MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia plymuthica 4Rx13 plasmid p75

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021594	TAT	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021594	CAG	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021594	CGA	2	6	2851	2856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021594	CAT	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021594	CAG	3	9	4300	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021594	TTA	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021594	CGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021594	CGG	2	6	5575	5580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021594	CCT	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021594	ACC	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021594	GCC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021594	GTG	2	6	6739	6744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021594	CCG	4	12	6804	6815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021594	GGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021594	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021594	GGC	2	6	7876	7881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021594	GGC	2	6	7954	7959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021594	GCC	2	6	7963	7968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021594	GAT	2	6	8077	8082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021594	TTC	2	6	8161	8166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021594	CCA	2	6	8618	8623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021594	TCC	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021594	GGA	2	6	8748	8753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021594	CAA	2	6	8767	8772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021594	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021594	AAC	2	6	8818	8823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021594	GGT	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021594	CCG	2	6	8908	8913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021594	GTC	2	6	8980	8985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021594	CCG	2	6	9078	9083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021594	TAA	2	6	9114	9119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021594	GCC	2	6	11197	11202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021594	GGC	2	6	11207	11212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021594	AAC	2	6	11215	11220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021594	ATT	2	6	12474	12479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021594	ATT	2	6	12507	12512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021594	ATT	2	6	12624	12629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021594	TGG	2	6	12631	12636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021594	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021594	ATG	3	9	12832	12840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021594	CAA	2	6	13077	13082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021594	GCG	2	6	13090	13095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021594	GCG	2	6	13150	13155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021594	CTT	2	6	13303	13308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021594	TCT	2	6	13332	13337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021594	TCC	2	6	13374	13379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021594	TCG	2	6	13664	13669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021594	CGA	2	6	13676	13681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021594	CGC	2	6	13815	13820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021594	GCG	2	6	13823	13828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021594	CGA	2	6	13885	13890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021594	AGC	2	6	13918	13923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021594	ATA	2	6	14424	14429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021594	TTA	2	6	14447	14452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021594	TTC	2	6	14775	14780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021594	AGC	2	6	14781	14786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021594	CGA	2	6	14914	14919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021594	AAT	2	6	15039	15044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021594	GCT	2	6	15314	15319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021594	GCG	2	6	15374	15379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021594	CGC	2	6	15676	15681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021594	CGA	2	6	15687	15692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021594	TCA	2	6	15806	15811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021594	GCC	2	6	15819	15824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021594	TCC	2	6	15845	15850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021594	GGT	2	6	16388	16393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021594	CAA	2	6	16404	16409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021594	GAG	2	6	16410	16415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021594	GCT	2	6	16789	16794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021594	AAT	2	6	16836	16841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021594	TGA	2	6	16857	16862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021594	AAT	2	6	16876	16881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021594	GAA	2	6	16922	16927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021594	GCC	2	6	16970	16975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021594	GAT	2	6	17996	18001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021594	TGA	2	6	18058	18063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021594	ATT	2	6	18065	18070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021594	GTA	2	6	18176	18181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021594	GCG	2	6	18232	18237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021594	GGA	2	6	18263	18268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021594	CAG	2	6	18303	18308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021594	TTC	2	6	18322	18327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021594	CGG	2	6	18337	18342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021594	TCG	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021594	CGA	2	6	18557	18562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021594	CGT	2	6	18578	18583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021594	CCG	2	6	18585	18590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021594	GGT	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021594	CGC	2	6	18696	18701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021594	GCG	2	6	18704	18709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021594	CGA	2	6	18765	18770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021594	ACC	2	6	18782	18787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021594	TGC	2	6	19254	19259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021594	TGC	2	6	19297	19302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021594	GCG	2	6	19347	19352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021594	TGC	2	6	19371	19376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021594	GTT	2	6	19404	19409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021594	CTT	2	6	19442	19447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021594	GTC	2	6	19520	19525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021594	CTA	2	6	19531	19536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021594	TCG	2	6	19673	19678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021594	CGA	2	6	19686	19691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021594	ACG	2	6	19706	19711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021594	CCG	2	6	19714	19719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021594	TCT	2	6	19770	19775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021594	TAC	2	6	19826	19831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021594	CTG	2	6	19890	19895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021594	CGC	2	6	19914	19919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021594	CAA	2	6	19952	19957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021594	GGA	2	6	20025	20030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021594	AGT	2	6	20122	20127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021594	CGC	2	6	20152	20157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021594	CAG	2	6	20218	20223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021594	CTA	2	6	21583	21588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021594	AGG	2	6	21906	21911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021594	CAA	2	6	21941	21946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021594	ATG	2	6	22049	22054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021594	ACT	2	6	22084	22089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021594	TGC	2	6	22190	22195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021594	ATA	2	6	22240	22245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021594	CAC	2	6	22269	22274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021594	CAG	2	6	22281	22286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021594	ATT	2	6	22314	22319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021594	ATT	2	6	22360	22365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021594	TAT	2	6	22830	22835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021594	TCT	2	6	22861	22866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021594	ACA	2	6	22963	22968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021594	TCA	2	6	22986	22991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021594	ATC	2	6	23108	23113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021594	AAT	2	6	23765	23770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021594	GGC	2	6	23828	23833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021594	TGG	2	6	23841	23846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021594	CAT	2	6	26802	26807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021594	TAG	2	6	26808	26813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021594	AAG	2	6	26870	26875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021594	CAA	2	6	26876	26881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021594	GAT	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021594	ATC	2	6	26977	26982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021594	TGA	2	6	27024	27029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021594	TGA	2	6	27093	27098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021594	CAC	2	6	27104	27109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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277	NC_021594	TTG	2	6	75607	75612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_021594	TCA	2	6	75634	75639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_021594	CAT	2	6	75675	75680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_021594	TGG	2	6	75703	75708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021594	GGC	2	6	75716	75721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.