MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 1312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	GCAA	2	8	2987	2994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021725	TTTA	2	8	3045	3052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021725	TAAT	2	8	3450	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021725	AAAT	2	8	9866	9873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021725	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021725	CTAA	2	8	20212	20219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021725	GTTT	2	8	20436	20443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021725	AAGA	2	8	20680	20687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021725	TTTA	2	8	20827	20834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021725	ATTT	2	8	21467	21474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021725	ATAC	2	8	22256	22263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021725	AGTG	2	8	22358	22365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021725	ATTC	2	8	22389	22396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021725	TAAA	2	8	24795	24802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021725	TTTC	2	8	25786	25793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021725	GGGC	2	8	26132	26139	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021725	TGCG	2	8	26174	26181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021725	TTTG	2	8	26395	26402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021725	TTAT	2	8	28835	28842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021725	GGGT	2	8	28899	28906	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021725	TTAA	3	12	30177	30188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021725	TTGC	2	8	35695	35702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021725	CAAA	2	8	37458	37465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021725	GTAT	2	8	38552	38559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021725	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021725	GTTT	2	8	41197	41204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021725	AAGT	2	8	42005	42012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021725	CCGG	2	8	42039	42046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021725	TGGG	2	8	42464	42471	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021725	AGAA	2	8	42563	42570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021725	ATGA	2	8	42958	42965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021725	TCTA	2	8	43001	43008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021725	CCTT	2	8	43274	43281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021725	TAGT	2	8	43296	43303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021725	TATT	2	8	43372	43379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021725	ATTT	2	8	43961	43968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021725	CTTT	2	8	47752	47759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021725	CAAA	2	8	47815	47822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021725	TGCG	2	8	49840	49847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021725	AAAG	2	8	50109	50116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021725	TAAA	2	8	54705	54712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021725	TAAG	2	8	63991	63998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021725	AAAT	2	8	64008	64015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021725	CAGT	2	8	64149	64156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021725	GAAG	2	8	64365	64372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021725	AAGG	2	8	65128	65135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021725	CGTG	2	8	69476	69483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021725	TGAA	2	8	71623	71630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021725	ATAC	2	8	71663	71670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021725	TAGC	2	8	74408	74415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021725	TCGC	2	8	74707	74714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021725	ATTG	2	8	74939	74946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021725	AAAC	2	8	75101	75108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021725	TTCA	2	8	79571	79578	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021725	TAAT	2	8	79627	79634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021725	TAAA	2	8	83127	83134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021725	CAGT	2	8	83691	83698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021725	TGAT	2	8	83713	83720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021725	TTTG	2	8	87416	87423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021725	TTGA	2	8	87549	87556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021725	GGGA	2	8	87613	87620	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021725	CGAT	2	8	90530	90537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021725	CTGT	2	8	90550	90557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021725	AAAT	2	8	92770	92777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021725	AGGT	2	8	94319	94326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021725	TTTA	2	8	100683	100690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021725	TGAT	2	8	106050	106057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021725	CAAA	2	8	112604	112611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021725	ATTT	2	8	112811	112818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021725	GTAA	2	8	114308	114315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021725	ATCA	2	8	117071	117078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021725	CAAA	2	8	120371	120378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021725	ATTT	2	8	120445	120452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021725	ATTG	2	8	124875	124882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021725	CCTG	2	8	125421	125428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021725	GATT	2	8	129883	129890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021725	CAAG	2	8	130803	130810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021725	TAGC	2	8	133713	133720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021725	AGCC	2	8	136594	136601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021725	AGCC	2	8	136716	136723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021725	ATAA	2	8	138411	138418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021725	CTTT	2	8	142661	142668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021725	ATAA	2	8	151174	151181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021725	TTCG	2	8	151183	151190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021725	ATTA	2	8	151311	151318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021725	TTAA	2	8	152617	152624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021725	CGAA	2	8	155694	155701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021725	GAAT	2	8	160326	160333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021725	AAAT	2	8	164388	164395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021725	CAAA	2	8	164706	164713	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021725	CCAC	2	8	164741	164748	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_021725	CACC	2	8	164816	164823	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_021725	TCCC	2	8	165830	165837	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_021725	CTTT	2	8	167046	167053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021725	TGAA	2	8	167193	167200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021725	CAAA	2	8	169598	169605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021725	ATTC	2	8	176091	176098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021725	GAAT	2	8	176215	176222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021725	GAAT	2	8	176231	176238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021725	ACGA	2	8	180522	180529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021725	GTGA	2	8	180532	180539	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021725	TAGA	2	8	184136	184143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021725	TTAC	2	8	184172	184179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021725	GGGC	2	8	184194	184201	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021725	AGTA	2	8	185665	185672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021725	TTTG	2	8	186255	186262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021725	TTAA	2	8	187112	187119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021725	GTTT	2	8	187214	187221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021725	TTTA	2	8	193573	193580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021725	TAAT	2	8	198287	198294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021725	TTTA	2	8	204068	204075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021725	TTAT	2	8	211501	211508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021725	AAAG	2	8	211596	211603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021725	ATAA	2	8	211632	211639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021725	ATTA	2	8	216776	216783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021725	TAAA	2	8	216845	216852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021725	AAAT	2	8	216900	216907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021725	ATTT	2	8	216908	216915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021725	CTTT	2	8	221187	221194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021725	TTAA	2	8	229915	229922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021725	AAAG	2	8	233806	233813	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021725	ACTG	2	8	234656	234663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021725	CGCT	2	8	240112	240119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021725	TTTG	2	8	240182	240189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021725	TGAT	2	8	240983	240990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021725	TGTT	2	8	241970	241977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021725	TTTC	2	8	247678	247685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021725	AGCC	2	8	253857	253864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021725	GTGC	2	8	258157	258164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021725	ATTT	2	8	259241	259248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021725	ATTT	2	8	260905	260912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021725	TACA	2	8	274136	274143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021725	AAGA	2	8	274158	274165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021725	GATT	2	8	274266	274273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021725	CGCA	2	8	274305	274312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021725	AGTT	2	8	287823	287830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021725	GATG	2	8	289206	289213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021725	AGAC	2	8	289362	289369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021725	CATG	2	8	294028	294035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021725	CTAG	2	8	294186	294193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021725	GTCA	2	8	296925	296932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021725	TGGA	2	8	297409	297416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021725	GTGA	2	8	297588	297595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021725	AGCG	2	8	297758	297765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021725	ATGG	2	8	298423	298430	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021725	GAGC	2	8	298642	298649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021725	TAAG	2	8	299038	299045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021725	AGAA	2	8	299168	299175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021725	GCGA	2	8	299197	299204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021725	GCTT	2	8	299229	299236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021725	GTAG	2	8	299648	299655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021725	ATGT	2	8	299731	299738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021725	GAGC	2	8	300639	300646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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