MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 5580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	GGA	2	6	56	61	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021721	GTT	3	9	1494	1502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021721	AGG	2	6	1582	1587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021721	TGA	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021721	TTG	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021721	AAT	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021721	AGT	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021721	GAC	2	6	3249	3254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021721	TGA	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021721	AGG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021721	GAG	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021721	TAA	2	6	9534	9539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021721	TCC	2	6	10347	10352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021721	AGA	2	6	10445	10450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021721	AGG	2	6	10633	10638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021721	CGC	2	6	11089	11094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021721	AGG	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021721	GGA	2	6	12204	12209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021721	GTA	2	6	12525	12530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021721	TGA	2	6	12556	12561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021721	ATG	2	6	12624	12629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021721	AGA	2	6	12671	12676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021721	ATT	2	6	12868	12873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021721	GCG	3	9	15385	15393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021721	TAC	2	6	16331	16336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021721	GAA	2	6	16380	16385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021721	CAT	2	6	16469	16474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021721	TTG	2	6	16475	16480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021721	TAA	2	6	16541	16546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021721	AAC	2	6	16603	16608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021721	ATT	2	6	16662	16667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021721	CAA	2	6	17653	17658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021721	TAC	2	6	17681	17686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021721	AGC	2	6	17733	17738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021721	TTC	2	6	18765	18770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021721	CGC	2	6	19116	19121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021721	CCT	2	6	19213	19218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021721	ACG	2	6	19396	19401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021721	CTT	2	6	19619	19624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021721	TGA	2	6	21075	21080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021721	GAC	2	6	21107	21112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021721	CCT	2	6	24427	24432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021721	ATG	2	6	24681	24686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021721	GGA	2	6	24690	24695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021721	ATA	2	6	25277	25282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021721	AGA	2	6	26507	26512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021721	GTT	2	6	26572	26577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021721	CAA	2	6	27395	27400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021721	CAT	2	6	27422	27427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021721	GTC	2	6	27491	27496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021721	GCC	2	6	27539	27544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021721	TGT	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021721	CTT	2	6	27605	27610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021721	GTT	2	6	27699	27704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021721	TAA	2	6	27719	27724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021721	AAC	2	6	27759	27764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021721	CCT	2	6	27777	27782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021721	TAT	2	6	29954	29959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021721	GGA	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021721	TCA	2	6	30154	30159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021721	CTC	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021721	GAA	2	6	31222	31227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021721	ATT	2	6	31997	32002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021721	ACT	2	6	32079	32084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021721	TGT	2	6	32137	32142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021721	GGA	2	6	32169	32174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021721	TCT	2	6	32405	32410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021721	ATA	2	6	33257	33262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021721	GTA	2	6	33297	33302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021721	TTG	2	6	33317	33322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021721	ATG	2	6	33328	33333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021721	CAA	2	6	35026	35031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021721	TCA	2	6	36670	36675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021721	CAA	2	6	37688	37693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021721	CAT	2	6	37776	37781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021721	TTG	2	6	37870	37875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021721	AAG	2	6	37878	37883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021721	CGA	2	6	37900	37905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021721	TTG	2	6	37957	37962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021721	GGT	2	6	38210	38215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021721	GGC	2	6	38346	38351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021721	GCG	2	6	38361	38366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021721	TGA	2	6	38378	38383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021721	ATT	2	6	38557	38562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021721	CGC	2	6	38569	38574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021721	CGG	2	6	38757	38762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021721	CAA	2	6	38978	38983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021721	TGG	2	6	38995	39000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021721	GTT	2	6	39008	39013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021721	AGA	2	6	39128	39133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021721	ATG	2	6	39148	39153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021721	CGA	2	6	39175	39180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021721	AAG	2	6	39308	39313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021721	TCA	2	6	39357	39362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021721	AGC	2	6	40135	40140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021721	TAG	2	6	40484	40489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021721	TAA	2	6	40513	40518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021721	TAA	2	6	40536	40541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021721	TGG	2	6	40615	40620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021721	ATT	2	6	40626	40631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021721	AAG	2	6	40843	40848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021721	CTT	2	6	40880	40885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021721	TGA	2	6	40931	40936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021721	TAT	2	6	41594	41599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021721	CAA	2	6	41793	41798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021721	AGA	2	6	41889	41894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021721	CTA	2	6	41962	41967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021721	TAG	2	6	41988	41993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021721	TGC	2	6	42014	42019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021721	ATC	2	6	42095	42100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021721	ACA	2	6	42116	42121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021721	TCT	3	9	42221	42229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021721	TAT	2	6	42259	42264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021721	ACA	2	6	42267	42272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021721	AAG	2	6	42276	42281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021721	ACC	2	6	42505	42510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021721	GAA	2	6	42585	42590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021721	TGA	2	6	42624	42629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021721	TGC	2	6	42715	42720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021721	ATG	2	6	42744	42749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021721	ATA	2	6	42750	42755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021721	TGA	2	6	42798	42803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021721	GAT	2	6	42811	42816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021721	CTT	3	9	42884	42892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021721	AGA	2	6	43020	43025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021721	GGT	2	6	43035	43040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021721	TGC	3	9	43099	43107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021721	TCT	2	6	43113	43118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021721	ATG	2	6	43136	43141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021721	TAA	2	6	43159	43164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021721	TGA	2	6	43416	43421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021721	GTG	2	6	43488	43493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021721	TCC	2	6	45348	45353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021721	TTG	2	6	45362	45367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021721	ATT	2	6	45413	45418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021721	TGA	2	6	46943	46948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021721	ATC	2	6	46975	46980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021721	CTT	2	6	47076	47081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021721	TAT	2	6	47191	47196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021721	CAA	2	6	47219	47224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021721	ACC	2	6	47783	47788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_021721	AAC	2	6	47807	47812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021721	CGT	2	6	47879	47884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_021721	CTG	2	6	57644	57649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_021721	GAT	2	6	213685	213690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_021721	ACA	2	6	214248	214253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_021721	GAC	2	6	214302	214307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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