MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 38965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518465
2	NC_021725	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518465
3	NC_021725	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518465
4	NC_021725	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518465
5	NC_021725	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518465
6	NC_021725	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518465
7	NC_021725	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518465
8	NC_021725	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
9	NC_021725	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
10	NC_021725	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518465
11	NC_021725	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518465
12	NC_021725	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
13	NC_021725	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
14	NC_021725	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518465
15	NC_021725	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518465
16	NC_021725	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021725	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021725	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518466
19	NC_021725	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518466
20	NC_021725	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518466
21	NC_021725	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518466
22	NC_021725	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518466
23	NC_021725	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518466
24	NC_021725	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518466
25	NC_021725	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518466
26	NC_021725	CGT	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518466
27	NC_021725	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518466
28	NC_021725	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518466
29	NC_021725	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518467
30	NC_021725	ATG	2	6	2878	2883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518467
31	NC_021725	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021725	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021725	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021725	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021725	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021725	CGA	3	9	3521	3529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518468
37	NC_021725	CAC	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518468
38	NC_021725	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518468
39	NC_021725	CGT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518468
40	NC_021725	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518468
41	NC_021725	CAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518469
42	NC_021725	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518469
43	NC_021725	TCA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518469
44	NC_021725	CGG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518469
45	NC_021725	GGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518469
46	NC_021725	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518469
47	NC_021725	TGC	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518469
48	NC_021725	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518469
49	NC_021725	AGC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518469
50	NC_021725	GAT	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518469
51	NC_021725	CAG	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518469
52	NC_021725	CAC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518469
53	NC_021725	GAC	3	9	4763	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518469
54	NC_021725	ATC	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518469
55	NC_021725	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021725	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
57	NC_021725	GCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518470
58	NC_021725	ATG	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
59	NC_021725	CAT	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518470
60	NC_021725	GTC	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518470
61	NC_021725	GGT	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518470
62	NC_021725	CGG	2	6	5262	5267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
63	NC_021725	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
64	NC_021725	CGG	2	6	5334	5339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
65	NC_021725	TGA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
66	NC_021725	GCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
67	NC_021725	GGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
68	NC_021725	GAA	3	9	5628	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
69	NC_021725	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518470
70	NC_021725	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
71	NC_021725	GTT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
72	NC_021725	GGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518470
73	NC_021725	CAA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518470
74	NC_021725	ATT	2	6	6049	6054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518470
75	NC_021725	GCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518470
76	NC_021725	AAG	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
77	NC_021725	ACA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518470
78	NC_021725	GGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
79	NC_021725	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
80	NC_021725	ATC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518470
81	NC_021725	GTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
82	NC_021725	ATG	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
83	NC_021725	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518470
84	NC_021725	ACC	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518470
85	NC_021725	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
86	NC_021725	GAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
87	NC_021725	TTG	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
88	NC_021725	AAC	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518470
89	NC_021725	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021725	GAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
91	NC_021725	AAG	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
92	NC_021725	TCG	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
93	NC_021725	GCG	3	9	7263	7271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518471
94	NC_021725	CAA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518471
95	NC_021725	GTT	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518471
96	NC_021725	CTG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
97	NC_021725	ACC	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518471
98	NC_021725	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518471
99	NC_021725	ATC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518471
100	NC_021725	CCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518471
101	NC_021725	CCG	2	6	7528	7533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518471
102	NC_021725	GGT	2	6	7572	7577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
103	NC_021725	TTA	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518471
104	NC_021725	CAA	2	6	7715	7720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518471
105	NC_021725	TGG	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
106	NC_021725	TGA	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
107	NC_021725	CCG	2	6	7832	7837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518471
108	NC_021725	AAT	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518471
109	NC_021725	TGG	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
110	NC_021725	CGG	3	9	7998	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518471
111	NC_021725	GAA	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
112	NC_021725	TGA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
113	NC_021725	ATT	2	6	8097	8102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518471
114	NC_021725	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518471
115	NC_021725	ATG	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
116	NC_021725	CTG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
117	NC_021725	AAG	2	6	8419	8424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
118	NC_021725	GGT	2	6	8499	8504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
119	NC_021725	GAT	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
120	NC_021725	TCG	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
121	NC_021725	ATG	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
122	NC_021725	CTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518471
123	NC_021725	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518471
124	NC_021725	GCA	2	6	8614	8619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
125	NC_021725	ATG	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
126	NC_021725	GCA	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
127	NC_021725	CGG	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518471
128	NC_021725	GAA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
129	NC_021725	CGA	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
130	NC_021725	CGA	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
131	NC_021725	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
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135	NC_021725	CTG	3	9	9800	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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137	NC_021725	GTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_021725	TAT	2	6	10109	10114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021725	TTA	2	6	10151	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021725	GTA	2	6	12030	12035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_021725	CCA	2	6	19807	19812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518483
255	NC_021725	CAT	2	6	19859	19864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518483
256	NC_021725	CAA	2	6	19904	19909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518483
257	NC_021725	ATA	2	6	19949	19954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021725	AGG	2	6	19969	19974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021725	GAA	2	6	19985	19990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518484
260	NC_021725	TGG	2	6	20020	20025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518484
261	NC_021725	TCT	2	6	20047	20052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518484
262	NC_021725	GTT	2	6	20115	20120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518484
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265	NC_021725	GGT	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021725	GAA	2	6	20427	20432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021725	ACA	2	6	20626	20631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_021725	TTC	2	6	20670	20675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_021725	GTA	2	6	20697	20702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021725	TGA	2	6	20715	20720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021725	ATT	2	6	20730	20735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021725	ACG	2	6	20898	20903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_021725	GTT	2	6	20997	21002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021725	ATT	2	6	21234	21239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021725	ATA	2	6	21240	21245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_021725	ATT	2	6	21710	21715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518486
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293	NC_021725	CAG	2	6	22429	22434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_021725	CTT	2	6	22505	22510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518487
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499	NC_021725	TCA	2	6	36609	36614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_021725	AAG	2	6	36655	36660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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