MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021723	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021723	AATG	2	8	12726	12733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021723	CTAA	2	8	15753	15760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021723	AAGA	2	8	16221	16228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021723	AATA	2	8	17797	17804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021723	TTTC	2	8	20915	20922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021723	TTAT	2	8	23967	23974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021723	GGGT	2	8	24027	24034	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021723	TTAA	3	12	25305	25316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021723	GTTT	2	8	35915	35922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021723	AAGT	2	8	36723	36730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021723	TGGG	2	8	37182	37189	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021723	AGAA	2	8	37281	37288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021723	AAGA	2	8	38429	38436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021723	AAAT	2	8	38452	38459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021723	CTTT	2	8	41701	41708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021723	TGCG	2	8	43789	43796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021723	AAAG	2	8	44058	44065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021723	TAAA	2	8	48650	48657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021723	CAGT	2	8	58093	58100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021723	GAAG	2	8	58309	58316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021723	AAGG	2	8	59072	59079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021723	CAGA	2	8	62940	62947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021723	CGTG	2	8	63431	63438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021723	TAAG	2	8	65682	65689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021723	CTGT	2	8	65717	65724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021723	TTTG	2	8	66443	66450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021723	TTCA	2	8	70355	70362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021723	TAAT	2	8	70411	70418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021723	TAAA	2	8	73912	73919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021723	CAGT	2	8	74476	74483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021723	TGAT	2	8	74498	74505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021723	TTTG	2	8	78201	78208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021723	TTGA	2	8	78334	78341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021723	GGGA	2	8	78398	78405	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021723	GCCT	2	8	81454	81461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021723	TCAG	2	8	83530	83537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021723	GCCT	2	8	83800	83807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021723	TTTA	2	8	85184	85191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021723	AAAC	2	8	85798	85805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021723	GTTT	2	8	90762	90769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021723	TGAT	2	8	91181	91188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021723	GCTT	2	8	94793	94800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021723	ATTT	2	8	95344	95351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021723	AGCC	2	8	95487	95494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021723	GTAA	2	8	95873	95880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021723	ATCA	2	8	98516	98523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021723	TTTG	2	8	101799	101806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021723	CAAA	2	8	101816	101823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021723	ATTG	2	8	106426	106433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021723	GATT	2	8	111445	111452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021723	CAAG	2	8	112365	112372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021723	TAGC	2	8	115275	115282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021723	CCTT	2	8	118220	118227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021723	ATAA	2	8	119799	119806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021723	ATAA	2	8	132560	132567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021723	TTCG	2	8	132569	132576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021723	ATTA	2	8	132697	132704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021723	GAAA	2	8	136792	136799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021723	AGCA	2	8	140141	140148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021723	GAAT	2	8	140167	140174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021723	CTAG	2	8	144312	144319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021723	CTAA	2	8	144669	144676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021723	AAGA	2	8	145777	145784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021723	CACC	2	8	146331	146338	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_021723	TCCC	2	8	147345	147352	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_021723	CTTT	2	8	148942	148949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021723	TGAA	2	8	149089	149096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021723	CAAA	2	8	151494	151501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021723	TAGT	2	8	158281	158288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021723	GTAA	2	8	158747	158754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021723	TTAC	2	8	161218	161225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021723	TAAG	2	8	161234	161241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021723	AGTA	2	8	171420	171427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021723	TTTG	2	8	172010	172017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021723	TTAA	2	8	172867	172874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021723	GTTT	2	8	172969	172976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021723	TTTA	2	8	179322	179329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021723	TAAT	2	8	184035	184042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021723	TTTA	2	8	189817	189824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021723	TTGC	2	8	192612	192619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021723	ATTA	2	8	197325	197332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021723	TAAA	2	8	197394	197401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021723	AAAT	2	8	197449	197456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021723	TGAA	2	8	201155	201162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021723	CTTT	2	8	201736	201743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021723	TTAA	2	8	210462	210469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021723	AAAG	2	8	214351	214358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021723	TGGG	2	8	219760	219767	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021723	CGCT	2	8	220656	220663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021723	TTTG	2	8	220726	220733	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021723	TGAT	2	8	221527	221534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021723	TGTT	2	8	222516	222523	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021723	TTTC	2	8	228223	228230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021723	AGCG	2	8	237513	237520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021723	GTGC	2	8	238576	238583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021723	ATTT	2	8	239659	239666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021723	ATTT	2	8	241323	241330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021723	TACA	2	8	254490	254497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021723	AAGA	2	8	254512	254519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021723	AGTT	2	8	268051	268058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021723	GATG	2	8	269435	269442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021723	AGAC	2	8	269633	269640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021723	CTAG	2	8	274455	274462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021723	GTCA	2	8	277190	277197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021723	TGGA	2	8	277674	277681	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021723	GTGA	2	8	277853	277860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021723	AGCG	2	8	278023	278030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021723	ATGG	2	8	278688	278695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021723	GAGC	2	8	278907	278914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021723	TAAG	2	8	279303	279310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021723	AGAA	2	8	279433	279440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021723	GCGA	2	8	279462	279469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021723	GCTT	2	8	279494	279501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021723	GTAG	2	8	279913	279920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021723	ATGT	2	8	279996	280003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021723	GAGC	2	8	280904	280911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021723	TAGG	2	8	281350	281357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021723	CTGC	2	8	282331	282338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021723	TCCT	2	8	282680	282687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021723	TTAT	2	8	284327	284334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021723	CAAT	2	8	294345	294352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021723	CTTG	2	8	294388	294395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021723	CCAA	2	8	294418	294425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021723	ATTG	2	8	298412	298419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021723	TTGC	2	8	298432	298439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021723	ATTT	2	8	298441	298448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021723	GAAA	2	8	298635	298642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021723	AAAG	2	8	300727	300734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021723	GTGG	2	8	301623	301630	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021723	ACAT	2	8	307528	307535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021723	TGGG	2	8	307553	307560	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021723	CTGG	2	8	310231	310238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021723	ACAG	2	8	311635	311642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021723	TGGT	2	8	311878	311885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021723	TCGA	2	8	315331	315338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021723	CATT	2	8	315387	315394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021723	GCCA	2	8	315888	315895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021723	TGAT	2	8	315914	315921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021723	TAAA	2	8	323573	323580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021723	AGAA	2	8	325682	325689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021723	GATT	2	8	325821	325828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021723	GGCG	2	8	329203	329210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021723	ATCA	2	8	330501	330508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021723	GTGG	2	8	335106	335113	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021723	CATT	2	8	341799	341806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021723	TGCT	2	8	343059	343066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021723	TTCC	2	8	343204	343211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021723	TGCT	2	8	343317	343324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021723	TTCA	2	8	343438	343445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021723	CTGC	2	8	343509	343516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021723	GTCT	2	8	345655	345662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021723	CCGC	2	8	348318	348325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
154	NC_021723	TGAT	2	8	353882	353889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021723	GCAG	2	8	358376	358383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_021723	GTTG	2	8	358408	358415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021723	CATT	2	8	370455	370462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021723	GCTT	2	8	370556	370563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_021723	ATCA	2	8	397912	397919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_021723	AGGG	2	8	398066	398073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_021723	TGTT	2	8	408148	408155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021723	AACA	2	8	420312	420319	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_021723	TTTG	2	8	420577	420584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_021723	ATCA	2	8	426640	426647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_021723	ATTG	2	8	427657	427664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021723	ATTG	2	8	427827	427834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021723	AATC	2	8	434547	434554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_021723	ATTT	2	8	441373	441380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021723	TATG	2	8	449931	449938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021723	TATG	2	8	450108	450115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_021723	AATT	2	8	456483	456490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_021723	CTAG	2	8	458784	458791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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241	NC_021723	TTCT	2	8	535913	535920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
242	NC_021723	TAGT	2	8	539762	539769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_021723	TTTG	2	8	589429	589436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021723	AGAC	2	8	592210	592217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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271	NC_021723	CATT	2	8	624302	624309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
272	NC_021723	ATGC	2	8	626350	626357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_021723	TTAA	2	8	631110	631117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021723	GTTG	2	8	650186	650193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021723	AACT	2	8	650211	650218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
283	NC_021723	CGTT	2	8	650230	650237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_021723	AGAA	2	8	689695	689702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021723	AATA	2	8	689718	689725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021723	ACGG	2	8	692809	692816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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