MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 1623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	CAAAC	2	10	650	659	60 %	0 %	0 %	40 %	523512491
2	NC_021721	CAACG	2	10	1763	1772	40 %	0 %	20 %	40 %	523512492
3	NC_021721	ATGAA	2	10	2803	2812	60 %	20 %	20 %	0 %	523512493
4	NC_021721	GAAGA	2	10	4911	4920	60 %	0 %	40 %	0 %	523512497
5	NC_021721	GGCAC	2	10	5397	5406	20 %	0 %	40 %	40 %	523512497
6	NC_021721	GACAA	2	10	5671	5680	60 %	0 %	20 %	20 %	523512497
7	NC_021721	GAAAA	2	10	7756	7765	80 %	0 %	20 %	0 %	523512498
8	NC_021721	CATTT	2	10	9996	10005	20 %	60 %	0 %	20 %	523512499
9	NC_021721	ATTGA	2	10	17559	17568	40 %	40 %	20 %	0 %	523512510
10	NC_021721	CAACC	2	10	18892	18901	40 %	0 %	0 %	60 %	523512512
11	NC_021721	TGGCT	2	10	20480	20489	0 %	40 %	40 %	20 %	523512515
12	NC_021721	GCTTT	2	10	22032	22041	0 %	60 %	20 %	20 %	523512516
13	NC_021721	CAGCG	2	10	22679	22688	20 %	0 %	40 %	40 %	523512516
14	NC_021721	TCCTG	2	10	25604	25613	0 %	40 %	20 %	40 %	523512519
15	NC_021721	TTGTT	2	10	26393	26402	0 %	80 %	20 %	0 %	523512520
16	NC_021721	AAGCC	2	10	30979	30988	40 %	0 %	20 %	40 %	523512523
17	NC_021721	CAAAG	2	10	31823	31832	60 %	0 %	20 %	20 %	523512524
18	NC_021721	AGCGA	2	10	40085	40094	40 %	0 %	40 %	20 %	523512532
19	NC_021721	TTTCT	2	10	40332	40341	0 %	80 %	0 %	20 %	523512533
20	NC_021721	GTTTG	2	10	45977	45986	0 %	60 %	40 %	0 %	523512539
21	NC_021721	TGGAT	2	10	46042	46051	20 %	40 %	40 %	0 %	523512539
22	NC_021721	GAAAA	2	10	48335	48344	80 %	0 %	20 %	0 %	523512543
23	NC_021721	TTGAA	2	10	48760	48769	40 %	40 %	20 %	0 %	523512543
24	NC_021721	TCAAT	2	10	49771	49780	40 %	40 %	0 %	20 %	523512544
25	NC_021721	ATGAA	2	10	50521	50530	60 %	20 %	20 %	0 %	523512545
26	NC_021721	TTTCT	2	10	52683	52692	0 %	80 %	0 %	20 %	523512548
27	NC_021721	TTCTT	2	10	53631	53640	0 %	80 %	0 %	20 %	523512549
28	NC_021721	TGATC	2	10	60784	60793	20 %	40 %	20 %	20 %	523512555
29	NC_021721	CAGTT	2	10	63283	63292	20 %	40 %	20 %	20 %	523512556
30	NC_021721	TTGAT	2	10	70307	70316	20 %	60 %	20 %	0 %	523512564
31	NC_021721	TTGCT	2	10	70400	70409	0 %	60 %	20 %	20 %	523512564
32	NC_021721	CGTTT	2	10	72300	72309	0 %	60 %	20 %	20 %	523512566
33	NC_021721	TAAGT	2	10	76158	76167	40 %	40 %	20 %	0 %	523512571
34	NC_021721	TCATC	2	10	77707	77716	20 %	40 %	0 %	40 %	523512573
35	NC_021721	TGGCA	2	10	81364	81373	20 %	20 %	40 %	20 %	523512575
36	NC_021721	GTTTC	2	10	84145	84154	0 %	60 %	20 %	20 %	523512578
37	NC_021721	TGTGC	2	10	85271	85280	0 %	40 %	40 %	20 %	523512579
38	NC_021721	AAATA	2	10	85725	85734	80 %	20 %	0 %	0 %	523512580
39	NC_021721	TGCTT	2	10	86342	86351	0 %	60 %	20 %	20 %	523512580
40	NC_021721	ATCCA	2	10	86805	86814	40 %	20 %	0 %	40 %	523512581
41	NC_021721	AACCA	2	10	87180	87189	60 %	0 %	0 %	40 %	523512581
42	NC_021721	GGAAC	2	10	90830	90839	40 %	0 %	40 %	20 %	523512586
43	NC_021721	GGTTG	2	10	91015	91024	0 %	40 %	60 %	0 %	523512586
44	NC_021721	TAGCA	2	10	91737	91746	40 %	20 %	20 %	20 %	523512587
45	NC_021721	CCAAC	2	10	91830	91839	40 %	0 %	0 %	60 %	523512588
46	NC_021721	TCCCA	2	10	92877	92886	20 %	20 %	0 %	60 %	523512589
47	NC_021721	GCTTT	2	10	96518	96527	0 %	60 %	20 %	20 %	523512592
48	NC_021721	ATTGA	2	10	99772	99781	40 %	40 %	20 %	0 %	523512594
49	NC_021721	CAAAA	2	10	102446	102455	80 %	0 %	0 %	20 %	523512599
50	NC_021721	ATTTC	2	10	102972	102981	20 %	60 %	0 %	20 %	523512599
51	NC_021721	GAAGA	2	10	109298	109307	60 %	0 %	40 %	0 %	523512604
52	NC_021721	GAAAA	2	10	109316	109325	80 %	0 %	20 %	0 %	523512604
53	NC_021721	CAAAG	2	10	109382	109391	60 %	0 %	20 %	20 %	523512604
54	NC_021721	TGACA	2	10	116439	116448	40 %	20 %	20 %	20 %	523512609
55	NC_021721	GTTTT	2	10	118022	118031	0 %	80 %	20 %	0 %	523512611
56	NC_021721	AGACC	2	10	121222	121231	40 %	0 %	20 %	40 %	523512612
57	NC_021721	GCTTC	2	10	121322	121331	0 %	40 %	20 %	40 %	523512612
58	NC_021721	CGGCC	2	10	123852	123861	0 %	0 %	40 %	60 %	523512614
59	NC_021721	CGTCA	2	10	124164	124173	20 %	20 %	20 %	40 %	523512614
60	NC_021721	CTCAA	2	10	124435	124444	40 %	20 %	0 %	40 %	523512614
61	NC_021721	ACCAA	2	10	124706	124715	60 %	0 %	0 %	40 %	523512614
62	NC_021721	CAAGT	2	10	125666	125675	40 %	20 %	20 %	20 %	523512615
63	NC_021721	GACCC	2	10	127114	127123	20 %	0 %	20 %	60 %	523512616
64	NC_021721	TTGGC	2	10	129218	129227	0 %	40 %	40 %	20 %	523512617
65	NC_021721	TGTGT	2	10	130755	130764	0 %	60 %	40 %	0 %	523512619
66	NC_021721	ATACT	2	10	137568	137577	40 %	40 %	0 %	20 %	523512626
67	NC_021721	ATTGC	2	10	140681	140690	20 %	40 %	20 %	20 %	523512629
68	NC_021721	TGATC	2	10	141511	141520	20 %	40 %	20 %	20 %	523512630
69	NC_021721	CATGC	2	10	142641	142650	20 %	20 %	20 %	40 %	523512631
70	NC_021721	CGATC	2	10	147823	147832	20 %	20 %	20 %	40 %	523512637
71	NC_021721	ATTTG	2	10	150603	150612	20 %	60 %	20 %	0 %	523512640
72	NC_021721	AAAGC	2	10	153887	153896	60 %	0 %	20 %	20 %	523512645
73	NC_021721	GGGAT	2	10	155049	155058	20 %	20 %	60 %	0 %	523512646
74	NC_021721	GCTCA	2	10	155384	155393	20 %	20 %	20 %	40 %	523512646
75	NC_021721	AGTCG	2	10	160237	160246	20 %	20 %	40 %	20 %	523512652
76	NC_021721	ATATT	2	10	160906	160915	40 %	60 %	0 %	0 %	523512652
77	NC_021721	TGAAC	2	10	160922	160931	40 %	20 %	20 %	20 %	523512652
78	NC_021721	ATTAC	2	10	163174	163183	40 %	40 %	0 %	20 %	523512654
79	NC_021721	TTTTC	2	10	166564	166573	0 %	80 %	0 %	20 %	523512658
80	NC_021721	CAAGC	2	10	167954	167963	40 %	0 %	20 %	40 %	523512659
81	NC_021721	AATGA	2	10	169254	169263	60 %	20 %	20 %	0 %	523512660
82	NC_021721	CCAAC	2	10	169822	169831	40 %	0 %	0 %	60 %	523512661
83	NC_021721	GCCTT	2	10	171714	171723	0 %	40 %	20 %	40 %	523512663
84	NC_021721	GTAAG	2	10	175850	175859	40 %	20 %	40 %	0 %	523512667
85	NC_021721	CACAA	2	10	177284	177293	60 %	0 %	0 %	40 %	523512668
86	NC_021721	GACCA	2	10	179399	179408	40 %	0 %	20 %	40 %	523512670
87	NC_021721	TGGTC	2	10	179853	179862	0 %	40 %	40 %	20 %	523512671
88	NC_021721	AAAAG	2	10	181337	181346	80 %	0 %	20 %	0 %	523512672
89	NC_021721	TGAAT	2	10	184248	184257	40 %	40 %	20 %	0 %	523512674
90	NC_021721	ATCAA	2	10	185701	185710	60 %	20 %	0 %	20 %	523512676
91	NC_021721	CCGTC	2	10	186470	186479	0 %	20 %	20 %	60 %	523512677
92	NC_021721	AGTTG	2	10	187483	187492	20 %	40 %	40 %	0 %	523512677
93	NC_021721	CCGTT	2	10	189749	189758	0 %	40 %	20 %	40 %	523512680
94	NC_021721	CCAAC	2	10	192158	192167	40 %	0 %	0 %	60 %	523512682
95	NC_021721	GAACC	2	10	193409	193418	40 %	0 %	20 %	40 %	523512682
96	NC_021721	TGAAG	2	10	194807	194816	40 %	20 %	40 %	0 %	523512683
97	NC_021721	CAGCC	2	10	195719	195728	20 %	0 %	20 %	60 %	523512683
98	NC_021721	GCGGT	2	10	196852	196861	0 %	20 %	60 %	20 %	523512686
99	NC_021721	TCCTT	2	10	199591	199600	0 %	60 %	0 %	40 %	523512688
100	NC_021721	GTTGA	2	10	204353	204362	20 %	40 %	40 %	0 %	523512691
101	NC_021721	CGTTG	2	10	206578	206587	0 %	40 %	40 %	20 %	523512693
102	NC_021721	AGATG	2	10	207554	207563	40 %	20 %	40 %	0 %	523512694
103	NC_021721	TTCAT	2	10	210041	210050	20 %	60 %	0 %	20 %	523512698
104	NC_021721	GGCAT	2	10	212945	212954	20 %	20 %	40 %	20 %	523512703
105	NC_021721	CGGCA	2	10	213549	213558	20 %	0 %	40 %	40 %	523512704
106	NC_021721	GCCAA	2	10	218535	218544	40 %	0 %	20 %	40 %	523512712
107	NC_021721	CTGGG	2	10	221302	221311	0 %	20 %	60 %	20 %	523512716
108	NC_021721	ACTTC	2	10	223464	223473	20 %	40 %	0 %	40 %	523512718
109	NC_021721	GTAGA	2	10	223910	223919	40 %	20 %	40 %	0 %	523512719
110	NC_021721	GCTTG	2	10	225715	225724	0 %	40 %	40 %	20 %	523512721
111	NC_021721	CGTCA	2	10	229679	229688	20 %	20 %	20 %	40 %	523512725
112	NC_021721	TCAAT	2	10	229803	229812	40 %	40 %	0 %	20 %	523512725
113	NC_021721	AAATC	2	10	236684	236693	60 %	20 %	0 %	20 %	523512731
114	NC_021721	TGGAA	2	10	237749	237758	40 %	20 %	40 %	0 %	523512732
115	NC_021721	CAGAA	2	10	238253	238262	60 %	0 %	20 %	20 %	523512732
116	NC_021721	ATTTG	2	10	241478	241487	20 %	60 %	20 %	0 %	523512735
117	NC_021721	AAATG	2	10	244907	244916	60 %	20 %	20 %	0 %	523512737
118	NC_021721	CAAAA	2	10	245427	245436	80 %	0 %	0 %	20 %	523512737
119	NC_021721	ACTGG	2	10	245619	245628	20 %	20 %	40 %	20 %	523512738
120	NC_021721	CCATG	2	10	246823	246832	20 %	20 %	20 %	40 %	523512739
121	NC_021721	GAGTC	2	10	248589	248598	20 %	20 %	40 %	20 %	523512741
122	NC_021721	ACTCA	2	10	249562	249571	40 %	20 %	0 %	40 %	523512742
123	NC_021721	ATTTG	2	10	250208	250217	20 %	60 %	20 %	0 %	523512744
124	NC_021721	TTTGA	2	10	254101	254110	20 %	60 %	20 %	0 %	523512746
125	NC_021721	AGTTG	2	10	256867	256876	20 %	40 %	40 %	0 %	523512750
126	NC_021721	TGATT	2	10	257646	257655	20 %	60 %	20 %	0 %	523512751
127	NC_021721	TGTCA	2	10	257890	257899	20 %	40 %	20 %	20 %	523512751
128	NC_021721	TGATC	2	10	261694	261703	20 %	40 %	20 %	20 %	523512754
129	NC_021721	AACTT	2	10	263713	263722	40 %	40 %	0 %	20 %	523512756
130	NC_021721	CAAAC	2	10	267380	267389	60 %	0 %	0 %	40 %	523512760
131	NC_021721	GATCG	2	10	268644	268653	20 %	20 %	40 %	20 %	523512762
132	NC_021721	AGATC	2	10	270750	270759	40 %	20 %	20 %	20 %	523512764
133	NC_021721	GCACT	2	10	270983	270992	20 %	20 %	20 %	40 %	523512764
134	NC_021721	ATTCG	2	10	278505	278514	20 %	40 %	20 %	20 %	523512767
135	NC_021721	ATGCT	2	10	280461	280470	20 %	40 %	20 %	20 %	523512769
136	NC_021721	ATGGC	2	10	280590	280599	20 %	20 %	40 %	20 %	523512769
137	NC_021721	GATCG	2	10	281709	281718	20 %	20 %	40 %	20 %	523512770
138	NC_021721	TTGCT	2	10	282606	282615	0 %	60 %	20 %	20 %	523512771
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141	NC_021721	AATCG	2	10	286030	286039	40 %	20 %	20 %	20 %	523512775
142	NC_021721	ATTGG	2	10	288721	288730	20 %	40 %	40 %	0 %	523512778
143	NC_021721	CGTCA	2	10	291797	291806	20 %	20 %	20 %	40 %	523512780
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147	NC_021721	TGCTT	2	10	299078	299087	0 %	60 %	20 %	20 %	523512788
148	NC_021721	GATTG	2	10	299760	299769	20 %	40 %	40 %	0 %	523512788
149	NC_021721	TGTTT	2	10	301068	301077	0 %	80 %	20 %	0 %	523512789
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151	NC_021721	TCTGA	2	10	304605	304614	20 %	40 %	20 %	20 %	523512792
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155	NC_021721	ACTTG	2	10	310728	310737	20 %	40 %	20 %	20 %	523512796
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161	NC_021721	GCACA	2	10	324947	324956	40 %	0 %	20 %	40 %	523512811
162	NC_021721	AGTTG	2	10	325906	325915	20 %	40 %	40 %	0 %	523512813
163	NC_021721	CAGCC	2	10	326026	326035	20 %	0 %	20 %	60 %	523512813
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165	NC_021721	CAGAT	2	10	327047	327056	40 %	20 %	20 %	20 %	523512814
166	NC_021721	GTTTT	2	10	327577	327586	0 %	80 %	20 %	0 %	523512814
167	NC_021721	GGAAT	2	10	328926	328935	40 %	20 %	40 %	0 %	523512815
168	NC_021721	TCGCC	2	10	329298	329307	0 %	20 %	20 %	60 %	523512815
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172	NC_021721	CATCA	2	10	331987	331996	40 %	20 %	0 %	40 %	523512817
173	NC_021721	TGCGG	2	10	335694	335703	0 %	20 %	60 %	20 %	523512820
174	NC_021721	TGGTT	2	10	337777	337786	0 %	60 %	40 %	0 %	523512823
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177	NC_021721	TTGAA	2	10	351766	351775	40 %	40 %	20 %	0 %	523512835
178	NC_021721	CCAGC	2	10	352140	352149	20 %	0 %	20 %	60 %	523512835
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203	NC_021721	ATAAA	2	10	416987	416996	80 %	20 %	0 %	0 %	523512902
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243	NC_021721	TGAGC	2	10	479096	479105	20 %	20 %	40 %	20 %	523512955
244	NC_021721	ATAAG	2	10	479263	479272	60 %	20 %	20 %	0 %	523512955
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247	NC_021721	TGATT	2	10	485902	485911	20 %	60 %	20 %	0 %	523512961
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249	NC_021721	GTATG	2	10	489112	489121	20 %	40 %	40 %	0 %	523512964
250	NC_021721	TTGCG	2	10	489966	489975	0 %	40 %	40 %	20 %	523512965
251	NC_021721	ATACC	2	10	490993	491002	40 %	20 %	0 %	40 %	523512966
252	NC_021721	GTAGG	2	10	491111	491120	20 %	20 %	60 %	0 %	523512966
253	NC_021721	TGCGA	2	10	492442	492451	20 %	20 %	40 %	20 %	523512968
254	NC_021721	CCCGG	2	10	494299	494308	0 %	0 %	40 %	60 %	523512969
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256	NC_021721	GACAT	2	10	496485	496494	40 %	20 %	20 %	20 %	523512972
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258	NC_021721	ACCGT	2	10	504167	504176	20 %	20 %	20 %	40 %	523512980
259	NC_021721	AGTTA	2	10	507699	507708	40 %	40 %	20 %	0 %	523512984
260	NC_021721	CAAGG	2	10	511314	511323	40 %	0 %	40 %	20 %	523512987
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262	NC_021721	CATTA	2	10	521772	521781	40 %	40 %	0 %	20 %	523512993
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389	NC_021721	GAACG	2	10	754960	754969	40 %	0 %	40 %	20 %	523513223
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