021734	AGCA	2	8	1572	1579	50 %	0 %	25 %	25 %	523532972
10	NC_021734	AATC	2	8	2145	2152	50 %	25 %	0 %	25 %	523532973
11	NC_021734	TTAA	2	8	2456	2463	50 %	50 %	0 %	0 %	523532973
12	NC_021734	TCTT	2	8	2491	2498	0 %	75 %	0 %	25 %	523532973
13	NC_021734	CATT	2	8	2673	2680	25 %	50 %	0 %	25 %	523532973
14	NC_021734	ATTA	2	8	3030	3037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021734	TCAT	2	8	3123	3130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021734	TTTA	2	8	3155	3162	25 %	75 %	0 %	0 %	523532974
17	NC_021734	AAAT	2	8	3390	3397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021734	CCTA	2	8	3698	3705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021734	AATT	2	8	5358	5365	50 %	50 %	0 %	0 %	523532978
20	NC_021734	AATG	2	8	5438	5445	50 %	25 %	25 %	0 %	523532979
21	NC_021734	ATTT	2	8	5961	5968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021734	TAAT	2	8	6102	6109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021734	TCAT	2	8	6260	6267	25 %	50 %	0 %	25 %	523532980
24	NC_021734	TTAA	2	8	6847	6854	50 %	50 %	0 %	0 %	523532980
25	NC_021734	AAGG	2	8	6952	6959	50 %	0 %	50 %	0 %	523532980
26	NC_021734	AAGC	2	8	7157	7164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021734	TTCC	2	8	7470	7477	0 %	50 %	0 %	50 %	523532981
28	NC_021734	GGTC	2	8	7730	7737	0 %	25 %	50 %	25 %	523532981
29	NC_021734	TGAC	2	8	9227	9234	25 %	25 %	25 %	25 %	523532982
30	NC_021734	GACA	2	8	9672	9679	50 %	0 %	25 %	25 %	523532983
31	NC_021734	GAAA	2	8	11074	11081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021734	AAAC	2	8	11210	11217	75 %	0 %	0 %	25 %	523532984
33	NC_021734	TGGG	2	8	11297	11304	0 %	25 %	75 %	0 %	523532984
34	NC_021734	AGCA	2	8	11436	11443	50 %	0 %	25 %	25 %	523532984
35	NC_021734	TCAT	2	8	12729	12736	25 %	50 %	0 %	25 %	523532985
36	NC_021734	GTCA	2	8	12939	12946	25 %	25 %	25 %	25 %	523532985
37	NC_021734	CAAG	2	8	13034	13041	50 %	0 %	25 %	25 %	523532985
38	NC_021734	AAGA	2	8	13684	13691	75 %	0 %	25 %	0 %	523532987
39	NC_021734	TGAG	2	8	14550	14557	25 %	25 %	50 %	0 %	523532987
40	NC_021734	ACAA	2	8	14818	14825	75 %	0 %	0 %	25 %	523532988
41	NC_021734	ACAA	2	8	14866	14873	75 %	0 %	0 %	25 %	523532988
42	NC_021734	AGAT	2	8	15081	15088	50 %	25 %	25 %	0 %	523532988
43	NC_021734	AGAA	2	8	15166	15173	75 %	0 %	25 %	0 %	523532988
44	NC_021734	CAGA	2	8	15776	15783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021734	AACG	2	8	17177	17184	50 %	0 %	25 %	25 %	523532990
46	NC_021734	TGCC	2	8	17455	17462	0 %	25 %	25 %	50 %	523532990
47	NC_021734	CATT	2	8	18376	18383	25 %	50 %	0 %	25 %	523532991
48	NC_021734	AAAG	2	8	19100	19107	75 %	0 %	25 %	0 %	523532991
49	NC_021734	TTAA	2	8	19455	19462	50 %	50 %	0 %	0 %	523532991
50	NC_021734	CAGC	2	8	21194	21201	25 %	0 %	25 %	50 %	523532993
51	NC_021734	CGCT	2	8	21780	21787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021734	CGCC	2	8	22014	22021	0 %	0 %	25 %	75 %	523532994
53	NC_021734	AAGA	2	8	22055	22062	75 %	0 %	25 %	0 %	523532994
54	NC_021734	CGGG	2	8	22352	22359	0 %	0 %	75 %	25 %	523532994
55	NC_021734	TTGC	2	8	22825	22832	0 %	50 %	25 %	25 %	523532994
56	NC_021734	TCCT	2	8	23021	23028	0 %	50 %	0 %	50 %	523532994
57	NC_021734	TCAG	2	8	24265	24272	25 %	25 %	25 %	25 %	523532996
58	NC_021734	CGCT	2	8	24389	24396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021734	TTTC	2	8	24410	24417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021734	AGCG	2	8	24483	24490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021734	CACC	2	8	24855	24862	25 %	0 %	0 %	75 %	523532997
62	NC_021734	CGAA	2	8	24955	24962	50 %	0 %	25 %	25 %	523532997
63	NC_021734	CAGC	2	8	25025	25032	25 %	0 %	25 %	50 %	523532997
64	NC_021734	AGCT	2	8	26070	26077	25 %	25 %	25 %	25 %	523532999
65	NC_021734	ATTA	2	8	26259	26266	50 %	50 %	0 %	0 %	523533000
66	NC_021734	CAAA	2	8	26319	26326	75 %	0 %	0 %	25 %	523533001
67	NC_021734	AGAT	2	8	26459	26466	50 %	25 %	25 %	0 %	523533001
68	NC_021734	TAAA	2	8	27816	27823	75 %	25 %	0 %	0 %	523533001
69	NC_021734	TCAG	2	8	27851	27858	25 %	25 %	25 %	25 %	523533001
70	NC_021734	AATT	2	8	28818	28825	50 %	50 %	0 %	0 %	523533003
71	NC_021734	AATT	2	8	28913	28920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021734	TCAA	2	8	29380	29387	50 %	25 %	0 %	25 %	523533004
73	NC_021734	TTTA	2	8	29496	29503	25 %	75 %	0 %	0 %	523533004
74	NC_021734	GGCT	2	8	29623	29630	0 %	25 %	50 %	25 %	523533004
75	NC_021734	TGAA	2	8	29638	29645	50 %	25 %	25 %	0 %	523533004
76	NC_021734	GATC	2	8	29660	29667	25 %	25 %	25 %	25 %	523533004
77	NC_021734	GATC	2	8	30529	30536	25 %	25 %	25 %	25 %	523533004
78	NC_021734	TCAG	2	8	30712	30719	25 %	25 %	25 %	25 %	523533004
79	NC_021734	ATAC	2	8	31805	31812	50 %	25 %	0 %	25 %	523533004
80	NC_021734	AAAT	2	8	31873	31880	75 %	25 %	0 %	0 %	523533004
81	NC_021734	AAGC	2	8	32010	32017	50 %	0 %	25 %	25 %	523533004
82	NC_021734	TGCA	2	8	32074	32081	25 %	25 %	25 %	25 %	523533004
83	NC_021734	TGTA	2	8	32552	32559	25 %	50 %	25 %	0 %	523533004
84	NC_021734	GATC	2	8	33502	33509	25 %	25 %	25 %	25 %	523533005
85	NC_021734	GATC	2	8	33832	33839	25 %	25 %	25 %	25 %	523533005
86	NC_021734	ATCA	2	8	33893	33900	50 %	25 %	0 %	25 %	523533005
87	NC_021734	GCTT	2	8	34107	34114	0 %	50 %	25 %	25 %	523533005
88	NC_021734	TTAA	2	8	34287	34294	50 %	50 %	0 %	0 %	523533005
89	NC_021734	ATTA	2	8	34304	34311	50 %	50 %	0 %	0 %	523533005
90	NC_021734	TTGA	2	8	34946	34953	25 %	50 %	25 %	0 %	523533005
91	NC_021734	TTCG	2	8	35054	35061	0 %	50 %	25 %	25 %	523533006
92	NC_021734	TTTA	2	8	36150	36157	25 %	75 %	0 %	0 %	523533007
93	NC_021734	TCAA	2	8	36397	36404	50 %	25 %	0 %	25 %	523533007
94	NC_021734	TTGG	2	8	36978	36985	0 %	50 %	50 %	0 %	523533008
95	NC_021734	TTTA	2	8	36989	36996	25 %	75 %	0 %	0 %	523533008
96	NC_021734	TATT	2	8	37176	37183	25 %	75 %	0 %	0 %	523533008
97	NC_021734	TGTA	2	8	37640	37647	25 %	50 %	25 %	0 %	523533009
98	NC_021734	GTTG	2	8	38528	38535	0 %	50 %	50 %	0 %	523533011
99	NC_021734	ATTG	2	8	38860	38867	25 %	50 %	25 %	0 %	523533013
100	NC_021734	AAAG	2	8	39966	39973	75 %	0 %	25 %	0 %	523533013
101	NC_021734	TAAG	2	8	40262	40269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021734	TTCC	2	8	40516	40523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021734	GGTT	2	8	40549	40556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021734	GAAG	2	8	40661	40668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021734	TAAT	2	8	40793	40800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021734	TAAT	2	8	40808	40815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021734	AATC	2	8	40966	40973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021734	ACTG	2	8	41024	41031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021734	AGGT	2	8	41282	41289	25 %	25 %	50 %	0 %	523533014
110	NC_021734	TAAT	2	8	41354	41361	50 %	50 %	0 %	0 %	523533014
111	NC_021734	CAAA	2	8	41717	41724	75 %	0 %	0 %	25 %	523533015
112	NC_021734	AAGC	2	8	41841	41848	50 %	0 %	25 %	25 %	523533015
113	NC_021734	GGAA	2	8	42600	42607	50 %	0 %	50 %	0 %	523533017
114	NC_021734	AACA	2	8	42734	42741	75 %	0 %	0 %	25 %	523533017
115	NC_021734	AGCA	2	8	42963	42970	50 %	0 %	25 %	25 %	523533017
116	NC_021734	ACTA	2	8	43439	43446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021734	ATGA	2	8	43878	43885	50 %	25 %	25 %	0 %	523533018
118	NC_021734	TGTA	2	8	44649	44656	25 %	50 %	25 %	0 %	523533019
119	NC_021734	ATTC	2	8	44848	44855	25 %	50 %	0 %	25 %	523533019
120	NC_021734	TTGC	2	8	44945	44952	0 %	50 %	25 %	25 %	523533019
121	NC_021734	TTCA	2	8	45534	45541	25 %	50 %	0 %	25 %	523533020
122	NC_021734	ACGA	2	8	45820	45827	50 %	0 %	25 %	25 %	523533021
123	NC_021734	TGGA	2	8	46067	46074	25 %	25 %	50 %	0 %	523533021
124	NC_021734	TGAA	2	8	46076	46083	50 %	25 %	25 %	0 %	523533021
125	NC_021734	TCAA	2	8	46553	46560	50 %	25 %	0 %	25 %	523533021
126	NC_021734	AAAT	2	8	47787	47794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021734	CAGT	2	8	50360	50367	25 %	25 %	25 %	25 %	523533027
128	NC_021734	AAAT	2	8	50398	50405	75 %	25 %	0 %	0 %	523533027
129	NC_021734	TCAA	2	8	50639	50646	50 %	25 %	0 %	25 %	523533027
130	NC_021734	ATTC	2	8	50745	50752	25 %	50 %	0 %	25 %	523533027
131	NC_021734	TGAC	2	8	51008	51015	25 %	25 %	25 %	25 %	523533027
132	NC_021734	GCTT	2	8	51313	51320	0 %	50 %	25 %	25 %	523533028
133	NC_021734	TAAA	2	8	51442	51449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021734	ACCA	2	8	51927	51934	50 %	0 %	0 %	50 %	523533030
135	NC_021734	TGGA	2	8	52122	52129	25 %	25 %	50 %	0 %	523533030

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.