MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021715	TGAAGG	2	12	2053	2064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021715	GGCCGG	2	12	83436	83447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021715	TTCTCG	2	12	97325	97336	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021715	GCGTCG	2	12	215440	215451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021715	GGGTCG	2	12	226059	226070	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021715	CCGCCA	2	12	296132	296143	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021715	AGGGAA	2	12	402869	402880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021715	CGGCGA	2	12	416239	416250	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021715	TTGGCG	2	12	496740	496751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021715	GGCGCG	2	12	665372	665383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021715	ACGAGA	2	12	725199	725210	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021715	GCGGAC	2	12	812877	812888	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021715	GTCCTG	2	12	821815	821826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021715	CCACCG	2	12	832624	832635	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021715	TCGGGT	2	12	854596	854607	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021715	CGATCC	2	12	928689	928700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021715	CGGCAC	2	12	935997	936008	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021715	CCCACG	2	12	1024549	1024560	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021715	AATGAG	2	12	1285654	1285665	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021715	GATCAA	2	12	1376998	1377009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021715	CGGCCG	2	12	1378129	1378140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021715	TCTGCA	2	12	1388060	1388071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021715	GTTTGC	2	12	1390573	1390584	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021715	GCAGCG	2	12	1410861	1410872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021715	CCGCGG	2	12	1412644	1412655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021715	GCGCGT	2	12	1415073	1415084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021715	CCGACA	2	12	1417082	1417093	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021715	GACCGT	2	12	1530043	1530054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021715	CCGTCG	2	12	1560913	1560924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021715	CCACCG	2	12	1566322	1566333	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021715	CCGGCG	2	12	1676855	1676866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021715	ACACTG	2	12	1707423	1707434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021715	CGCGGT	2	12	1713408	1713419	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021715	GTCAGG	2	12	1797295	1797306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021715	GCCCAG	2	12	1825350	1825361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021715	ACCGAG	2	12	1870687	1870698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021715	GACCGG	2	12	1942713	1942724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021715	GCGGTG	2	12	1958122	1958133	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021715	CAGCGC	2	12	1974350	1974361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021715	TAATGT	2	12	2002507	2002518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021715	ACCCCA	2	12	2093926	2093937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021715	TAACGC	2	12	2094337	2094348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021715	GCTGCC	2	12	2096538	2096549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021715	CGGCCG	2	12	2096871	2096882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021715	TTGATC	2	12	2098003	2098014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021715	CGCTGG	2	12	2133390	2133401	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021715	TCGGGC	2	12	2167949	2167960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021715	TAACTC	2	12	2183954	2183965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021715	GGTTGA	2	12	2183969	2183980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021715	TCGTAT	2	12	2200596	2200607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021715	GGCGCG	2	12	2207588	2207599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021715	CCGCGC	2	12	2226439	2226450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021715	GGCGCG	2	12	2228569	2228580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021715	ACGTCT	2	12	2230987	2230998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021715	CGGGCC	2	12	2233826	2233837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021715	GCGGTG	2	12	2335341	2335352	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021715	GCATGA	2	12	2377640	2377651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021715	ACCAGA	2	12	2428065	2428076	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021715	CAAGAT	2	12	2485767	2485778	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021715	GCGTCC	2	12	2515915	2515926	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021715	CGACCT	2	12	2516108	2516119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021715	GCCACC	2	12	2530193	2530204	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021715	CACCGT	2	12	2552866	2552877	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021715	CGCGGC	2	12	2556349	2556360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021715	GTTTCG	2	12	2573057	2573068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021715	CGGGCG	2	12	2580682	2580693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021715	CCCTCT	2	12	2685332	2685343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021715	CGAACG	2	12	2691853	2691864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021715	GCGCCC	2	12	2712846	2712857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021715	AGCTCA	2	12	2721030	2721041	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021715	CGGGTC	2	12	2736769	2736780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021715	GATCGC	2	12	2818775	2818786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021715	CGGTCC	2	12	2837777	2837788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021715	CAAGAT	2	12	2907231	2907242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021715	GCCATC	2	12	2929430	2929441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021715	CCGTTG	2	12	2944841	2944852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021715	GCCGAC	2	12	2983717	2983728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021715	GGCGAA	2	12	2993867	2993878	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021715	AGCTGT	2	12	2994311	2994322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021715	GTGGGA	2	12	3076789	3076800	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021715	TTTGGG	2	12	3102808	3102819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021715	GCGCCC	2	12	3145775	3145786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021715	TCCGCT	2	12	3238710	3238721	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021715	AATACC	2	12	3272200	3272211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021715	CGATGC	2	12	3272976	3272987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021715	CGGTGT	2	12	3330832	3330843	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021715	CGACCG	2	12	3371692	3371703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021715	CCGCGG	2	12	3544526	3544537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021715	CAAGGA	2	12	3558001	3558012	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021715	GTGCAC	2	12	3571337	3571348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021715	CGAGGT	2	12	3572137	3572148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021715	AGCTCA	2	12	3651784	3651795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021715	CGGGGA	2	12	3660786	3660797	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021715	CGGCCG	2	12	3687875	3687886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021715	GGCGCG	2	12	3718475	3718486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021715	CGACAT	2	12	3719467	3719478	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021715	CATCGC	2	12	3749725	3749736	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021715	CCGAGT	2	12	3767547	3767558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021715	CCGGCC	2	12	3901225	3901236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021715	GGCGTG	2	12	3940824	3940835	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021715	CCGTCA	2	12	3990343	3990354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021715	CGGCCG	2	12	4060131	4060142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021715	GTCACC	2	12	4069097	4069108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021715	CGACCG	2	12	4209776	4209787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021715	AGCGAA	2	12	4227818	4227829	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021715	GCGCCG	2	12	4241795	4241806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021715	CACCGC	2	12	4255837	4255848	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021715	GCGTCT	2	12	4348669	4348680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021715	GCGCGG	2	12	4385776	4385787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021715	GCTGGT	2	12	4418811	4418822	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021715	CCCGGG	2	12	4422114	4422125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021715	TCGCCG	2	12	4431079	4431090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021715	TCGCCG	2	12	4431136	4431147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021715	CGGCGA	2	12	4449893	4449904	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021715	CGGCGA	2	12	4449950	4449961	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021715	ATCGCC	2	12	4488873	4488884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021715	GTTGCG	2	12	4496246	4496257	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021715	TGGGCC	2	12	4508501	4508512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021715	CGCGCC	2	12	4510518	4510529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021715	CCGGTT	2	12	4526018	4526029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021715	CCGTGG	2	12	4530454	4530465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021715	CCGGGC	2	12	4632640	4632651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021715	TTCGTC	2	12	4642981	4642992	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021715	TGTTCG	2	12	4653603	4653614	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021715	AGGAGC	2	12	4694986	4694997	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021715	CGCGTC	2	12	4713243	4713254	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021715	TTGGCG	2	12	4737017	4737028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021715	TTGGCG	2	12	4750056	4750067	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021715	CGGCAC	2	12	4789488	4789499	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021715	TACTGG	2	12	4819167	4819178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021715	GCCCCT	2	12	4842163	4842174	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021715	AACGGG	2	12	4846592	4846603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021715	ACCCCG	2	12	4980314	4980325	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021715	GCACCC	2	12	4983094	4983105	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021715	AACGCG	2	12	5021265	5021276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021715	TCATTT	2	12	5058221	5058232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021715	GAATCT	2	12	5069790	5069801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_021715	GTCGGG	2	12	5100480	5100491	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_021715	GGCTGC	2	12	5196348	5196359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021715	CAGCGC	2	12	5255003	5255014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021715	CCCGGG	2	12	5287242	5287253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021715	CGGGCT	2	12	5308478	5308489	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021715	GCCGGA	2	12	5317112	5317123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021715	CGGCGA	2	12	5346646	5346657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021715	CGGCGA	2	12	5346703	5346714	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021715	CTGCGG	2	12	5431338	5431349	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021715	TTATCC	2	12	5437337	5437348	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021715	GAGCCA	2	12	5439167	5439178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021715	AGCTGA	2	12	5441637	5441648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_021715	ATGCTG	2	12	5451817	5451828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_021715	GCCGCA	2	12	5468814	5468825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021715	CGGGCG	2	12	5495618	5495629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.