MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021727	GCAA	2	8	213	220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021727	CCAA	2	8	436	443	50 %	0 %	0 %	50 %	523525147
3	NC_021727	CCAA	2	8	731	738	50 %	0 %	0 %	50 %	523525148
4	NC_021727	CAAC	2	8	958	965	50 %	0 %	0 %	50 %	523525149
5	NC_021727	TAAT	2	8	1204	1211	50 %	50 %	0 %	0 %	523525149
6	NC_021727	TAAA	2	8	1274	1281	75 %	25 %	0 %	0 %	523525149
7	NC_021727	TCAA	2	8	1511	1518	50 %	25 %	0 %	25 %	523525150
8	NC_021727	TATC	2	8	1722	1729	25 %	50 %	0 %	25 %	523525150
9	NC_021727	AATA	2	8	1768	1775	75 %	25 %	0 %	0 %	523525150
10	NC_021727	AATT	2	8	2089	2096	50 %	50 %	0 %	0 %	523525151
11	NC_021727	TTCA	2	8	2203	2210	25 %	50 %	0 %	25 %	523525151
12	NC_021727	TAAA	2	8	2523	2530	75 %	25 %	0 %	0 %	523525151
13	NC_021727	TGGC	2	8	2706	2713	0 %	25 %	50 %	25 %	523525152
14	NC_021727	CAAG	2	8	3149	3156	50 %	0 %	25 %	25 %	523525153
15	NC_021727	TTTG	2	8	3624	3631	0 %	75 %	25 %	0 %	523525154
16	NC_021727	ATTG	2	8	3775	3782	25 %	50 %	25 %	0 %	523525154
17	NC_021727	AATA	2	8	4199	4206	75 %	25 %	0 %	0 %	523525155
18	NC_021727	AAGA	2	8	4209	4216	75 %	0 %	25 %	0 %	523525155
19	NC_021727	CATT	2	8	4418	4425	25 %	50 %	0 %	25 %	523525156
20	NC_021727	TATT	2	8	4744	4751	25 %	75 %	0 %	0 %	523525157
21	NC_021727	AGTT	2	8	5016	5023	25 %	50 %	25 %	0 %	523525157
22	NC_021727	AATG	2	8	5058	5065	50 %	25 %	25 %	0 %	523525157
23	NC_021727	AGTT	2	8	5427	5434	25 %	50 %	25 %	0 %	523525157
24	NC_021727	ATTT	2	8	5776	5783	25 %	75 %	0 %	0 %	523525157
25	NC_021727	TTTC	2	8	6187	6194	0 %	75 %	0 %	25 %	523525158
26	NC_021727	TTCT	2	8	6197	6204	0 %	75 %	0 %	25 %	523525158
27	NC_021727	ATTG	2	8	6912	6919	25 %	50 %	25 %	0 %	523525158
28	NC_021727	ATTG	2	8	7153	7160	25 %	50 %	25 %	0 %	523525159
29	NC_021727	CTGT	2	8	7726	7733	0 %	50 %	25 %	25 %	523525159
30	NC_021727	ACTT	2	8	8120	8127	25 %	50 %	0 %	25 %	523525160
31	NC_021727	CTAT	2	8	8692	8699	25 %	50 %	0 %	25 %	523525160
32	NC_021727	TGAT	2	8	8772	8779	25 %	50 %	25 %	0 %	523525160
33	NC_021727	AAAT	2	8	8798	8805	75 %	25 %	0 %	0 %	523525160
34	NC_021727	TGTT	2	8	9233	9240	0 %	75 %	25 %	0 %	523525161
35	NC_021727	TATT	2	8	9496	9503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021727	AAAG	2	8	9555	9562	75 %	0 %	25 %	0 %	523525162
37	NC_021727	ATAG	2	8	10330	10337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021727	ATCT	2	8	10471	10478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021727	TTTC	2	8	10935	10942	0 %	75 %	0 %	25 %	523525163
40	NC_021727	AATT	2	8	11368	11375	50 %	50 %	0 %	0 %	523525164
41	NC_021727	TAAT	2	8	11671	11678	50 %	50 %	0 %	0 %	523525164
42	NC_021727	GAAT	2	8	11862	11869	50 %	25 %	25 %	0 %	523525164
43	NC_021727	CAAT	2	8	12052	12059	50 %	25 %	0 %	25 %	523525164
44	NC_021727	CGGT	2	8	12068	12075	0 %	25 %	50 %	25 %	523525164
45	NC_021727	ATAA	2	8	12160	12167	75 %	25 %	0 %	0 %	523525164
46	NC_021727	CTTT	2	8	12279	12286	0 %	75 %	0 %	25 %	523525164
47	NC_021727	ATTT	2	8	13079	13086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021727	TTGA	2	8	13204	13211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021727	TATC	2	8	13256	13263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021727	GGTT	2	8	13576	13583	0 %	50 %	50 %	0 %	523525165
51	NC_021727	ATAA	2	8	13645	13652	75 %	25 %	0 %	0 %	523525165
52	NC_021727	AAAT	2	8	13818	13825	75 %	25 %	0 %	0 %	523525165
53	NC_021727	TTGA	2	8	14292	14299	25 %	50 %	25 %	0 %	523525166
54	NC_021727	CTTT	2	8	14619	14626	0 %	75 %	0 %	25 %	523525166
55	NC_021727	AAAT	2	8	14904	14911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021727	CTTT	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021727	TAAA	2	8	16060	16067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021727	TCTT	2	8	16173	16180	0 %	75 %	0 %	25 %	523525169
59	NC_021727	TAAT	2	8	16534	16541	50 %	50 %	0 %	0 %	523525169
60	NC_021727	ATCA	2	8	17294	17301	50 %	25 %	0 %	25 %	523525172
61	NC_021727	CTTT	2	8	17378	17385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021727	ATTG	2	8	17403	17410	25 %	50 %	25 %	0 %	523525173
63	NC_021727	TGTA	2	8	17481	17488	25 %	50 %	25 %	0 %	523525173
64	NC_021727	CTTT	2	8	17584	17591	0 %	75 %	0 %	25 %	523525173
65	NC_021727	ATCT	2	8	17618	17625	25 %	50 %	0 %	25 %	523525173
66	NC_021727	CAAA	2	8	17719	17726	75 %	0 %	0 %	25 %	523525173
67	NC_021727	ATCA	2	8	18966	18973	50 %	25 %	0 %	25 %	523525175
68	NC_021727	TAGT	2	8	19150	19157	25 %	50 %	25 %	0 %	523525176
69	NC_021727	CAAG	2	8	19278	19285	50 %	0 %	25 %	25 %	523525176
70	NC_021727	AGAA	2	8	19367	19374	75 %	0 %	25 %	0 %	523525176
71	NC_021727	AATG	2	8	19779	19786	50 %	25 %	25 %	0 %	523525177
72	NC_021727	ACTT	2	8	19872	19879	25 %	50 %	0 %	25 %	523525177
73	NC_021727	AAAT	2	8	20334	20341	75 %	25 %	0 %	0 %	523525177
74	NC_021727	TTTC	2	8	20671	20678	0 %	75 %	0 %	25 %	523525177
75	NC_021727	TTCA	2	8	20839	20846	25 %	50 %	0 %	25 %	523525178
76	NC_021727	TTCT	2	8	20911	20918	0 %	75 %	0 %	25 %	523525178
77	NC_021727	AATT	2	8	20977	20984	50 %	50 %	0 %	0 %	523525178
78	NC_021727	TGAT	2	8	21461	21468	25 %	50 %	25 %	0 %	523525178
79	NC_021727	TACT	2	8	22050	22057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021727	TTCA	2	8	22073	22080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021727	TCAA	2	8	22134	22141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021727	ATAA	2	8	22212	22219	75 %	25 %	0 %	0 %	523525179
83	NC_021727	TTGC	2	8	23368	23375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021727	TCAA	2	8	23531	23538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021727	ATTT	2	8	23597	23604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021727	TGCT	2	8	23841	23848	0 %	50 %	25 %	25 %	523525180
87	NC_021727	AATG	2	8	24349	24356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021727	ACCG	2	8	24486	24493	25 %	0 %	25 %	50 %	523525182
89	NC_021727	TCTT	2	8	24550	24557	0 %	75 %	0 %	25 %	523525182
90	NC_021727	TTAT	2	8	24886	24893	25 %	75 %	0 %	0 %	523525182
91	NC_021727	ATTT	2	8	25010	25017	25 %	75 %	0 %	0 %	523525182
92	NC_021727	AATC	2	8	25346	25353	50 %	25 %	0 %	25 %	523525182
93	NC_021727	ATAG	2	8	25837	25844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021727	ATCT	2	8	25978	25985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021727	ATTG	2	8	26872	26879	25 %	50 %	25 %	0 %	523525183
96	NC_021727	AAAT	2	8	27092	27099	75 %	25 %	0 %	0 %	523525183
97	NC_021727	TCTT	2	8	27110	27117	0 %	75 %	0 %	25 %	523525183
98	NC_021727	ATTG	2	8	27361	27368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021727	ATTG	3	12	29380	29391	25 %	50 %	25 %	0 %	523525185
100	NC_021727	ACAT	2	8	30251	30258	50 %	25 %	0 %	25 %	523525185
101	NC_021727	TACC	2	8	30735	30742	25 %	25 %	0 %	50 %	523525185
102	NC_021727	ATTG	2	8	31059	31066	25 %	50 %	25 %	0 %	523525186
103	NC_021727	AATT	2	8	31328	31335	50 %	50 %	0 %	0 %	523525186
104	NC_021727	TTTA	2	8	32168	32175	25 %	75 %	0 %	0 %	523525186
105	NC_021727	ATAA	2	8	32277	32284	75 %	25 %	0 %	0 %	523525186
106	NC_021727	TTCA	2	8	32372	32379	25 %	50 %	0 %	25 %	523525186
107	NC_021727	AGAT	2	8	32410	32417	50 %	25 %	25 %	0 %	523525186
108	NC_021727	TTCG	2	8	32533	32540	0 %	50 %	25 %	25 %	523525187
109	NC_021727	ATTT	2	8	33085	33092	25 %	75 %	0 %	0 %	523525187
110	NC_021727	GAAG	2	8	34683	34690	50 %	0 %	50 %	0 %	523525188
111	NC_021727	GTTT	2	8	34974	34981	0 %	75 %	25 %	0 %	523525188
112	NC_021727	ACTG	2	8	35036	35043	25 %	25 %	25 %	25 %	523525188
113	NC_021727	AACT	2	8	35217	35224	50 %	25 %	0 %	25 %	523525188
114	NC_021727	TCTT	2	8	35614	35621	0 %	75 %	0 %	25 %	523525188
115	NC_021727	TTTA	2	8	35658	35665	25 %	75 %	0 %	0 %	523525188
116	NC_021727	TCGT	2	8	35698	35705	0 %	50 %	25 %	25 %	523525188
117	NC_021727	AAAG	2	8	35991	35998	75 %	0 %	25 %	0 %	523525189
118	NC_021727	TGCA	2	8	36053	36060	25 %	25 %	25 %	25 %	523525189
119	NC_021727	GAAA	2	8	36632	36639	75 %	0 %	25 %	0 %	523525189
120	NC_021727	CAAT	2	8	36686	36693	50 %	25 %	0 %	25 %	523525190
121	NC_021727	TTTC	2	8	36731	36738	0 %	75 %	0 %	25 %	523525190
122	NC_021727	TTTG	2	8	36846	36853	0 %	75 %	25 %	0 %	523525190
123	NC_021727	TGTT	2	8	39082	39089	0 %	75 %	25 %	0 %	523525193
124	NC_021727	TCTA	2	8	39283	39290	25 %	50 %	0 %	25 %	523525193
125	NC_021727	CAAA	2	8	39869	39876	75 %	0 %	0 %	25 %	523525194
126	NC_021727	CCAA	2	8	40023	40030	50 %	0 %	0 %	50 %	523525194
127	NC_021727	TTCG	2	8	40307	40314	0 %	50 %	25 %	25 %	523525194
128	NC_021727	CGAC	2	8	40372	40379	25 %	0 %	25 %	50 %	523525194
129	NC_021727	ATTA	2	8	40752	40759	50 %	50 %	0 %	0 %	523525194
130	NC_021727	AATG	2	8	41004	41011	50 %	25 %	25 %	0 %	523525194
131	NC_021727	ATAC	2	8	41898	41905	50 %	25 %	0 %	25 %	523525194
132	NC_021727	TTTG	2	8	42005	42012	0 %	75 %	25 %	0 %	523525194
133	NC_021727	CATT	2	8	42026	42033	25 %	50 %	0 %	25 %	523525194
134	NC_021727	AGGT	2	8	42505	42512	25 %	25 %	50 %	0 %	523525195
135	NC_021727	TGAT	2	8	42903	42910	25 %	50 %	25 %	0 %	523525196
136	NC_021727	ATTG	2	8	43003	43010	25 %	50 %	25 %	0 %	523525196
137	NC_021727	GATA	2	8	43392	43399	50 %	25 %	25 %	0 %	523525196
138	NC_021727	ACTA	2	8	43772	43779	50 %	25 %	0 %	25 %	523525197
139	NC_021727	CGAA	2	8	44064	44071	50 %	0 %	25 %	25 %	523525197
140	NC_021727	TCAT	2	8	44202	44209	25 %	50 %	0 %	25 %	523525197
141	NC_021727	TGTT	2	8	44301	44308	0 %	75 %	25 %	0 %	523525197
142	NC_021727	TTCA	2	8	44420	44427	25 %	50 %	0 %	25 %	523525197
143	NC_021727	ATAA	2	8	44628	44635	75 %	25 %	0 %	0 %	523525197
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.