MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia plymuthica S13

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021659	TGGGCC	2	12	50448	50459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021659	CAAGGC	2	12	50990	51001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021659	AAACCT	2	12	92394	92405	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021659	AGGTTT	2	12	92443	92454	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021659	TCCGGC	2	12	111603	111614	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021659	CATCGC	2	12	112948	112959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021659	GCCTTT	2	12	130147	130158	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021659	CGGCTG	2	12	131747	131758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021659	GAAATG	2	12	141035	141046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021659	CCTTGT	2	12	156656	156667	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021659	CAGTGA	2	12	221184	221195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021659	TAAGAC	2	12	253262	253273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021659	GGAAGG	2	12	258410	258421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021659	TAAGAC	2	12	292552	292563	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021659	TGAAAA	2	12	310783	310794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021659	ATTTTT	2	12	332307	332318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021659	GGCAGT	2	12	376372	376383	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021659	AGGTTG	2	12	479732	479743	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021659	TGTATT	2	12	483139	483150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021659	TTATCA	2	12	587646	587657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021659	AGCGGC	2	12	603705	603716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021659	AGGGGG	2	12	618601	618612	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021659	TTAACC	2	12	644227	644238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021659	CCCACG	2	12	682400	682411	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021659	GGTAAC	2	12	736916	736927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021659	CTCTGC	2	12	757733	757744	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021659	CGACAG	2	12	762021	762032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021659	CTCTAT	2	12	820953	820964	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021659	TGCGCT	2	12	824450	824461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021659	TCACCA	2	12	829723	829734	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021659	AATTTA	2	12	830852	830863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021659	CTTTCC	2	12	831236	831247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021659	TTTATT	2	12	873259	873270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021659	TAAGAC	2	12	888448	888459	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021659	ATCTTG	2	12	913646	913657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021659	CTTTCT	2	12	945788	945799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021659	CTTTCT	2	12	946268	946279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021659	AAAAAG	2	12	946405	946416	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021659	TTAGGT	2	12	969395	969406	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021659	TCATTT	2	12	973577	973588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021659	TTTGAT	2	12	987996	988007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021659	TCGTTA	2	12	991425	991436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021659	TTTTAC	2	12	1101076	1101087	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021659	TTTTAT	2	12	1171819	1171830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021659	TGGTTT	2	12	1206022	1206033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021659	GATAAT	2	12	1210729	1210740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021659	TGTTGA	2	12	1251172	1251183	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021659	GTTAAT	2	12	1268998	1269009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021659	CTGTCA	2	12	1274629	1274640	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021659	AGTAAA	2	12	1286669	1286680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021659	TAACGT	2	12	1291441	1291452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021659	CTGCGT	2	12	1457883	1457894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021659	TAATTT	2	12	1466912	1466923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021659	ATAAAT	2	12	1468137	1468148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021659	CATGAG	2	12	1473123	1473134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021659	GCTGGT	2	12	1473807	1473818	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021659	AGCATA	2	12	1484698	1484709	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021659	CCAGCG	2	12	1517912	1517923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021659	TATCTC	2	12	1628989	1629000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021659	ATGAAA	2	12	1629143	1629154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021659	TTTTAA	2	12	1629162	1629173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021659	TATTTT	2	12	1687703	1687714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021659	TTAGGT	2	12	1688202	1688213	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021659	TGACCC	2	12	1691904	1691915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021659	TTCTGT	2	12	1693102	1693113	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021659	CCACTG	2	12	1709395	1709406	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021659	TCTATA	2	12	1715079	1715090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021659	CAAAGG	2	12	1792041	1792052	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021659	CGTTGC	2	12	1819172	1819183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021659	CAATAA	2	12	1819256	1819267	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021659	GTGCCG	2	12	1847156	1847167	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021659	CAAAAA	2	12	1863849	1863860	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021659	TCCTTT	2	12	1876941	1876952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021659	AAAGGG	2	12	1893168	1893179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021659	ACTAAC	2	12	1895216	1895227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021659	ATAAGG	2	12	1923104	1923115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021659	AGGCTA	2	12	1937786	1937797	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021659	TTTTTC	2	12	2085647	2085658	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021659	GCTTTT	2	12	2095325	2095336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021659	ATAAAA	2	12	2138412	2138423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021659	TAAACT	2	12	2148528	2148539	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021659	CAGAAA	2	12	2160229	2160240	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021659	CACCCG	2	12	2169054	2169065	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021659	GTTAAC	2	12	2179198	2179209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021659	GTTAAC	2	12	2179262	2179273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021659	TATTTT	2	12	2194287	2194298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021659	AAATGA	2	12	2228608	2228619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021659	TAGCGG	2	12	2237912	2237923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021659	AGAGGA	2	12	2243520	2243531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021659	CTTTTT	2	12	2247256	2247267	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021659	TTTATC	2	12	2275530	2275541	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021659	GCAAAT	2	12	2290997	2291008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021659	GGAGCG	2	12	2356499	2356510	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021659	GTTTTT	2	12	2375275	2375286	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021659	GGCCGC	2	12	2449495	2449506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021659	GTTCGA	2	12	2485831	2485842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021659	TAAAAA	2	12	2486216	2486227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021659	GCCCTG	2	12	2493312	2493323	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021659	CGCTTA	2	12	2544118	2544129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021659	CAATGC	2	12	2583617	2583628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021659	AATATC	2	12	2593269	2593280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021659	TAATTT	2	12	2604613	2604624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021659	AGCCTT	2	12	2608766	2608777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021659	CAATTG	2	12	2617640	2617651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021659	GATGAA	2	12	2636145	2636156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021659	ATGCCG	2	12	2664038	2664049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021659	CCGCGC	2	12	2682177	2682188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021659	ATTATC	2	12	2684079	2684090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021659	TGGCGA	2	12	2709877	2709888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021659	GGCGTG	2	12	2772282	2772293	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021659	TGTCAT	2	12	2779838	2779849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021659	TATCAC	2	12	2836992	2837003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021659	TTTACC	2	12	2873833	2873844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021659	ACAAAA	2	12	2895193	2895204	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021659	TAAAAT	2	12	2911931	2911942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021659	TGAAGA	2	12	2924426	2924437	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021659	AGTAAT	2	12	2964991	2965002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021659	AAAAGG	2	12	2976506	2976517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021659	TAAAAT	2	12	2981545	2981556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021659	TAAAAA	2	12	2981659	2981670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021659	CTAAAA	2	12	3019251	3019262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021659	CAGCGC	2	12	3068775	3068786	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021659	CAGCCG	2	12	3069399	3069410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021659	AACAAA	2	12	3103398	3103409	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021659	GAAAAT	2	12	3106097	3106108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021659	GGCCGG	2	12	3117811	3117822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021659	CATGTC	2	12	3118803	3118814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021659	CGCTGG	2	12	3119913	3119924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021659	ATCGCA	2	12	3120883	3120894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021659	ATAAAA	2	12	3124563	3124574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021659	CGCTGG	2	12	3128139	3128150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021659	AATCAG	2	12	3128791	3128802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_021659	AAAATA	2	12	3316448	3316459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.