MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 4796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021723	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021723	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021723	TGG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021723	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021723	GAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021723	AGT	2	6	10473	10478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021723	TTA	2	6	10538	10543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021723	AGG	2	6	10583	10588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021723	AGG	2	6	11592	11597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021723	AGT	2	6	12863	12868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021723	AGG	2	6	12942	12947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021723	AGG	2	6	15510	15515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021723	ACA	2	6	16167	16172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021723	TTC	2	6	16211	16216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021723	GTA	2	6	16238	16243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021723	TGA	2	6	16256	16261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021723	ATT	2	6	16271	16276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021723	TTG	2	6	16539	16544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021723	ATG	2	6	16740	16745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021723	ATT	2	6	16775	16780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021723	ATG	2	6	16781	16786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021723	AAT	2	6	16922	16927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021723	CAA	2	6	16936	16941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021723	TTC	2	6	16951	16956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021723	ATG	2	6	18015	18020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021723	TGA	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021723	ATG	3	9	19053	19061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021723	ATC	2	6	19185	19190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021723	TCT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021723	AAT	2	6	21074	21079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021723	ATC	2	6	21086	21091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021723	GGC	2	6	21137	21142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021723	AAT	3	9	21167	21175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021723	AAC	2	6	21194	21199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021723	CTG	2	6	21242	21247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021723	CAA	2	6	21277	21282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021723	ATG	2	6	21347	21352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021723	CAA	2	6	21355	21360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021723	ATT	2	6	21393	21398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021723	AGG	2	6	23846	23851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021723	CCT	2	6	28783	28788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021723	GTT	2	6	28837	28842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021723	TAA	2	6	28847	28852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021723	TGT	2	6	28901	28906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021723	GCG	2	6	30354	30359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021723	TCA	2	6	30452	30457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021723	GCA	2	6	30467	30472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021723	TGC	2	6	31272	31277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021723	TCA	2	6	31374	31379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021723	AAG	2	6	31420	31425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021723	TGA	2	6	32107	32112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021723	ATC	2	6	32126	32131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021723	GAT	2	6	33320	33325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021723	TCA	2	6	35024	35029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021723	TCT	2	6	35085	35090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021723	CGA	2	6	35771	35776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021723	AGA	2	6	35833	35838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021723	AAT	2	6	36107	36112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021723	GGA	2	6	36117	36122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021723	TGA	2	6	36284	36289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021723	ATG	2	6	36333	36338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021723	CTT	3	9	36417	36425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021723	TCC	2	6	36445	36450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021723	GAA	2	6	36477	36482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021723	TCA	2	6	36496	36501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021723	TAT	2	6	36576	36581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021723	TGC	3	9	36635	36643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021723	TCT	2	6	36649	36654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021723	TGT	2	6	36712	36717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021723	TGT	2	6	36816	36821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021723	TCG	2	6	36823	36828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021723	TGA	2	6	36958	36963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021723	AAC	2	6	37012	37017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021723	ATT	2	6	37200	37205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021723	AAG	2	6	37243	37248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021723	TTG	2	6	37688	37693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021723	CAA	2	6	37753	37758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021723	GGT	2	6	37814	37819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021723	ACC	2	6	38065	38070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021723	ATT	2	6	38073	38078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021723	GCT	2	6	38079	38084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021723	AGT	2	6	38228	38233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021723	CAA	2	6	38240	38245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021723	TTG	2	6	38360	38365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021723	TGA	2	6	38395	38400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021723	ACC	2	6	38514	38519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021723	AGC	2	6	41665	41670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021723	CAG	2	6	43697	43702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021723	TAA	2	6	43714	43719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021723	ATT	2	6	43948	43953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021723	GTT	2	6	43954	43959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021723	CAA	2	6	46501	46506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021723	TGG	2	6	48703	48708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021723	AAC	2	6	48786	48791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021723	GAA	2	6	49603	49608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021723	ATG	2	6	54796	54801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021723	CCT	2	6	54804	54809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021723	CAA	2	6	54951	54956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021723	GTT	2	6	54968	54973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021723	CAA	2	6	56612	56617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021723	CCT	2	6	58008	58013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021723	TGT	2	6	59028	59033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021723	GAA	2	6	62669	62674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021723	TGG	2	6	62769	62774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021723	TAT	2	6	62871	62876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021723	TTG	2	6	62894	62899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021723	CAA	2	6	63924	63929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021723	CAT	2	6	64082	64087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021723	GCA	2	6	65556	65561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021723	TGA	2	6	65571	65576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021723	GTT	2	6	65625	65630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021723	TTC	2	6	65728	65733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021723	GAC	2	6	65810	65815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021723	GAA	2	6	65881	65886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021723	TCA	2	6	66392	66397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021723	GGT	2	6	66406	66411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021723	TGC	2	6	66417	66422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021723	GTG	2	6	70425	70430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021723	CGA	2	6	71225	71230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021723	GCC	2	6	71232	71237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021723	CCT	2	6	73867	73872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021723	TAA	2	6	74460	74465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021723	GAA	2	6	74604	74609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021723	GAC	2	6	74660	74665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021723	TCC	2	6	78195	78200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021723	AAT	2	6	78366	78371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021723	TGC	2	6	80613	80618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021723	TGA	2	6	80691	80696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021723	TGC	2	6	80738	80743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021723	AGG	2	6	80835	80840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021723	AAT	2	6	82158	82163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021723	CTT	2	6	82812	82817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021723	CAA	2	6	83480	83485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021723	ATA	2	6	83566	83571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021723	AAC	2	6	83575	83580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021723	TAA	2	6	83785	83790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021723	AGA	2	6	84775	84780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021723	AAC	2	6	84787	84792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021723	CAT	2	6	85036	85041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021723	TCC	2	6	85127	85132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021723	TAT	2	6	85169	85174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021723	GAG	2	6	85222	85227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021723	TTG	2	6	85487	85492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021723	AAG	2	6	85509	85514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021723	TTG	2	6	85824	85829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021723	TAC	2	6	85875	85880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021723	ATC	2	6	85894	85899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021723	ATG	2	6	85910	85915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021723	CTT	2	6	86227	86232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021723	GCA	2	6	86274	86279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021723	CCT	2	6	90783	90788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_021723	GTT	2	6	90792	90797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021723	GTT	2	6	90808	90813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_021723	ACC	2	6	90910	90915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_021723	ATC	2	6	91081	91086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_021723	CAA	2	6	93229	93234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_021723	TGG	2	6	93260	93265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021723	CTC	2	6	95094	95099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_021723	AAG	2	6	95157	95162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021723	GCA	2	6	95176	95181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_021723	TAC	2	6	95655	95660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021723	TGA	2	6	95672	95677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021723	TCC	2	6	101754	101759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_021723	CAC	2	6	101966	101971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_021723	CAA	2	6	102524	102529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_021723	TTA	2	6	102588	102593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021723	TGG	2	6	102631	102636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021723	GTT	2	6	102765	102770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021723	TAA	2	6	106283	106288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_021723	ACA	2	6	108556	108561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_021723	TAT	3	9	108574	108582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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