MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021725	TAAAGG	2	12	37504	37515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021725	TGATCT	2	12	106004	106015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021725	GCTCAC	2	12	241899	241910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021725	TGGCGA	2	12	258168	258179	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021725	AATCGT	2	12	279520	279531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021725	CTGACA	2	12	287712	287723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021725	CGGAGC	2	12	299609	299620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021725	TGGAAG	2	12	301805	301816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021725	GTAGTT	2	12	314070	314081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021725	GCTCAC	2	12	340417	340428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021725	AATATT	2	12	357308	357319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021725	TTTAAA	2	12	383850	383861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021725	GATACT	2	12	404681	404692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021725	CATTGA	2	12	435810	435821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021725	TGACTT	2	12	438689	438700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021725	CAAAGA	2	12	438847	438858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021725	AATATC	2	12	473697	473708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021725	TATCGA	2	12	488228	488239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021725	CTCTAT	2	12	493933	493944	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021725	GAAAAA	2	12	506241	506252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021725	AAAACA	2	12	521399	521410	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021725	AAGGTA	2	12	530807	530818	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021725	CGGCAG	2	12	578056	578067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021725	TAACAA	2	12	578413	578424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021725	CAAGGT	2	12	582792	582803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021725	CAAGGA	2	12	598569	598580	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021725	CGATTA	2	12	653012	653023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021725	GTGAGC	2	12	682612	682623	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021725	TGAGCA	2	12	688423	688434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021725	GCTCAC	2	12	695466	695477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021725	TCGCAG	2	12	695488	695499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021725	TCGCAG	2	12	695737	695748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021725	ATTTTT	2	12	711242	711253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021725	GTTTTT	2	12	770653	770664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021725	GTTCTG	2	12	791935	791946	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021725	ATTTTC	2	12	791978	791989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021725	GGAATT	2	12	811742	811753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021725	CGGAGC	2	12	814566	814577	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021725	TGGAAG	2	12	816762	816773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021725	TCGCTT	2	12	819956	819967	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021725	TATACT	2	12	823063	823074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021725	CGGAGC	2	12	834590	834601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021725	TGGAAG	2	12	836786	836797	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021725	ATGTGG	2	12	850209	850220	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021725	CAACCG	2	12	885869	885880	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021725	AAACAA	2	12	896218	896229	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021725	GCTCAC	2	12	900377	900388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021725	CAGAAG	2	12	935620	935631	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021725	TTTCTG	2	12	956552	956563	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021725	GCTCAC	2	12	963006	963017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021725	TCGCAG	2	12	981121	981132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021725	ATTTTA	2	12	1001789	1001800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021725	ATTTAA	2	12	1029448	1029459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021725	TTATAA	2	12	1053742	1053753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021725	AATGAA	2	12	1077264	1077275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021725	ATCAGT	2	12	1083336	1083347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021725	GCTCAC	2	12	1093661	1093672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021725	AGCTGC	2	12	1097849	1097860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021725	TAAAAT	2	12	1125429	1125440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021725	CCAGCC	2	12	1134408	1134419	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021725	TAAAGT	2	12	1157345	1157356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021725	GCTCAC	2	12	1189807	1189818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021725	TGGGTG	2	12	1209395	1209406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021725	GTGAGC	2	12	1211500	1211511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021725	ACTTCG	2	12	1215163	1215174	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021725	GCTCAC	2	12	1278210	1278221	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021725	TCACAC	2	12	1371268	1371279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021725	GATAGT	2	12	1390619	1390630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021725	CGGTCT	2	12	1402042	1402053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021725	ATCAAT	2	12	1414275	1414286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021725	GGTTGA	2	12	1502048	1502059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021725	TGCAGA	2	12	1502744	1502755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021725	CATCAA	2	12	1550738	1550749	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021725	CTGTGA	2	12	1554737	1554748	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021725	CGCCCA	2	12	1554832	1554843	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021725	ACTACC	2	12	1598376	1598387	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021725	GTTAAC	2	12	1609888	1609899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021725	ACTGTC	2	12	1632239	1632250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021725	CCTGCC	2	12	1690875	1690886	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021725	ATTTTT	2	12	1691469	1691480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021725	TATTTT	2	12	1699417	1699428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021725	ACGCCG	2	12	1753329	1753340	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021725	GCTTTT	2	12	1758126	1758137	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021725	GTCATT	2	12	1837034	1837045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021725	GTGAGC	2	12	1843482	1843493	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021725	ACGTTT	2	12	1846768	1846779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021725	GCTCAC	2	12	1882537	1882548	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021725	CACTTC	2	12	1893979	1893990	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021725	GCTCCG	2	12	1896177	1896188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021725	GCTCAC	2	12	1920418	1920429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021725	GTGAGC	2	12	1926330	1926341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021725	TGCACA	2	12	1957790	1957801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021725	AGTTGC	2	12	1977481	1977492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021725	GTTCTT	2	12	2065356	2065367	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021725	GGTTTT	2	12	2072053	2072064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021725	AACTTT	2	12	2087521	2087532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021725	ATCAAT	2	12	2114230	2114241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021725	GTATCG	2	12	2118955	2118966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021725	TGGCAG	2	12	2124384	2124395	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021725	GCCAGC	2	12	2124415	2124426	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021725	GCTCAC	2	12	2127226	2127237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021725	TCATTT	2	12	2205692	2205703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021725	GCTCAC	2	12	2224117	2224128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021725	GCTTGT	2	12	2225175	2225186	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021725	TCGCAG	2	12	2260099	2260110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021725	AAAAGA	2	12	2340056	2340067	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021725	GTTGCA	2	12	2358270	2358281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021725	GATTTA	2	12	2388063	2388074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021725	GTGAGC	2	12	2420115	2420126	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021725	GCAACT	2	12	2458436	2458447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021725	CCGACA	2	12	2483344	2483355	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021725	CAGAAT	2	12	2492220	2492231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021725	TTGATG	2	12	2502526	2502537	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021725	CTGCGA	2	12	2512819	2512830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021725	TTTGAC	2	12	2562124	2562135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021725	CACTTC	2	12	2563399	2563410	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021725	GCTCCG	2	12	2565597	2565608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021725	TTGTGA	2	12	2607542	2607553	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021725	GCTTAT	2	12	2608585	2608596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021725	AAAAAC	2	12	2612826	2612837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021725	CAGTTT	2	12	2660074	2660085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021725	TAGCAT	2	12	2667867	2667878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021725	ATGCTT	2	12	2688603	2688614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021725	TCTGCT	2	12	2808649	2808660	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021725	ATCAAA	2	12	2848196	2848207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021725	TCGCAG	3	18	2889104	2889121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021725	CGATTA	2	12	2901894	2901905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021725	CCGTTC	2	12	2901925	2901936	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021725	GCTCAC	2	12	2906633	2906644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021725	TTCGTC	2	12	2939579	2939590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021725	CGGCCG	2	12	2939988	2939999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021725	GAAAAA	2	12	2949050	2949061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021725	ATTTTT	2	12	2951185	2951196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021725	AACGAC	2	12	2989374	2989385	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.