MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus Bmb9393

Total Repeats: 1315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021670	GTTGAA	2	12	3190	3201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521210825
2	NC_021670	GTTATC	2	12	7296	7307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521210829
3	NC_021670	CAAGCT	2	12	8264	8275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521210829
4	NC_021670	GTAATG	2	12	9252	9263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521210829
5	NC_021670	ACAATT	2	12	11249	11260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	521210831
6	NC_021670	TAGCAT	2	12	11344	11355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521210831
7	NC_021670	GCTTTA	2	12	17431	17442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521210836
8	NC_021670	TTTGAA	2	12	18252	18263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210836
9	NC_021670	TAAAGG	2	12	20299	20310	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521210838
10	NC_021670	TTGAAG	2	12	20496	20507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521210838
11	NC_021670	TGATTG	2	12	21700	21711	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521210839
12	NC_021670	AAGGAA	2	12	22470	22481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	521210840
13	NC_021670	TGAATT	2	12	25385	25396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210841
14	NC_021670	CGTATT	2	12	26466	26477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521210842
15	NC_021670	ATTTCA	2	12	27869	27880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521210843
16	NC_021670	GTTCTG	2	12	29168	29179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	521210844
17	NC_021670	ATCAGC	2	12	31183	31194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521210846
18	NC_021670	AAAAGA	2	12	33824	33835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	521210847
19	NC_021670	TTTTGA	2	12	34612	34623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	521210848
20	NC_021670	TAAACA	2	12	35031	35042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	521210849
21	NC_021670	TGGTAG	2	12	35697	35708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	521210849
22	NC_021670	ATGCCT	2	12	38352	38363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	521210851
23	NC_021670	TGAAGA	2	12	38540	38551	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521210851
24	NC_021670	GAACAA	2	12	43254	43265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	521210856
25	NC_021670	TCTCAT	2	12	44077	44088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	521210858
26	NC_021670	ATGTTA	2	12	45046	45057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210859
27	NC_021670	AGAAAA	2	12	47667	47678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	521210860
28	NC_021670	GAAAAT	2	12	53290	53301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521210866
29	NC_021670	GTCTAA	2	12	57217	57228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521210870
30	NC_021670	GTTTAA	2	12	58108	58119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210871
31	NC_021670	GTTTAA	2	12	65833	65844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210879
32	NC_021670	AATGAA	2	12	68840	68851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521210883
33	NC_021670	ACAACT	2	12	70905	70916	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	521210884
34	NC_021670	TTCATC	2	12	78988	78999	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	521210892
35	NC_021670	TTTTCT	2	12	82418	82429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	521210895
36	NC_021670	AATTAA	2	12	82608	82619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521210895
37	NC_021670	GGCATG	2	12	83239	83250	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	521210896
38	NC_021670	TAAAAA	2	12	84401	84412	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	521210896
39	NC_021670	TTCTTT	2	12	92721	92732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	521210905
40	NC_021670	TTAAAC	2	12	93146	93157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	521210906
41	NC_021670	GTAAAA	2	12	94400	94411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521210907
42	NC_021670	TTAAAA	2	12	94490	94501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521210907
43	NC_021670	GGGCTT	2	12	99676	99687	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	521210910
44	NC_021670	ACCCTT	2	12	105099	105110	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	521210915
45	NC_021670	TTTAGC	2	12	107007	107018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521210917
46	NC_021670	AAATAA	2	12	107058	107069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	521210917
47	NC_021670	AAAAGA	2	12	109236	109247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	521210918
48	NC_021670	TACAAG	2	12	111984	111995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521210920
49	NC_021670	TCAACT	2	12	113552	113563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521210922
50	NC_021670	GTAGAA	2	12	115911	115922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521210923
51	NC_021670	AACCAC	2	12	116746	116757	50 %	0 %	0 %	50 %	521210923
52	NC_021670	AACCGA	2	12	120059	120070	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	521210925
53	NC_021670	CATTAC	2	12	121760	121771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521210926
54	NC_021670	CTTTTA	2	12	121829	121840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	521210926
55	NC_021670	TATCAT	2	12	123331	123342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521210927
56	NC_021670	TTTATT	2	12	123739	123750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	521210928
57	NC_021670	TATTTG	2	12	123825	123836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	521210928
58	NC_021670	TAAATA	2	12	125258	125269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521210928
59	NC_021670	TTTTTC	2	12	126832	126843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	521210929
60	NC_021670	TTTGAA	2	12	130939	130950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210933
61	NC_021670	TACCAT	2	12	134375	134386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521210936
62	NC_021670	TGAAGA	2	12	140731	140742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521210940
63	NC_021670	TTTCAT	2	12	141412	141423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	521210941
64	NC_021670	TGTTTA	2	12	145630	145641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	521210945
65	NC_021670	TCGAAA	2	12	147128	147139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521210947
66	NC_021670	CTATTG	2	12	149714	149725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521210949
67	NC_021670	CATATG	2	12	150917	150928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521210950
68	NC_021670	CAGATT	2	12	156411	156422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521210955
69	NC_021670	AGATAT	2	12	163807	163818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521210962
70	NC_021670	GATATG	2	12	173088	173099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521210969
71	NC_021670	TAATGA	2	12	176064	176075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521210971
72	NC_021670	ATTTGA	2	12	176994	177005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210972
73	NC_021670	TATAAA	2	12	177525	177536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521210973
74	NC_021670	GATTTT	2	12	181687	181698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	521210977
75	NC_021670	ACAAAG	2	12	186207	186218	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	521210981
76	NC_021670	TGTAAT	2	12	187231	187242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210982
77	NC_021670	AAAGAT	2	12	188220	188231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521210984
78	NC_021670	CAATAT	2	12	190692	190703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	521210985
79	NC_021670	AATTAG	2	12	193421	193432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521210988
80	NC_021670	TTGGTA	2	12	194548	194559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521210989
81	NC_021670	GCGATT	2	12	194568	194579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	521210989
82	NC_021670	AAATTT	2	12	194666	194677	50 %	50 %	0 %	0 %	521210989
83	NC_021670	TTTGGA	2	12	197231	197242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521210992
84	NC_021670	ACCTGC	2	12	197566	197577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	521210992
85	NC_021670	AAGATA	2	12	197712	197723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521210992
86	NC_021670	CTATTA	2	12	202497	202508	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521210994
87	NC_021670	TATGAT	2	12	204031	204042	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521210994
88	NC_021670	TTGAAA	2	12	204483	204494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521210994
89	NC_021670	AGCAAC	2	12	210434	210445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	521210998
90	NC_021670	CACCTT	2	12	212486	212497	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	521211000
91	NC_021670	GTAAAT	2	12	216729	216740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521211003
92	NC_021670	ATTTTA	2	12	218323	218334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521211004
93	NC_021670	TATCTT	2	12	222937	222948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	521211007
94	NC_021670	ATTTGG	2	12	223950	223961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521211008
95	NC_021670	GAGTTT	2	12	227294	227305	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521211009
96	NC_021670	CCCTGA	2	12	229803	229814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	521211011
97	NC_021670	TCCTGA	2	12	230622	230633	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	521211011
98	NC_021670	TCAATT	2	12	232773	232784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211013
99	NC_021670	AATATG	2	12	234073	234084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521211014
100	NC_021670	AAGGAC	2	12	234397	234408	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	521211014
101	NC_021670	AGGACA	2	12	240034	240045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	521211018
102	NC_021670	ACATTT	2	12	240370	240381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211018
103	NC_021670	TTCTTG	2	12	245298	245309	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	521211021
104	NC_021670	AGCCAT	2	12	269288	269299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521211038
105	NC_021670	TGGTAT	2	12	285826	285837	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521211050
106	NC_021670	TATAGA	2	12	289180	289191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521211053
107	NC_021670	ACGATG	2	12	296351	296362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	521211058
108	NC_021670	AGAATC	2	12	303914	303925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521211063
109	NC_021670	ATAAAG	2	12	311065	311076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521211069
110	NC_021670	GACATT	2	12	312764	312775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521211070
111	NC_021670	GATTTC	2	12	314583	314594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521211072
112	NC_021670	TTCATA	2	12	315153	315164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211073
113	NC_021670	GATTAT	2	12	319560	319571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	521211077
114	NC_021670	ATGGTG	2	12	319693	319704	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	521211077
115	NC_021670	CAGCAA	2	12	320080	320091	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	521211077
116	NC_021670	TAATGG	2	12	321288	321299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521211078
117	NC_021670	TCTTCA	2	12	325659	325670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	521211082
118	NC_021670	TTATCT	2	12	325755	325766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	521211082
119	NC_021670	CTAAAG	2	12	326862	326873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521211083
120	NC_021670	ATAAGT	2	12	327220	327231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521211083
121	NC_021670	GAAAAA	2	12	328016	328027	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	521211085
122	NC_021670	TAATTA	2	12	331508	331519	50 %	50 %	0 %	0 %	521211087
123	NC_021670	ACAAGA	2	12	332348	332359	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	521211088
124	NC_021670	AGGACA	2	12	332726	332737	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	521211088
125	NC_021670	ATTATC	2	12	334036	334047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211089
126	NC_021670	TAAATT	2	12	335576	335587	50 %	50 %	0 %	0 %	521211089
127	NC_021670	TGAAGA	2	12	335837	335848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521211089
128	NC_021670	GATCAA	2	12	336544	336555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521211089
129	NC_021670	AATATA	2	12	340740	340751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521211094
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131	NC_021670	TGTTTT	2	12	342441	342452	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	521211097
132	NC_021670	TAAAGA	2	12	345151	345162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521211102
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134	NC_021670	CTGAAT	2	12	351171	351182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521211111
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149	NC_021670	ATTAAA	2	12	397935	397946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521211153
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222	NC_021670	AGGAGA	2	12	591419	591430	50 %	0 %	50 %	0 %	521211332
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226	NC_021670	CAGGTA	2	12	603300	603311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	521211336
227	NC_021670	AAAGTT	2	12	606393	606404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521211340
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230	NC_021670	AAAAAG	2	12	618466	618477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	521211349
231	NC_021670	TGCAGG	2	12	620920	620931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	521211354
232	NC_021670	CATTTA	2	12	621555	621566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211355
233	NC_021670	GCTGAA	2	12	622244	622255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	521211356
234	NC_021670	AGCTAA	2	12	622579	622590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521211356
235	NC_021670	CAGTAG	2	12	623608	623619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	521211358
236	NC_021670	ACGATG	2	12	627851	627862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	521211360
237	NC_021670	GTTTAG	2	12	628274	628285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	521211360
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239	NC_021670	CTGGTA	2	12	632082	632093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	521211361
240	NC_021670	TTGTAC	2	12	632939	632950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521211363
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242	NC_021670	AACGTG	2	12	634779	634790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	521211365
243	NC_021670	TTCGAA	2	12	635300	635311	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521211365
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253	NC_021670	GACTCA	2	12	652664	652675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521211379
254	NC_021670	GATTCA	2	12	652682	652693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521211379
255	NC_021670	GACTCA	2	12	652700	652711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521211379
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299	NC_021670	GACTCA	2	12	661391	661402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521211381
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326	NC_021670	CGTCAG	2	12	727706	727717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	521211446
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337	NC_021670	TGGTGA	2	12	747832	747843	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	521211464
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339	NC_021670	TTATAA	2	12	758175	758186	50 %	50 %	0 %	0 %	521211474
340	NC_021670	CATTGC	2	12	762321	762332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	521211477
341	NC_021670	GTAAAA	2	12	764591	764602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	521211479
342	NC_021670	ATTTAT	2	12	767051	767062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521211480
343	NC_021670	AATTGA	2	12	767130	767141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	521211480
344	NC_021670	AGATGT	2	12	767782	767793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521211481
345	NC_021670	AGATGA	2	12	769231	769242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521211483
346	NC_021670	ATATCC	2	12	772757	772768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521211487
347	NC_021670	CTTAAT	2	12	773197	773208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211487
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370	NC_021670	TCAATA	2	12	828617	828628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	521211541
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446	NC_021670	TTCAGT	2	12	977946	977957	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	521211690
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448	NC_021670	TTAAAT	2	12	994825	994836	50 %	50 %	0 %	0 %	521211703
449	NC_021670	CAAATC	2	12	995860	995871	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	521211704
450	NC_021670	AGATGG	2	12	996665	996676	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	521211704
451	NC_021670	ACTAGA	2	12	997928	997939	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521211704
452	NC_021670	TTACAT	2	12	1000348	1000359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211706
453	NC_021670	TTGCAC	2	12	1001870	1001881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	521211707
454	NC_021670	ATACAG	2	12	1001942	1001953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	521211707
455	NC_021670	CGACTA	2	12	1002200	1002211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	521211707
456	NC_021670	TGAAAG	2	12	1006202	1006213	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	521211711
457	NC_021670	CAATTT	2	12	1007116	1007127	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	521211711
458	NC_021670	AGAAAA	2	12	1007471	1007482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	521211711
459	NC_021670	AGAGCA	2	12	1007850	1007861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	521211711
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