MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021723	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021723	TAAAGG	2	12	32282	32293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021723	TTATAT	2	12	36131	36142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021723	AAAAAG	2	12	54933	54944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021723	TGATCT	2	12	91135	91146	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021723	GCTCAC	2	12	182672	182683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021723	GCTCAC	2	12	222445	222456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021723	TGGCGA	2	12	238587	238598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021723	AATCGT	2	12	259745	259756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021723	CTGACA	2	12	267940	267951	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021723	CGGAGC	2	12	279874	279885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021723	TGGAAG	2	12	282070	282081	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021723	GTAGTT	2	12	294332	294343	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021723	GCAAAT	2	12	295279	295290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021723	TTACGA	2	12	316225	316236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021723	GCTCAC	2	12	317136	317147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021723	AATATT	2	12	340008	340019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021723	GACAGA	2	12	369520	369531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021723	GATACT	2	12	380425	380436	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021723	CATTGA	2	12	407814	407825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021723	TGACTT	2	12	410692	410703	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021723	CAAAGA	2	12	410850	410861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021723	GTGAGC	2	12	450132	450143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021723	TATCGA	2	12	450607	450618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021723	TTAGTT	2	12	460296	460307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021723	AAATGT	2	12	472454	472465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021723	AAAACA	2	12	474487	474498	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021723	ACAGAC	2	12	479569	479580	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021723	CAAGGA	2	12	545998	546009	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021723	GTGAGC	2	12	600258	600269	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021723	TGAACC	2	12	609579	609590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021723	TTTTTA	2	12	646405	646416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021723	ATTTTT	2	12	650751	650762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021723	GTTTTT	2	12	709969	709980	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021723	GTTCTG	2	12	731009	731020	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021723	ATTTTC	2	12	731052	731063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021723	GGAATT	2	12	750817	750828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021723	CGGAGC	2	12	753641	753652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021723	TGGAAG	2	12	755837	755848	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021723	TCGCTT	2	12	759044	759055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021723	TATACT	2	12	762151	762162	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021723	CGGAGC	2	12	773790	773801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021723	TGGAAG	2	12	775986	775997	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021723	AAAACA	2	12	794079	794090	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021723	AATGCA	2	12	807878	807889	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021723	CAGAAG	2	12	833489	833500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021723	TCGCAG	2	12	878566	878577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021723	ATTTTA	2	12	899376	899387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021723	ATTTAA	2	12	926514	926525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021723	AATGAA	2	12	962151	962162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021723	ATCAGT	2	12	968219	968230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021723	GCTCAC	2	12	978299	978310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021723	AGCTGC	2	12	982606	982617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021723	GTGAGC	2	12	987969	987980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021723	TCGCAG	2	12	992688	992699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021723	TAAAAT	2	12	1002694	1002705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021723	ATGTGG	2	12	1039073	1039084	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021723	TTTTTA	2	12	1077785	1077796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021723	GTGAGC	2	12	1124208	1124219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021723	ACTTCG	2	12	1127873	1127884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021723	TGAGAC	2	12	1272221	1272232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021723	TCACAC	2	12	1281178	1281189	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021723	GATAGT	2	12	1300527	1300538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021723	ATCAAT	2	12	1322605	1322616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021723	GGTTGA	2	12	1408630	1408641	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021723	TGCAGA	2	12	1409336	1409347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021723	CGCCCA	2	12	1460930	1460941	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021723	GTTAAC	2	12	1514259	1514270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021723	GTGAGC	2	12	1519876	1519887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021723	CTGTCA	2	12	1537928	1537939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021723	CCTGCC	2	12	1596495	1596506	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021723	ATTTTT	2	12	1597088	1597099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021723	TATTTT	2	12	1604932	1604943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021723	GCTTTT	2	12	1663942	1663953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021723	ATATGG	2	12	1703713	1703724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021723	GTGAGC	2	12	1748901	1748912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021723	ACGTTT	2	12	1752066	1752077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021723	GCTCAC	2	12	1788046	1788057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021723	CACTTC	2	12	1799610	1799621	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021723	GCTCCG	2	12	1801808	1801819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021723	GCTCAC	2	12	1839481	1839492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021723	TGCACA	2	12	1857656	1857667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021723	TTTTAG	2	12	1872812	1872823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021723	TTTTCT	2	12	1877721	1877732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021723	TGATTT	2	12	1877746	1877757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021723	ATCAAT	2	12	1997989	1998000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021723	TTGCTT	2	12	2039154	2039165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021723	TCGCAG	2	12	2047332	2047343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021723	GCAAGT	2	12	2079558	2079569	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021723	TCATTT	2	12	2093093	2093104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021723	GCTCAC	2	12	2112225	2112236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021723	GCTTGT	2	12	2121336	2121347	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021723	TCGCAG	2	12	2165333	2165344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021723	TCGCAG	2	12	2217915	2217926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021723	GCTCAC	2	12	2218015	2218026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021723	ACTTGC	2	12	2240178	2240189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021723	AAAAGA	2	12	2246302	2246313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021723	GTTGCA	2	12	2264270	2264281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021723	AATTTT	2	12	2281751	2281762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021723	TTGTGC	2	12	2364051	2364062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021723	GCAACT	2	12	2365463	2365474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021723	TGACCG	2	12	2392969	2392980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021723	AGAATT	2	12	2399618	2399629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021723	TTGATG	2	12	2409842	2409853	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021723	CTGCGA	2	12	2420221	2420232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021723	TCTTAT	2	12	2432730	2432741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021723	TTTGAC	2	12	2467301	2467312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021723	CACTTC	2	12	2468576	2468587	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021723	GCTCCG	2	12	2470774	2470785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021723	GCTTAT	2	12	2513761	2513772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021723	AAAAAC	2	12	2519503	2519514	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021723	GCGAGC	2	12	2532907	2532918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021723	CAGTTT	2	12	2566553	2566564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021723	ACTTCA	2	12	2685184	2685195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021723	ATCAAA	2	12	2751346	2751357	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021723	TCTTCA	2	12	2782653	2782664	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021723	TGCCAT	2	12	2783204	2783215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021723	ATTTTT	2	12	2849905	2849916	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021723	TCGCAG	2	12	2868942	2868953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021723	AACGAC	2	12	2882033	2882044	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.