MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl12

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021593	ATGGGC	2	12	18793	18804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021593	GGTCGA	2	12	50529	50540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021593	GGAAAA	2	12	51229	51240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021593	TTCCAG	2	12	57601	57612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021593	CATGAG	2	12	60306	60317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021593	GGGCGG	2	12	108508	108519	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021593	TACAAA	2	12	139939	139950	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021593	CTGGCA	2	12	147054	147065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021593	GATAGG	2	12	166137	166148	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021593	GCATGG	2	12	166428	166439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021593	GGCGCG	2	12	200920	200931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021593	GCGCCC	2	12	225585	225596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021593	GAGACG	2	12	286739	286750	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021593	AGAGGA	2	12	291481	291492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021593	GCTGTT	2	12	299111	299122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021593	GCTTTT	2	12	361092	361103	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021593	GTTGGC	2	12	412805	412816	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021593	CGCATC	2	12	445536	445547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021593	GCTGAA	2	12	482332	482343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021593	TGAGAT	2	12	498504	498515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021593	AAGGTA	2	12	499035	499046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021593	TCCGCA	2	12	519417	519428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021593	CATGCA	2	12	530964	530975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021593	ATGCCG	2	12	564213	564224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021593	GCGCAC	2	12	570111	570122	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021593	GGAATC	2	12	619258	619269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021593	TCGCTC	2	12	653668	653679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021593	GATTGC	2	12	655606	655617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021593	TCGCTC	2	12	655663	655674	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021593	CGACAA	2	12	669168	669179	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021593	CATGCG	2	12	726424	726435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021593	ATGCCC	2	12	760092	760103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021593	GCCACC	2	12	806938	806949	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021593	TTAGAC	2	12	862257	862268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021593	GCCCTT	2	12	898566	898577	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021593	AAAAGG	2	12	916390	916401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021593	TATCGT	2	12	935417	935428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021593	CGCCTG	2	12	1016783	1016794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021593	GACATG	2	12	1091441	1091452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021593	CCCATA	2	12	1109341	1109352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021593	CCCGAT	2	12	1185629	1185640	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021593	TTCCCT	2	12	1231819	1231830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021593	GAGCGC	2	12	1265985	1265996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021593	CGTAAG	2	12	1348191	1348202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021593	TCACAT	2	12	1406326	1406337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021593	GGCCAA	2	12	1424562	1424573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021593	TGGCTG	2	12	1463445	1463456	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021593	CTCGTT	2	12	1464772	1464783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021593	TTGCAC	2	12	1477463	1477474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021593	CGCTTT	2	12	1494218	1494229	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021593	GCCGTT	2	12	1512659	1512670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021593	CGCTTG	2	12	1580756	1580767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021593	AGAGAA	2	12	1656447	1656458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021593	GTCGAC	2	12	1687888	1687899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021593	CAAAAA	2	12	1755692	1755703	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021593	CCTTTG	2	12	1809582	1809593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021593	GCAATC	2	12	1824233	1824244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021593	CATCTC	2	12	1836164	1836175	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021593	CAATCT	2	12	1836268	1836279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021593	ATGGGA	2	12	1861927	1861938	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021593	CCTTTG	2	12	1885891	1885902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021593	ATCGAT	2	12	1911695	1911706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021593	CTATAC	2	12	1934405	1934416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.