MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021592	TATTTT	2	12	13696	13707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021592	GTATAC	2	12	53433	53444	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021592	ATCATA	2	12	57272	57283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021592	AATAAA	2	12	70420	70431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021592	ATTCAA	2	12	71946	71957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021592	AATAAG	2	12	76759	76770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021592	ATCTAT	2	12	77955	77966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021592	TTAATA	2	12	78195	78206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021592	TTGGCT	2	12	84074	84085	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021592	AATGAT	2	12	89893	89904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021592	TATATT	2	12	97804	97815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021592	GAAATT	2	12	103891	103902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021592	AAACAT	2	12	106520	106531	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021592	ATCATT	2	12	112279	112290	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021592	AAACAT	2	12	143151	143162	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021592	AATTAT	2	12	154609	154620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021592	ATATTT	2	12	194629	194640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021592	GTTCCG	2	12	227761	227772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021592	ATTTAT	2	12	233046	233057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021592	AATATT	2	12	238090	238101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021592	AATATT	2	12	253420	253431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021592	AAATAT	2	12	255203	255214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021592	GTTAAA	2	12	271752	271763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021592	ATAAAA	2	12	277038	277049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021592	TATAAG	2	12	291790	291801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021592	ATATTT	2	12	291834	291845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021592	AAATTA	2	12	296648	296659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021592	ATTTAA	2	12	321931	321942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021592	ATGACG	2	12	337753	337764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021592	TAAATT	2	12	349243	349254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021592	AATATT	2	12	367708	367719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021592	AAATGT	2	12	367813	367824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021592	AATCAA	2	12	410112	410123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021592	AATAAA	2	12	449904	449915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021592	ATTAGA	2	12	460358	460369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021592	ATTTAG	2	12	461706	461717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021592	ATCCTG	2	12	463142	463153	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021592	TAGGCA	2	12	472537	472548	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021592	AATTTA	2	12	508962	508973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021592	TTATAA	2	12	512369	512380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021592	AAATTG	2	12	565945	565956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021592	AAAATA	2	12	591486	591497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021592	ATTTTC	2	12	595405	595416	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021592	CAAGAT	2	12	606263	606274	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021592	TATTTT	2	12	624466	624477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021592	AATATG	2	12	625221	625232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021592	TGCTGG	2	12	627520	627531	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021592	TGCATT	2	12	639342	639353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021592	TAAAAT	2	12	646587	646598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021592	AAATTT	2	12	675697	675708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021592	TGAAAA	2	12	694157	694168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021592	TTTACA	2	12	701647	701658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021592	TATTTA	2	12	716499	716510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021592	TATAAT	2	12	736684	736695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021592	AATTAC	2	12	742423	742434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021592	TAAAAA	2	12	745047	745058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021592	AAATAT	2	12	778627	778638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021592	ATAAAT	2	12	796212	796223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021592	TAATTA	2	12	806943	806954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021592	AAATAG	2	12	815873	815884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021592	AGAAGC	2	12	869396	869407	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021592	ATTGTT	2	12	886913	886924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021592	ATATTG	2	12	913535	913546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021592	TGGTTT	2	12	959868	959879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021592	ATTGCC	2	12	1033271	1033282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021592	TATAAA	2	12	1055974	1055985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021592	TAAAAA	2	12	1057660	1057671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021592	ATTTTA	2	12	1068836	1068847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021592	CTATAA	2	12	1075601	1075612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021592	CTTATC	2	12	1091966	1091977	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021592	TACATA	2	12	1093808	1093819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021592	TTATAC	2	12	1094408	1094419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021592	TAAAAT	2	12	1125549	1125560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021592	ATATAA	2	12	1130811	1130822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021592	CCGGGA	2	12	1146747	1146758	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021592	AAGATT	2	12	1147882	1147893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021592	AGAATA	2	12	1155163	1155174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021592	TAAGTT	2	12	1159056	1159067	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021592	GCAATA	2	12	1196333	1196344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021592	ATATAA	2	12	1233518	1233529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021592	ATTAAT	2	12	1245927	1245938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021592	ATATTT	2	12	1258071	1258082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021592	AAATAT	2	12	1339051	1339062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021592	CTGCAA	2	12	1340417	1340428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021592	AACAGA	2	12	1343083	1343094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021592	ATGGTT	2	12	1362865	1362876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021592	AATAAA	2	12	1398637	1398648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021592	TTCTAA	2	12	1427437	1427448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021592	TAATAT	2	12	1428964	1428975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021592	TCTATT	2	12	1527069	1527080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021592	TTTATT	2	12	1544184	1544195	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021592	AAATTA	2	12	1581290	1581301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021592	GAATTT	2	12	1600228	1600239	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021592	GCACTC	2	12	1638232	1638243	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021592	AGTTCC	2	12	1647761	1647772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021592	TCTATA	2	12	1672169	1672180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021592	ATGAAA	2	12	1685009	1685020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021592	TATACT	2	12	1691493	1691504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021592	TTATAT	2	12	1713706	1713717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021592	TACATA	2	12	1743533	1743544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021592	AAAATT	2	12	1745372	1745383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021592	TTATAA	2	12	1767764	1767775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021592	ATATTG	2	12	1778483	1778494	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021592	CAAAAT	2	12	1797043	1797054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021592	ATTCAT	2	12	1797140	1797151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021592	AAATAT	2	12	1798587	1798598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021592	CATTAT	2	12	1830917	1830928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021592	AAAAAT	2	12	1860236	1860247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021592	CTCTAT	2	12	1877622	1877633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021592	ATAATT	2	12	1915525	1915536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021592	ATTTAT	2	12	1934653	1934664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.