MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p3BJAB0868

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021732	GAAT	2	8	665	672	50 %	25 %	25 %	0 %	523529101
2	NC_021732	TGGC	2	8	714	721	0 %	25 %	50 %	25 %	523529101
3	NC_021732	GAAA	2	8	738	745	75 %	0 %	25 %	0 %	523529101
4	NC_021732	TAGT	2	8	1018	1025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021732	GCTG	2	8	1231	1238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021732	GCCA	2	8	2479	2486	25 %	0 %	25 %	50 %	523529102
7	NC_021732	GCGA	2	8	3292	3299	25 %	0 %	50 %	25 %	523529103
8	NC_021732	CTTC	2	8	3716	3723	0 %	50 %	0 %	50 %	523529104
9	NC_021732	TGGC	2	8	3728	3735	0 %	25 %	50 %	25 %	523529104
10	NC_021732	ATTC	2	8	4146	4153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021732	AGCC	2	8	4568	4575	25 %	0 %	25 %	50 %	523529105
12	NC_021732	GGCT	2	8	5162	5169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021732	ATCC	2	8	5311	5318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021732	GCCG	2	8	5667	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	523529106
15	NC_021732	CAAA	2	8	6783	6790	75 %	0 %	0 %	25 %	523529107
16	NC_021732	GCAA	2	8	7354	7361	50 %	0 %	25 %	25 %	523529107
17	NC_021732	CGCT	2	8	7405	7412	0 %	25 %	25 %	50 %	523529107
18	NC_021732	TGAC	2	8	8276	8283	25 %	25 %	25 %	25 %	523529107
19	NC_021732	TGGA	2	8	8516	8523	25 %	25 %	50 %	0 %	523529108
20	NC_021732	CTGG	2	8	9287	9294	0 %	25 %	50 %	25 %	523529108
21	NC_021732	GCCA	2	8	9339	9346	25 %	0 %	25 %	50 %	523529108
22	NC_021732	ATTC	2	8	9924	9931	25 %	50 %	0 %	25 %	523529109
23	NC_021732	ATGC	2	8	10767	10774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021732	GTGG	2	8	12306	12313	0 %	25 %	75 %	0 %	523529111
25	NC_021732	TAAA	2	8	12744	12751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021732	AACC	2	8	13126	13133	50 %	0 %	0 %	50 %	523529112
27	NC_021732	ATTA	2	8	14251	14258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021732	AAGA	2	8	14455	14462	75 %	0 %	25 %	0 %	523529113
29	NC_021732	ATTG	2	8	14917	14924	25 %	50 %	25 %	0 %	523529113
30	NC_021732	GATT	2	8	14952	14959	25 %	50 %	25 %	0 %	523529113
31	NC_021732	TTTG	2	8	14976	14983	0 %	75 %	25 %	0 %	523529113
32	NC_021732	TTGG	2	8	15209	15216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021732	GGAA	2	8	15537	15544	50 %	0 %	50 %	0 %	523529114
34	NC_021732	CCGA	2	8	15658	15665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021732	TAAG	2	8	15768	15775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021732	ACCA	2	8	15782	15789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021732	CTTT	2	8	16119	16126	0 %	75 %	0 %	25 %	523529115
38	NC_021732	CCAG	2	8	16150	16157	25 %	0 %	25 %	50 %	523529115
39	NC_021732	CAGC	2	8	16655	16662	25 %	0 %	25 %	50 %	523529115
40	NC_021732	GATT	2	8	18218	18225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021732	ATTG	2	8	18314	18321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021732	TTGA	2	8	18325	18332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021732	CATA	2	8	18987	18994	50 %	25 %	0 %	25 %	523529118
44	NC_021732	CAAT	2	8	19029	19036	50 %	25 %	0 %	25 %	523529118
45	NC_021732	GCTG	2	8	19484	19491	0 %	25 %	50 %	25 %	523529120

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.