MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p2BJAB07104

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021728	GCTG	2	8	102	109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021728	GCCA	2	8	1350	1357	25 %	0 %	25 %	50 %	523525243
3	NC_021728	GCGA	2	8	2163	2170	25 %	0 %	50 %	25 %	523525244
4	NC_021728	CTTC	2	8	2587	2594	0 %	50 %	0 %	50 %	523525245
5	NC_021728	TGGC	2	8	2599	2606	0 %	25 %	50 %	25 %	523525245
6	NC_021728	ATTC	2	8	3017	3024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021728	AGCC	2	8	3439	3446	25 %	0 %	25 %	50 %	523525246
8	NC_021728	GGCT	2	8	4033	4040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021728	ATCC	2	8	4182	4189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021728	GCCG	2	8	4538	4545	0 %	0 %	50 %	50 %	523525247
11	NC_021728	CAAA	2	8	5654	5661	75 %	0 %	0 %	25 %	523525248
12	NC_021728	GCAA	2	8	6225	6232	50 %	0 %	25 %	25 %	523525248
13	NC_021728	CGCT	2	8	6276	6283	0 %	25 %	25 %	50 %	523525248
14	NC_021728	TGAC	2	8	7147	7154	25 %	25 %	25 %	25 %	523525248
15	NC_021728	TGGA	2	8	7387	7394	25 %	25 %	50 %	0 %	523525249
16	NC_021728	CTGG	2	8	8158	8165	0 %	25 %	50 %	25 %	523525249
17	NC_021728	GCCA	2	8	8210	8217	25 %	0 %	25 %	50 %	523525249
18	NC_021728	ATTC	2	8	8795	8802	25 %	50 %	0 %	25 %	523525250
19	NC_021728	ATGC	2	8	9638	9645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021728	GTGG	2	8	11177	11184	0 %	25 %	75 %	0 %	523525252
21	NC_021728	TAAA	2	8	11615	11622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021728	AACC	2	8	11997	12004	50 %	0 %	0 %	50 %	523525253
23	NC_021728	ATTA	2	8	13122	13129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021728	AAGA	2	8	13326	13333	75 %	0 %	25 %	0 %	523525254
25	NC_021728	ATTG	2	8	13788	13795	25 %	50 %	25 %	0 %	523525254
26	NC_021728	GATT	2	8	13823	13830	25 %	50 %	25 %	0 %	523525254
27	NC_021728	TTTG	2	8	13847	13854	0 %	75 %	25 %	0 %	523525254
28	NC_021728	TTGG	2	8	14080	14087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021728	GGAA	2	8	14408	14415	50 %	0 %	50 %	0 %	523525255
30	NC_021728	CCGA	2	8	14529	14536	25 %	0 %	25 %	50 %	523525255
31	NC_021728	TAAG	2	8	14639	14646	50 %	25 %	25 %	0 %	523525255
32	NC_021728	ACCA	2	8	14653	14660	50 %	0 %	0 %	50 %	523525255
33	NC_021728	CTTT	2	8	14990	14997	0 %	75 %	0 %	25 %	523525256
34	NC_021728	CCAG	2	8	15021	15028	25 %	0 %	25 %	50 %	523525256
35	NC_021728	CAGC	2	8	15526	15533	25 %	0 %	25 %	50 %	523525256
36	NC_021728	GATT	2	8	17089	17096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021728	ATTG	2	8	17185	17192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021728	TTGA	2	8	17196	17203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021728	CATA	2	8	17858	17865	50 %	25 %	0 %	25 %	523525259
40	NC_021728	CAAT	2	8	17900	17907	50 %	25 %	0 %	25 %	523525259
41	NC_021728	GCTG	2	8	18355	18362	0 %	25 %	50 %	25 %	523525261
42	NC_021728	GAAT	2	8	19675	19682	50 %	25 %	25 %	0 %	523525262
43	NC_021728	TGGC	2	8	19724	19731	0 %	25 %	50 %	25 %	523525262
44	NC_021728	GAAA	2	8	19748	19755	75 %	0 %	25 %	0 %	523525262
45	NC_021728	TAGT	2	8	20028	20035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.