MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919 plasmid pLOCK919

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021722	CGTCA	2	10	1349	1358	20 %	20 %	20 %	40 %	523515564
2	NC_021722	TCAAC	2	10	7264	7273	40 %	20 %	0 %	40 %	523515572
3	NC_021722	AGCCA	2	10	10799	10808	40 %	0 %	20 %	40 %	523515574
4	NC_021722	CAGTT	2	10	11539	11548	20 %	40 %	20 %	20 %	523515575
5	NC_021722	TTAAC	2	10	13317	13326	40 %	40 %	0 %	20 %	523515575
6	NC_021722	CAGCG	2	10	14074	14083	20 %	0 %	40 %	40 %	523515575
7	NC_021722	TGTCA	2	10	14621	14630	20 %	40 %	20 %	20 %	523515576
8	NC_021722	ATCAG	2	10	16874	16883	40 %	20 %	20 %	20 %	523515578
9	NC_021722	TTGAT	2	10	20729	20738	20 %	60 %	20 %	0 %	523515583
10	NC_021722	ATAAA	2	10	20824	20833	80 %	20 %	0 %	0 %	523515583
11	NC_021722	GGTGT	2	10	22749	22758	0 %	40 %	60 %	0 %	523515585
12	NC_021722	CGATG	2	10	23291	23300	20 %	20 %	40 %	20 %	523515585
13	NC_021722	CTATT	2	10	26815	26824	20 %	60 %	0 %	20 %	523515591
14	NC_021722	CAACT	2	10	27766	27775	40 %	20 %	0 %	40 %	523515592
15	NC_021722	CAAAG	2	10	27911	27920	60 %	0 %	20 %	20 %	523515592
16	NC_021722	GCATT	2	10	29351	29360	20 %	40 %	20 %	20 %	523515594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.