MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 1797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021725	TAAAA	2	10	3091	3100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021725	TAGGC	2	10	3302	3311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021725	GCAAG	2	10	3836	3845	40 %	0 %	40 %	20 %	523518469
5	NC_021725	GATCG	2	10	4026	4035	20 %	20 %	40 %	20 %	523518469
6	NC_021725	GAAAA	2	10	7758	7767	80 %	0 %	20 %	0 %	523518471
7	NC_021725	AAAAT	2	10	10024	10033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021725	GCAAC	2	10	10342	10351	40 %	0 %	20 %	40 %	523518472
9	NC_021725	ATCAA	2	10	11690	11699	60 %	20 %	0 %	20 %	523518472
10	NC_021725	GCAAC	2	10	12348	12357	40 %	0 %	20 %	40 %	523518474
11	NC_021725	ATCAA	2	10	13696	13705	60 %	20 %	0 %	20 %	523518474
12	NC_021725	ATTTG	2	10	17371	17380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021725	CCGGT	2	10	19081	19090	0 %	20 %	40 %	40 %	523518483
14	NC_021725	AGCAG	2	10	21110	21119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021725	TTGAT	2	10	23110	23119	20 %	60 %	20 %	0 %	523518488
16	NC_021725	GTTGC	2	10	24458	24467	0 %	40 %	40 %	20 %	523518488
17	NC_021725	TGGTG	2	10	27147	27156	0 %	40 %	60 %	0 %	523518490
18	NC_021725	AACTG	2	10	29806	29815	40 %	20 %	20 %	20 %	523518492
19	NC_021725	GATGC	2	10	30056	30065	20 %	20 %	40 %	20 %	523518492
20	NC_021725	GAATA	2	10	30527	30536	60 %	20 %	20 %	0 %	523518494
21	NC_021725	AAAAC	2	10	33378	33387	80 %	0 %	0 %	20 %	523518495
22	NC_021725	ATGAC	2	10	34060	34069	40 %	20 %	20 %	20 %	523518496
23	NC_021725	CTGAT	2	10	34825	34834	20 %	40 %	20 %	20 %	523518497
24	NC_021725	GATTT	2	10	41059	41068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021725	TTAAT	2	10	41274	41283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021725	TTTTC	2	10	41655	41664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021725	AAGGA	2	10	42406	42415	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021725	TAGAT	2	10	46568	46577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021725	GATCG	2	10	48732	48741	20 %	20 %	40 %	20 %	523518509
30	NC_021725	AAAGC	2	10	50168	50177	60 %	0 %	20 %	20 %	523518510
31	NC_021725	AGACA	2	10	53155	53164	60 %	0 %	20 %	20 %	523518510
32	NC_021725	AGCCA	2	10	53362	53371	40 %	0 %	20 %	40 %	523518510
33	NC_021725	ACAGT	2	10	53838	53847	40 %	20 %	20 %	20 %	523518510
34	NC_021725	CATCG	2	10	57155	57164	20 %	20 %	20 %	40 %	523518513
35	NC_021725	AGCCC	2	10	60184	60193	20 %	0 %	20 %	60 %	523518515
36	NC_021725	TTGGC	2	10	60267	60276	0 %	40 %	40 %	20 %	523518515
37	NC_021725	CCGAT	2	10	63494	63503	20 %	20 %	20 %	40 %	523518517
38	NC_021725	GGCGT	2	10	65971	65980	0 %	20 %	60 %	20 %	523518519
39	NC_021725	AAGTG	2	10	67348	67357	40 %	20 %	40 %	0 %	523518520
40	NC_021725	CATAG	2	10	72955	72964	40 %	20 %	20 %	20 %	523518525
41	NC_021725	TCAAG	2	10	73320	73329	40 %	20 %	20 %	20 %	523518526
42	NC_021725	TCGAG	2	10	74203	74212	20 %	20 %	40 %	20 %	523518527
43	NC_021725	CTGAG	2	10	77271	77280	20 %	20 %	40 %	20 %	523518530
44	NC_021725	TTGGA	2	10	77753	77762	20 %	40 %	40 %	0 %	523518530
45	NC_021725	AATGG	2	10	79528	79537	40 %	20 %	40 %	0 %	523518531
46	NC_021725	GATCC	2	10	82160	82169	20 %	20 %	20 %	40 %	523518534
47	NC_021725	GTGGC	2	10	83501	83510	0 %	20 %	60 %	20 %	523518536
48	NC_021725	GCCAA	2	10	84436	84445	40 %	0 %	20 %	40 %	523518537
49	NC_021725	AGTTC	2	10	84670	84679	20 %	40 %	20 %	20 %	523518538
50	NC_021725	AAACC	2	10	84898	84907	60 %	0 %	0 %	40 %	523518538
51	NC_021725	AGATC	2	10	86912	86921	40 %	20 %	20 %	20 %	523518540
52	NC_021725	CGTTT	2	10	90283	90292	0 %	60 %	20 %	20 %	523518543
53	NC_021725	TGGGA	2	10	93987	93996	20 %	20 %	60 %	0 %	523518547
54	NC_021725	GAAAA	2	10	94801	94810	80 %	0 %	20 %	0 %	523518549
55	NC_021725	GAATC	2	10	96056	96065	40 %	20 %	20 %	20 %	523518549
56	NC_021725	ATCGC	2	10	99378	99387	20 %	20 %	20 %	40 %	523518551
57	NC_021725	GTTTT	2	10	106126	106135	0 %	80 %	20 %	0 %	523518560
58	NC_021725	CGAAG	2	10	106848	106857	40 %	0 %	40 %	20 %	523518560
59	NC_021725	CCCAT	2	10	106864	106873	20 %	20 %	0 %	60 %	523518560
60	NC_021725	AGTCG	2	10	107002	107011	20 %	20 %	40 %	20 %	523518560
61	NC_021725	ATCAT	2	10	109518	109527	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021725	GCTTG	2	10	110811	110820	0 %	40 %	40 %	20 %	523518563
63	NC_021725	GTTTC	2	10	111743	111752	0 %	60 %	20 %	20 %	523518564
64	NC_021725	CCATG	2	10	114237	114246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021725	AAAAC	2	10	115035	115044	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021725	TGGGC	2	10	119262	119271	0 %	20 %	60 %	20 %	523518573
67	NC_021725	AGGGC	2	10	119315	119324	20 %	0 %	60 %	20 %	523518573
68	NC_021725	GCTTT	2	10	119969	119978	0 %	60 %	20 %	20 %	523518573
69	NC_021725	TAACG	2	10	123253	123262	40 %	20 %	20 %	20 %	523518576
70	NC_021725	CCTTG	2	10	123761	123770	0 %	40 %	20 %	40 %	523518577
71	NC_021725	TCTTT	2	10	126143	126152	0 %	80 %	0 %	20 %	523518580
72	NC_021725	ATTGT	2	10	127709	127718	20 %	60 %	20 %	0 %	523518581
73	NC_021725	CAAAA	2	10	128448	128457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021725	AACCA	2	10	130888	130897	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_021725	AGCTG	2	10	131608	131617	20 %	20 %	40 %	20 %	523518585
76	NC_021725	AAAAC	2	10	132562	132571	80 %	0 %	0 %	20 %	523518586
77	NC_021725	CGTGG	2	10	138095	138104	0 %	20 %	60 %	20 %	523518590
78	NC_021725	ACCGC	2	10	140463	140472	20 %	0 %	20 %	60 %	523518592
79	NC_021725	GCATC	2	10	141892	141901	20 %	20 %	20 %	40 %	523518593
80	NC_021725	AGGCT	2	10	142145	142154	20 %	20 %	40 %	20 %	523518593
81	NC_021725	GAATC	2	10	142718	142727	40 %	20 %	20 %	20 %	523518594
82	NC_021725	TGGCG	2	10	142913	142922	0 %	20 %	60 %	20 %	523518594
83	NC_021725	AATCA	2	10	144451	144460	60 %	20 %	0 %	20 %	523518595
84	NC_021725	TTTTC	2	10	144768	144777	0 %	80 %	0 %	20 %	523518595
85	NC_021725	GTTTG	2	10	145508	145517	0 %	60 %	40 %	0 %	523518596
86	NC_021725	GGTCA	2	10	146023	146032	20 %	20 %	40 %	20 %	523518597
87	NC_021725	CAGCT	2	10	146246	146255	20 %	20 %	20 %	40 %	523518597
88	NC_021725	CAGCA	2	10	148826	148835	40 %	0 %	20 %	40 %	523518598
89	NC_021725	GGGAT	2	10	150150	150159	20 %	20 %	60 %	0 %	523518599
90	NC_021725	CTCAA	2	10	152297	152306	40 %	20 %	0 %	40 %	523518600
91	NC_021725	GTGCC	2	10	153906	153915	0 %	20 %	40 %	40 %	523518602
92	NC_021725	TAATT	2	10	157490	157499	40 %	60 %	0 %	0 %	523518605
93	NC_021725	ATCGG	2	10	158479	158488	20 %	20 %	40 %	20 %	523518606
94	NC_021725	GTTCG	2	10	160008	160017	0 %	40 %	40 %	20 %	523518608
95	NC_021725	CGGTG	2	10	160967	160976	0 %	20 %	60 %	20 %	523518609
96	NC_021725	GCAAG	2	10	164280	164289	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021725	TGCTG	2	10	170514	170523	0 %	40 %	40 %	20 %	523518620
98	NC_021725	ACGCT	2	10	170551	170560	20 %	20 %	20 %	40 %	523518620
99	NC_021725	ATTGC	2	10	172773	172782	20 %	40 %	20 %	20 %	523518622
100	NC_021725	GCAAT	2	10	174589	174598	40 %	20 %	20 %	20 %	523518624
101	NC_021725	GCGTG	2	10	177579	177588	0 %	20 %	60 %	20 %	523518629
102	NC_021725	GAAGA	2	10	177811	177820	60 %	0 %	40 %	0 %	523518629
103	NC_021725	CAAAC	2	10	179026	179035	60 %	0 %	0 %	40 %	523518630
104	NC_021725	AATTT	2	10	179762	179771	40 %	60 %	0 %	0 %	523518630
105	NC_021725	GGCAA	3	15	180843	180857	40 %	0 %	40 %	20 %	523518631
106	NC_021725	AATCA	2	10	181637	181646	60 %	20 %	0 %	20 %	523518632
107	NC_021725	TTGGT	2	10	183288	183297	0 %	60 %	40 %	0 %	523518635
108	NC_021725	TCACT	2	10	186524	186533	20 %	40 %	0 %	40 %	523518639
109	NC_021725	AAGTC	2	10	187096	187105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021725	TTCAT	2	10	188075	188084	20 %	60 %	0 %	20 %	523518640
111	NC_021725	TCGAC	2	10	188552	188561	20 %	20 %	20 %	40 %	523518640
112	NC_021725	CAAGC	2	10	191562	191571	40 %	0 %	20 %	40 %	523518643
113	NC_021725	TAAGC	2	10	195061	195070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021725	CACAA	2	10	196504	196513	60 %	0 %	0 %	40 %	523518648
115	NC_021725	AATAA	2	10	196953	196962	80 %	20 %	0 %	0 %	523518649
116	NC_021725	GTGAT	2	10	198130	198139	20 %	40 %	40 %	0 %	523518649
117	NC_021725	TGGTC	2	10	199360	199369	0 %	40 %	40 %	20 %	523518651
118	NC_021725	TTCGG	2	10	201572	201581	0 %	40 %	40 %	20 %	523518652
119	NC_021725	GGCCG	2	10	202420	202429	0 %	0 %	60 %	40 %	523518653
120	NC_021725	ATGCG	2	10	204596	204605	20 %	20 %	40 %	20 %	523518655
121	NC_021725	GCCGA	2	10	205186	205195	20 %	0 %	40 %	40 %	523518656
122	NC_021725	CCGTT	2	10	205259	205268	0 %	40 %	20 %	40 %	523518656
123	NC_021725	GCAAC	2	10	206854	206863	40 %	0 %	20 %	40 %	523518658
124	NC_021725	ATCAA	2	10	208202	208211	60 %	20 %	0 %	20 %	523518658
125	NC_021725	TTGTT	2	10	210410	210419	0 %	80 %	20 %	0 %	523518662
126	NC_021725	AAATT	2	10	214767	214776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021725	CAGCC	2	10	216563	216572	20 %	0 %	20 %	60 %	523518667
128	NC_021725	GCTAT	2	10	217760	217769	20 %	40 %	20 %	20 %	523518668
129	NC_021725	GACGG	2	10	218127	218136	20 %	0 %	60 %	20 %	523518669
130	NC_021725	TTATT	2	10	218314	218323	20 %	80 %	0 %	0 %	523518669
131	NC_021725	CAGAT	2	10	220050	220059	40 %	20 %	20 %	20 %	523518671
132	NC_021725	GAAGG	2	10	224435	224444	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021725	TCTTT	2	10	224565	224574	0 %	80 %	0 %	20 %	523518676
134	NC_021725	GACCC	2	10	228012	228021	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_021725	CAAAG	2	10	230224	230233	60 %	0 %	20 %	20 %	523518682
136	NC_021725	AAGGT	2	10	230568	230577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021725	TTCAT	2	10	230843	230852	20 %	60 %	0 %	20 %	523518683
138	NC_021725	TGAGG	2	10	230956	230965	20 %	20 %	60 %	0 %	523518684
139	NC_021725	TGATC	2	10	233564	233573	20 %	40 %	20 %	20 %	523518689
140	NC_021725	GTTGC	2	10	238363	238372	0 %	40 %	40 %	20 %	523518697
141	NC_021725	AGAGA	2	10	243562	243571	60 %	0 %	40 %	0 %	523518705
142	NC_021725	CGATT	2	10	244006	244015	20 %	40 %	20 %	20 %	523518706
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149	NC_021725	GCATC	2	10	258950	258959	20 %	20 %	20 %	40 %	523518723
150	NC_021725	TATCA	2	10	259212	259221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_021725	CGGTT	2	10	263152	263161	0 %	40 %	40 %	20 %	523518727
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154	NC_021725	GGTTA	2	10	272273	272282	20 %	40 %	40 %	0 %	523518736
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157	NC_021725	CCGGT	2	10	274809	274818	0 %	20 %	40 %	40 %	523518738
158	NC_021725	CATTT	2	10	282298	282307	20 %	60 %	0 %	20 %	523518746
159	NC_021725	AAAGA	2	10	285146	285155	80 %	0 %	20 %	0 %	523518748
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163	NC_021725	ATTTG	2	10	288799	288808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_021725	TGATG	2	10	290603	290612	20 %	40 %	40 %	0 %	523518753
166	NC_021725	GGGAT	2	10	290618	290627	20 %	20 %	60 %	0 %	523518753
167	NC_021725	CAAAA	2	10	292313	292322	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_021725	AATGA	2	10	294404	294413	60 %	20 %	20 %	0 %	523518758
169	NC_021725	AGGTG	2	10	296638	296647	20 %	20 %	60 %	0 %	523518759
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171	NC_021725	GTCTG	2	10	297921	297930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_021725	TCGTG	2	10	298255	298264	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_021725	TCGCA	2	10	298916	298925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
174	NC_021725	AAACG	2	10	299329	299338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_021725	GAGAT	2	10	301742	301751	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021725	AAGAT	2	10	302102	302111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_021725	AGCGG	2	10	369336	369345	20 %	0 %	60 %	20 %	523518824
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211	NC_021725	TGATT	2	10	374538	374547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_021725	TGCAA	2	10	411545	411554	40 %	20 %	20 %	20 %	523518870
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248	NC_021725	AAAGA	2	10	424554	424563	80 %	0 %	20 %	0 %	523518881
249	NC_021725	CAGAG	2	10	426264	426273	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
250	NC_021725	TGGCG	2	10	428205	428214	0 %	20 %	60 %	20 %	523518884
251	NC_021725	CGTAT	2	10	431080	431089	20 %	40 %	20 %	20 %	523518887
252	NC_021725	AGCCA	2	10	431285	431294	40 %	0 %	20 %	40 %	523518887
253	NC_021725	TTTTC	2	10	431678	431687	0 %	80 %	0 %	20 %	523518888
254	NC_021725	GTTTT	2	10	433073	433082	0 %	80 %	20 %	0 %	523518889
255	NC_021725	TCAAT	2	10	435960	435969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_021725	AATGA	2	10	437188	437197	60 %	20 %	20 %	0 %	523518891
257	NC_021725	CATTC	2	10	438033	438042	20 %	40 %	0 %	40 %	523518892
258	NC_021725	GTTCG	2	10	438214	438223	0 %	40 %	40 %	20 %	523518892
259	NC_021725	AGCAA	2	10	439050	439059	60 %	0 %	20 %	20 %	523518893
260	NC_021725	GAAAA	2	10	443480	443489	80 %	0 %	20 %	0 %	523518898
261	NC_021725	GTTGT	2	10	443915	443924	0 %	60 %	40 %	0 %	523518898
262	NC_021725	AGCCA	2	10	444357	444366	40 %	0 %	20 %	40 %	523518899
263	NC_021725	GAAGA	2	10	448738	448747	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021725	ATGCG	2	10	449064	449073	20 %	20 %	40 %	20 %	523518904
265	NC_021725	GACTG	2	10	450939	450948	20 %	20 %	40 %	20 %	523518905
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267	NC_021725	GTTTG	2	10	454144	454153	0 %	60 %	40 %	0 %	523518909
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400	NC_021725	CTCAC	2	10	663265	663274	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
401	NC_021725	GCGTG	2	10	663766	663775	0 %	20 %	60 %	20 %	523519114
402	NC_021725	CAAGT	2	10	664217	664226	40 %	20 %	20 %	20 %	523519114
403	NC_021725	CAAAG	2	10	665848	665857	60 %	0 %	20 %	20 %	523519116
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405	NC_021725	CGATT	2	10	670380	670389	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
406	NC_021725	ATGCT	2	10	673311	673320	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
407	NC_021725	TCACA	2	10	677789	677798	40 %	20 %	0 %	40 %	523519129
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409	NC_021725	TCGAG	2	10	679264	679273	20 %	20 %	40 %	20 %	523519131
410	NC_021725	GTTGG	2	10	679561	679570	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
411	NC_021725	TTTCT	2	10	679800	679809	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_021725	CATTT	2	10	700714	700723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
426	NC_021725	CTTGG	2	10	702806	702815	0 %	40 %	40 %	20 %	523519153
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428	NC_021725	CATGC	2	10	706326	706335	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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431	NC_021725	GTAAA	2	10	710772	710781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
432	NC_021725	ATTGC	2	10	711547	711556	20 %	40 %	20 %	20 %	523519159
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485	NC_021725	GTCTG	2	10	812878	812887	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
486	NC_021725	TCGTG	2	10	813212	813221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
487	NC_021725	TCGCA	2	10	813873	813882	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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499	NC_021725	AACAA	2	10	831226	831235	80 %	0 %	0 %	20 %	523519275
500	NC_021725	CAAAG	2	10	831246	831255	60 %	0 %	20 %	20 %	523519275

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