MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LOCK919 plasmid pLOCK919

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021722	GAAA	2	8	999	1006	75 %	0 %	25 %	0 %	523515563
2	NC_021722	AACA	2	8	1299	1306	75 %	0 %	0 %	25 %	523515564
3	NC_021722	CGAC	2	8	1415	1422	25 %	0 %	25 %	50 %	523515564
4	NC_021722	CAAA	2	8	1540	1547	75 %	0 %	0 %	25 %	523515564
5	NC_021722	AAAG	2	8	1780	1787	75 %	0 %	25 %	0 %	523515564
6	NC_021722	TTTG	2	8	1851	1858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021722	CTTA	2	8	1888	1895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021722	TTCT	2	8	2379	2386	0 %	75 %	0 %	25 %	523515565
9	NC_021722	CGTG	2	8	2546	2553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021722	CTCC	2	8	2597	2604	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_021722	CTTG	2	8	2816	2823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021722	TTCA	2	8	3251	3258	25 %	50 %	0 %	25 %	523515566
13	NC_021722	GCGT	2	8	3562	3569	0 %	25 %	50 %	25 %	523515568
14	NC_021722	AGGA	2	8	5493	5500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021722	GTTA	2	8	5579	5586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021722	TGGC	2	8	5686	5693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021722	AGCC	2	8	6264	6271	25 %	0 %	25 %	50 %	523515571
18	NC_021722	ACCA	2	8	6477	6484	50 %	0 %	0 %	50 %	523515571
19	NC_021722	GAAG	2	8	7149	7156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021722	CAAA	2	8	7166	7173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021722	AGAA	2	8	7182	7189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021722	GGCA	2	8	7668	7675	25 %	0 %	50 %	25 %	523515572
23	NC_021722	CAAA	2	8	7826	7833	75 %	0 %	0 %	25 %	523515572
24	NC_021722	TGAC	2	8	8505	8512	25 %	25 %	25 %	25 %	523515572
25	NC_021722	CTTC	2	8	8559	8566	0 %	50 %	0 %	50 %	523515572
26	NC_021722	CAAG	2	8	8635	8642	50 %	0 %	25 %	25 %	523515572
27	NC_021722	GACG	2	8	8773	8780	25 %	0 %	50 %	25 %	523515572
28	NC_021722	CAAG	2	8	8902	8909	50 %	0 %	25 %	25 %	523515572
29	NC_021722	TTGA	2	8	9038	9045	25 %	50 %	25 %	0 %	523515572
30	NC_021722	GAAA	2	8	9130	9137	75 %	0 %	25 %	0 %	523515572
31	NC_021722	TTGA	2	8	9907	9914	25 %	50 %	25 %	0 %	523515573
32	NC_021722	GATG	2	8	10213	10220	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021722	ATCA	2	8	11645	11652	50 %	25 %	0 %	25 %	523515575
34	NC_021722	GCCA	2	8	12083	12090	25 %	0 %	25 %	50 %	523515575
35	NC_021722	GAAA	2	8	12481	12488	75 %	0 %	25 %	0 %	523515575
36	NC_021722	GCAA	2	8	12693	12700	50 %	0 %	25 %	25 %	523515575
37	NC_021722	AATG	2	8	12856	12863	50 %	25 %	25 %	0 %	523515575
38	NC_021722	CAGG	2	8	12921	12928	25 %	0 %	50 %	25 %	523515575
39	NC_021722	CAAT	2	8	12976	12983	50 %	25 %	0 %	25 %	523515575
40	NC_021722	AGCT	2	8	13090	13097	25 %	25 %	25 %	25 %	523515575
41	NC_021722	CCAT	2	8	13649	13656	25 %	25 %	0 %	50 %	523515575
42	NC_021722	TCCG	2	8	14146	14153	0 %	25 %	25 %	50 %	523515576
43	NC_021722	GCAG	2	8	14330	14337	25 %	0 %	50 %	25 %	523515576
44	NC_021722	AATC	2	8	14649	14656	50 %	25 %	0 %	25 %	523515576
45	NC_021722	ATTT	2	8	14665	14672	25 %	75 %	0 %	0 %	523515576
46	NC_021722	AAGA	2	8	15410	15417	75 %	0 %	25 %	0 %	523515577
47	NC_021722	AAAC	2	8	15666	15673	75 %	0 %	0 %	25 %	523515577
48	NC_021722	CAAG	2	8	15888	15895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021722	TTGA	2	8	15969	15976	25 %	50 %	25 %	0 %	523515578
50	NC_021722	TGAC	2	8	16891	16898	25 %	25 %	25 %	25 %	523515578
51	NC_021722	GCCT	2	8	16903	16910	0 %	25 %	25 %	50 %	523515578
52	NC_021722	ATGA	2	8	17174	17181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021722	TGCT	2	8	17390	17397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021722	AGTA	2	8	17934	17941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021722	TTAG	2	8	18054	18061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021722	AACT	2	8	18604	18611	50 %	25 %	0 %	25 %	523515580
57	NC_021722	ATTA	2	8	18671	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	523515580
58	NC_021722	ATTT	2	8	18814	18821	25 %	75 %	0 %	0 %	523515580
59	NC_021722	ACCA	2	8	19105	19112	50 %	0 %	0 %	50 %	523515581
60	NC_021722	TCTT	2	8	19378	19385	0 %	75 %	0 %	25 %	523515582
61	NC_021722	GTCA	2	8	19677	19684	25 %	25 %	25 %	25 %	523515582
62	NC_021722	TCCG	2	8	20181	20188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021722	TTTA	2	8	20212	20219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021722	CAAG	2	8	20559	20566	50 %	0 %	25 %	25 %	523515583
65	NC_021722	CCAG	2	8	21737	21744	25 %	0 %	25 %	50 %	523515584
66	NC_021722	ACCA	2	8	22456	22463	50 %	0 %	0 %	50 %	523515585
67	NC_021722	CCAA	2	8	22720	22727	50 %	0 %	0 %	50 %	523515585
68	NC_021722	GTGC	2	8	23301	23308	0 %	25 %	50 %	25 %	523515585
69	NC_021722	ACCA	2	8	23466	23473	50 %	0 %	0 %	50 %	523515585
70	NC_021722	CCAA	2	8	23512	23519	50 %	0 %	0 %	50 %	523515585
71	NC_021722	CTAA	2	8	24167	24174	50 %	25 %	0 %	25 %	523515585
72	NC_021722	TTGT	2	8	24365	24372	0 %	75 %	25 %	0 %	523515586
73	NC_021722	AAAT	2	8	25548	25555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021722	TGGC	2	8	25572	25579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021722	ACTG	2	8	25730	25737	25 %	25 %	25 %	25 %	523515589
76	NC_021722	ACGT	2	8	26043	26050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021722	AAGG	2	8	26075	26082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021722	CGAT	2	8	26129	26136	25 %	25 %	25 %	25 %	523515590
79	NC_021722	TTTA	2	8	26374	26381	25 %	75 %	0 %	0 %	523515590
80	NC_021722	GCTG	2	8	26635	26642	0 %	25 %	50 %	25 %	523515591
81	NC_021722	CAAG	2	8	27575	27582	50 %	0 %	25 %	25 %	523515591
82	NC_021722	TCTT	2	8	27980	27987	0 %	75 %	0 %	25 %	523515592
83	NC_021722	CAAT	2	8	28966	28973	50 %	25 %	0 %	25 %	523515594
84	NC_021722	AATT	2	8	29022	29029	50 %	50 %	0 %	0 %	523515594
85	NC_021722	TCAT	2	8	29188	29195	25 %	50 %	0 %	25 %	523515594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.