MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 1398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021723	GCAAG	2	10	3464	3473	40 %	0 %	40 %	20 %	523515600
2	NC_021723	GATCG	2	10	3654	3663	20 %	20 %	40 %	20 %	523515600
3	NC_021723	GAAAA	2	10	7386	7395	80 %	0 %	20 %	0 %	523515602
4	NC_021723	CCGGT	2	10	14622	14631	0 %	20 %	40 %	40 %	523515610
5	NC_021723	AAAAG	2	10	18584	18593	80 %	0 %	20 %	0 %	523515615
6	NC_021723	GTTGA	2	10	22693	22702	20 %	40 %	40 %	0 %	523515619
7	NC_021723	GCCGG	2	10	23638	23647	0 %	0 %	60 %	40 %	523515620
8	NC_021723	AACTG	2	10	24934	24943	40 %	20 %	20 %	20 %	523515621
9	NC_021723	GATGC	2	10	25184	25193	20 %	20 %	40 %	20 %	523515621
10	NC_021723	GAATA	2	10	25655	25664	60 %	20 %	20 %	0 %	523515623
11	NC_021723	CCGTC	2	10	28570	28579	0 %	20 %	20 %	60 %	523515624
12	NC_021723	CTGAT	2	10	29953	29962	20 %	40 %	20 %	20 %	523515626
13	NC_021723	TAGCG	2	10	31203	31212	20 %	20 %	40 %	20 %	523515627
14	NC_021723	CAAGA	2	10	32312	32321	60 %	0 %	20 %	20 %	523515629
15	NC_021723	TTGCG	2	10	35460	35469	0 %	40 %	40 %	20 %	523515633
16	NC_021723	GTGAT	2	10	40623	40632	20 %	40 %	40 %	0 %	523515638
17	NC_021723	GATCG	2	10	42681	42690	20 %	20 %	40 %	20 %	523515640
18	NC_021723	TGATT	2	10	43052	43061	20 %	60 %	20 %	0 %	523515640
19	NC_021723	AAAGC	2	10	44117	44126	60 %	0 %	20 %	20 %	523515641
20	NC_021723	AGACA	2	10	47100	47109	60 %	0 %	20 %	20 %	523515642
21	NC_021723	CCCAG	2	10	47304	47313	20 %	0 %	20 %	60 %	523515642
22	NC_021723	CATCG	2	10	51100	51109	20 %	20 %	20 %	40 %	523515645
23	NC_021723	AGCCC	2	10	54129	54138	20 %	0 %	20 %	60 %	523515647
24	NC_021723	TTGGC	2	10	54212	54221	0 %	40 %	40 %	20 %	523515647
25	NC_021723	CCGAT	2	10	57438	57447	20 %	20 %	20 %	40 %	523515649
26	NC_021723	GGCGT	2	10	59915	59924	0 %	20 %	60 %	20 %	523515651
27	NC_021723	CCAAG	2	10	59980	59989	40 %	0 %	20 %	40 %	523515651
28	NC_021723	AAGTG	2	10	61291	61300	40 %	20 %	40 %	0 %	523515652
29	NC_021723	AGCCG	2	10	64359	64368	20 %	0 %	40 %	40 %	523515655
30	NC_021723	TTGGA	2	10	68537	68546	20 %	40 %	40 %	0 %	523515657
31	NC_021723	CACGC	2	10	69909	69918	20 %	0 %	20 %	60 %	523515658
32	NC_021723	AATGG	2	10	70312	70321	40 %	20 %	40 %	0 %	523515658
33	NC_021723	AGGCC	2	10	71144	71153	20 %	0 %	40 %	40 %	523515659
34	NC_021723	GCGCC	2	10	71662	71671	0 %	0 %	40 %	60 %	523515660
35	NC_021723	GATCC	2	10	72945	72954	20 %	20 %	20 %	40 %	523515661
36	NC_021723	GTGGC	2	10	74286	74295	0 %	20 %	60 %	20 %	523515663
37	NC_021723	GCCAA	2	10	75221	75230	40 %	0 %	20 %	40 %	523515664
38	NC_021723	AAACC	2	10	75683	75692	60 %	0 %	0 %	40 %	523515665
39	NC_021723	AGATC	2	10	77697	77706	40 %	20 %	20 %	20 %	523515667
40	NC_021723	CGTTT	2	10	81189	81198	0 %	60 %	20 %	20 %	523515670
41	NC_021723	AAAAC	2	10	82477	82486	80 %	0 %	0 %	20 %	523515672
42	NC_021723	CGAAG	2	10	92024	92033	40 %	0 %	40 %	20 %	523515682
43	NC_021723	CCCAT	2	10	92040	92049	20 %	20 %	0 %	60 %	523515682
44	NC_021723	AGTCG	2	10	92178	92187	20 %	20 %	40 %	20 %	523515682
45	NC_021723	TGGGC	2	10	100707	100716	0 %	20 %	60 %	20 %	523515693
46	NC_021723	AGGGC	2	10	100760	100769	20 %	0 %	60 %	20 %	523515693
47	NC_021723	GCTTT	2	10	101414	101423	0 %	60 %	20 %	20 %	523515693
48	NC_021723	TAACG	2	10	104804	104813	40 %	20 %	20 %	20 %	523515695
49	NC_021723	CCTTG	2	10	105312	105321	0 %	40 %	20 %	40 %	523515696
50	NC_021723	TGCCT	2	10	105816	105825	0 %	40 %	20 %	40 %	523515696
51	NC_021723	TCGTC	2	10	106499	106508	0 %	40 %	20 %	40 %	523515697
52	NC_021723	TCTTT	2	10	107694	107703	0 %	80 %	0 %	20 %	523515699
53	NC_021723	ATTGT	2	10	109271	109280	20 %	60 %	20 %	0 %	523515700
54	NC_021723	AGCTG	2	10	113170	113179	20 %	20 %	40 %	20 %	523515704
55	NC_021723	AAAAC	2	10	114124	114133	80 %	0 %	0 %	20 %	523515705
56	NC_021723	CGTGG	2	10	119483	119492	0 %	20 %	60 %	20 %	523515709
57	NC_021723	ACCGC	2	10	121851	121860	20 %	0 %	20 %	60 %	523515711
58	NC_021723	GCATC	2	10	123280	123289	20 %	20 %	20 %	40 %	523515712
59	NC_021723	AGGCT	2	10	123533	123542	20 %	20 %	40 %	20 %	523515712
60	NC_021723	GAATC	2	10	124104	124113	40 %	20 %	20 %	20 %	523515713
61	NC_021723	AATCA	2	10	125837	125846	60 %	20 %	0 %	20 %	523515714
62	NC_021723	TTTTC	2	10	126154	126163	0 %	80 %	0 %	20 %	523515714
63	NC_021723	GTTTG	2	10	126894	126903	0 %	60 %	40 %	0 %	523515715
64	NC_021723	GGTCA	2	10	127409	127418	20 %	20 %	40 %	20 %	523515716
65	NC_021723	CAGCT	2	10	127632	127641	20 %	20 %	20 %	40 %	523515716
66	NC_021723	CAGCA	2	10	130212	130221	40 %	0 %	20 %	40 %	523515717
67	NC_021723	AATCA	2	10	130815	130824	60 %	20 %	0 %	20 %	523515717
68	NC_021723	GGGAT	2	10	131536	131545	20 %	20 %	60 %	0 %	523515718
69	NC_021723	TTACC	2	10	133020	133029	20 %	40 %	0 %	40 %	523515719
70	NC_021723	TAATT	2	10	137333	137342	40 %	60 %	0 %	0 %	523515723
71	NC_021723	ATCGG	2	10	138322	138331	20 %	20 %	40 %	20 %	523515724
72	NC_021723	GTTCG	2	10	139851	139860	0 %	40 %	40 %	20 %	523515726
73	NC_021723	CGGTG	2	10	140808	140817	0 %	20 %	60 %	20 %	523515727
74	NC_021723	AGATA	2	10	145223	145232	60 %	20 %	20 %	0 %	523515730
75	NC_021723	CCACT	2	10	145433	145442	20 %	20 %	0 %	60 %	523515730
76	NC_021723	TGCTG	2	10	152410	152419	0 %	40 %	40 %	20 %	523515739
77	NC_021723	ATTGC	2	10	154669	154678	20 %	40 %	20 %	20 %	523515741
78	NC_021723	GCAAT	2	10	156485	156494	40 %	20 %	20 %	20 %	523515743
79	NC_021723	AATCA	2	10	158683	158692	60 %	20 %	0 %	20 %	523515745
80	NC_021723	TCAGT	2	10	160859	160868	20 %	40 %	20 %	20 %	523515748
81	NC_021723	GAATA	2	10	162529	162538	60 %	20 %	20 %	0 %	523515751
82	NC_021723	TGGTT	2	10	162880	162889	0 %	60 %	40 %	0 %	523515752
83	NC_021723	TGAAC	2	10	163614	163623	40 %	20 %	20 %	20 %	523515752
84	NC_021723	ATACG	2	10	164076	164085	40 %	20 %	20 %	20 %	523515753
85	NC_021723	ATATT	2	10	166172	166181	40 %	60 %	0 %	0 %	523515754
86	NC_021723	GTGAA	2	10	166771	166780	40 %	20 %	40 %	0 %	523515755
87	NC_021723	CAGCC	2	10	169970	169979	20 %	0 %	20 %	60 %	523515758
88	NC_021723	GTTCA	2	10	170803	170812	20 %	40 %	20 %	20 %	523515759
89	NC_021723	TCACT	2	10	172279	172288	20 %	40 %	0 %	40 %	523515761
90	NC_021723	GGCGA	2	10	173460	173469	20 %	0 %	60 %	20 %	523515762
91	NC_021723	TTCAT	2	10	173824	173833	20 %	60 %	0 %	20 %	523515762
92	NC_021723	TCGAC	2	10	174301	174310	20 %	20 %	20 %	40 %	523515762
93	NC_021723	AAGCC	2	10	177312	177321	40 %	0 %	20 %	40 %	523515765
94	NC_021723	TTGCG	2	10	178138	178147	0 %	40 %	40 %	20 %	523515767
95	NC_021723	CACAA	2	10	182253	182262	60 %	0 %	0 %	40 %	523515770
96	NC_021723	AATAA	2	10	182701	182710	80 %	20 %	0 %	0 %	523515771
97	NC_021723	GTGAT	2	10	183878	183887	20 %	40 %	40 %	0 %	523515771
98	NC_021723	TGGTC	2	10	185108	185117	0 %	40 %	40 %	20 %	523515773
99	NC_021723	TTCGG	2	10	187320	187329	0 %	40 %	40 %	20 %	523515774
100	NC_021723	ATGTT	2	10	190294	190303	20 %	60 %	20 %	0 %	523515777
101	NC_021723	ATGCG	2	10	190345	190354	20 %	20 %	40 %	20 %	523515777
102	NC_021723	GCCGA	2	10	190935	190944	20 %	0 %	40 %	40 %	523515778
103	NC_021723	CCGTT	2	10	191008	191017	0 %	40 %	20 %	40 %	523515778
104	NC_021723	CACCG	2	10	191756	191765	20 %	0 %	20 %	60 %	523515778
105	NC_021723	AGAAA	2	10	194498	194507	80 %	0 %	20 %	0 %	523515781
106	NC_021723	CAGCC	2	10	197112	197121	20 %	0 %	20 %	60 %	523515782
107	NC_021723	GCTAT	2	10	198309	198318	20 %	40 %	20 %	20 %	523515783
108	NC_021723	GACGG	2	10	198676	198685	20 %	0 %	60 %	20 %	523515784
109	NC_021723	TCTTT	2	10	205114	205123	0 %	80 %	0 %	20 %	523515791
110	NC_021723	GATGC	2	10	207884	207893	20 %	20 %	40 %	20 %	523515793
111	NC_021723	TCGCT	2	10	207988	207997	0 %	40 %	20 %	40 %	523515793
112	NC_021723	CAAAG	2	10	210771	210780	60 %	0 %	20 %	20 %	523515797
113	NC_021723	TTCAT	2	10	211390	211399	20 %	60 %	0 %	20 %	523515798
114	NC_021723	GTTGC	2	10	218908	218917	0 %	40 %	40 %	20 %	523515812
115	NC_021723	AGAGA	2	10	224107	224116	60 %	0 %	40 %	0 %	523515820
116	NC_021723	CGATT	2	10	224551	224560	20 %	40 %	20 %	20 %	523515821
117	NC_021723	AAAGC	2	10	232296	232305	60 %	0 %	20 %	20 %	523515830
118	NC_021723	TCCGG	2	10	232373	232382	0 %	20 %	40 %	40 %	523515830
119	NC_021723	GGTTT	2	10	233615	233624	0 %	60 %	40 %	0 %	523515831
120	NC_021723	ACCGT	2	10	239254	239263	20 %	20 %	20 %	40 %	523515838
121	NC_021723	GCATC	2	10	239369	239378	20 %	20 %	20 %	40 %	523515838
122	NC_021723	CGGTT	2	10	243507	243516	0 %	40 %	40 %	20 %	523515842
123	NC_021723	AAATG	2	10	247476	247485	60 %	20 %	20 %	0 %	523515845
124	NC_021723	AGTCA	2	10	247577	247586	40 %	20 %	20 %	20 %	523515845
125	NC_021723	AATCT	2	10	253013	253022	40 %	40 %	0 %	20 %	523515851
126	NC_021723	TTTGA	2	10	254766	254775	20 %	60 %	20 %	0 %	523515853
127	NC_021723	CCGGT	2	10	255163	255172	0 %	20 %	40 %	40 %	523515853
128	NC_021723	CATTT	2	10	262526	262535	20 %	60 %	0 %	20 %	523515862
129	NC_021723	AAAGA	2	10	265374	265383	80 %	0 %	20 %	0 %	523515864
130	NC_021723	GTGGA	2	10	265594	265603	20 %	20 %	60 %	0 %	523515864
131	NC_021723	GACCA	2	10	266724	266733	40 %	0 %	20 %	40 %	523515866
132	NC_021723	AGCTT	2	10	267625	267634	20 %	40 %	20 %	20 %	523515866
133	NC_021723	CTTAA	2	10	268541	268550	40 %	40 %	0 %	20 %	523515867
134	NC_021723	CGGCA	2	10	270307	270316	20 %	0 %	40 %	40 %	523515869
135	NC_021723	TGATG	2	10	270874	270883	20 %	40 %	40 %	0 %	523515870
136	NC_021723	GGGAT	2	10	270889	270898	20 %	20 %	60 %	0 %	523515870
137	NC_021723	AGCCA	2	10	273451	273460	40 %	0 %	20 %	40 %	523515874
138	NC_021723	AATGA	2	10	274672	274681	60 %	20 %	20 %	0 %	523515875
139	NC_021723	AGGTG	2	10	276903	276912	20 %	20 %	60 %	0 %	523515876
140	NC_021723	ATTCG	2	10	283482	283491	20 %	40 %	20 %	20 %	523515878
141	NC_021723	GGAAT	2	10	283532	283541	40 %	20 %	40 %	0 %	523515878
142	NC_021723	GATGG	2	10	285574	285583	20 %	20 %	60 %	0 %	523515881
143	NC_021723	ACGCA	2	10	292508	292517	40 %	0 %	20 %	40 %	523515889
144	NC_021723	GGATG	2	10	293917	293926	20 %	20 %	60 %	0 %	523515890
145	NC_021723	CAAGC	2	10	295718	295727	40 %	0 %	20 %	40 %	523515892
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147	NC_021723	GCATT	2	10	302055	302064	20 %	40 %	20 %	20 %	523515896
148	NC_021723	CGGCA	2	10	304775	304784	20 %	0 %	40 %	40 %	523515899
149	NC_021723	CAAAA	2	10	304880	304889	80 %	0 %	0 %	20 %	523515899
150	NC_021723	AAAAG	2	10	305642	305651	80 %	0 %	20 %	0 %	523515900
151	NC_021723	GAACG	2	10	306255	306264	40 %	0 %	40 %	20 %	523515900
152	NC_021723	CCAAA	2	10	309937	309946	60 %	0 %	0 %	40 %	523515903
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154	NC_021723	TCAGG	2	10	313802	313811	20 %	20 %	40 %	20 %	523515906
155	NC_021723	GTTGG	2	10	318126	318135	0 %	40 %	60 %	0 %	523515909
156	NC_021723	GTTGG	2	10	318648	318657	0 %	40 %	60 %	0 %	523515910
157	NC_021723	GTTTG	2	10	320392	320401	0 %	60 %	40 %	0 %	523515912
158	NC_021723	TTGGC	2	10	322798	322807	0 %	40 %	40 %	20 %	523515914
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163	NC_021723	GTCTG	2	10	334870	334879	0 %	40 %	40 %	20 %	523515925
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165	NC_021723	TCACG	2	10	340382	340391	20 %	20 %	20 %	40 %	523515929
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167	NC_021723	AACGA	2	10	344393	344402	60 %	0 %	20 %	20 %	523515934
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171	NC_021723	CGGTG	2	10	349268	349277	0 %	20 %	60 %	20 %	523515939
172	NC_021723	TGGTT	2	10	349393	349402	0 %	60 %	40 %	0 %	523515939
173	NC_021723	CTGGG	2	10	355717	355726	0 %	20 %	60 %	20 %	523515946
174	NC_021723	GATCG	2	10	357283	357292	20 %	20 %	40 %	20 %	523515947
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177	NC_021723	GGTAA	2	10	359994	360003	40 %	20 %	40 %	0 %	523515950
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244	NC_021723	GCTTA	2	10	500244	500253	20 %	40 %	20 %	20 %	523516098
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246	NC_021723	TGCAA	2	10	502108	502117	40 %	20 %	20 %	20 %	523516100
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250	NC_021723	TTGCA	2	10	517774	517783	20 %	40 %	20 %	20 %	523516114
251	NC_021723	CGGGT	2	10	519385	519394	0 %	20 %	60 %	20 %	523516116
252	NC_021723	GCTTG	2	10	521958	521967	0 %	40 %	40 %	20 %	523516119
253	NC_021723	AAATT	2	10	524296	524305	60 %	40 %	0 %	0 %	523516120
254	NC_021723	ATGGC	2	10	527716	527725	20 %	20 %	40 %	20 %	523516124
255	NC_021723	GTACC	2	10	528619	528628	20 %	20 %	20 %	40 %	523516124
256	NC_021723	TTTCC	2	10	531060	531069	0 %	60 %	0 %	40 %	523516125
257	NC_021723	GAACG	2	10	531650	531659	40 %	0 %	40 %	20 %	523516126
258	NC_021723	CCGGG	2	10	531918	531927	0 %	0 %	60 %	40 %	523516126
259	NC_021723	ATGGC	2	10	532882	532891	20 %	20 %	40 %	20 %	523516126
260	NC_021723	TATGG	2	10	535280	535289	20 %	40 %	40 %	0 %	523516130
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262	NC_021723	GTGAT	2	10	547977	547986	20 %	40 %	40 %	0 %	523516140
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389	NC_021723	TGTTT	2	10	790973	790982	0 %	80 %	20 %	0 %	523516365
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