MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 5070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021592	TTAA	2	8	1910156	1910163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021592	ACTT	2	8	1910188	1910195	25 %	50 %	0 %	25 %	518653284
5003	NC_021592	GCAG	2	8	1910322	1910329	25 %	0 %	50 %	25 %	518653284
5004	NC_021592	AAAT	2	8	1910669	1910676	75 %	25 %	0 %	0 %	518653284
5005	NC_021592	TGTA	2	8	1911188	1911195	25 %	50 %	25 %	0 %	518653285
5006	NC_021592	AAAT	2	8	1911383	1911390	75 %	25 %	0 %	0 %	518653285
5007	NC_021592	ATTC	2	8	1911876	1911883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_021592	ATAA	2	8	1911916	1911923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021592	TATT	2	8	1911933	1911940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021592	CAAG	2	8	1912866	1912873	50 %	0 %	25 %	25 %	518653287
5011	NC_021592	CCAT	2	8	1913474	1913481	25 %	25 %	0 %	50 %	518653289
5012	NC_021592	ACAA	2	8	1913905	1913912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_021592	AAAT	2	8	1914175	1914182	75 %	25 %	0 %	0 %	518653290
5014	NC_021592	ATAA	2	8	1914306	1914313	75 %	25 %	0 %	0 %	518653290
5015	NC_021592	TTCA	2	8	1914594	1914601	25 %	50 %	0 %	25 %	518653290
5016	NC_021592	TATT	2	8	1914782	1914789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021592	AGTT	2	8	1914912	1914919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021592	AGCA	2	8	1915781	1915788	50 %	0 %	25 %	25 %	518653292
5019	NC_021592	TTGT	2	8	1916407	1916414	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021592	ATCT	2	8	1918137	1918144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_021592	TTCA	2	8	1918152	1918159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_021592	TGCA	2	8	1918964	1918971	25 %	25 %	25 %	25 %	518653294
5023	NC_021592	AGAA	2	8	1919015	1919022	75 %	0 %	25 %	0 %	518653294
5024	NC_021592	TAAA	2	8	1919140	1919147	75 %	25 %	0 %	0 %	518653294
5025	NC_021592	GTTA	2	8	1919699	1919706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021592	ATTA	2	8	1919725	1919732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021592	TTCG	2	8	1919836	1919843	0 %	50 %	25 %	25 %	518653295
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5032	NC_021592	AAAT	2	8	1921427	1921434	75 %	25 %	0 %	0 %	518653295
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5035	NC_021592	CCAT	2	8	1922232	1922239	25 %	25 %	0 %	50 %	518653297
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5041	NC_021592	ATTC	2	8	1924194	1924201	25 %	50 %	0 %	25 %	518653299
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5043	NC_021592	ATAA	2	8	1924842	1924849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021592	ATTA	2	8	1925219	1925226	50 %	50 %	0 %	0 %	518653300
5045	NC_021592	TGTA	2	8	1925331	1925338	25 %	50 %	25 %	0 %	518653300
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5047	NC_021592	GAAA	2	8	1926481	1926488	75 %	0 %	25 %	0 %	518653301
5048	NC_021592	CAGG	2	8	1926769	1926776	25 %	0 %	50 %	25 %	518653302
5049	NC_021592	CATA	2	8	1927527	1927534	50 %	25 %	0 %	25 %	518653303
5050	NC_021592	GTAT	2	8	1927804	1927811	25 %	50 %	25 %	0 %	518653303
5051	NC_021592	GATA	2	8	1927994	1928001	50 %	25 %	25 %	0 %	518653303
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5053	NC_021592	TTAA	2	8	1929115	1929122	50 %	50 %	0 %	0 %	518653304
5054	NC_021592	ATAG	2	8	1929364	1929371	50 %	25 %	25 %	0 %	518653304
5055	NC_021592	AGAA	2	8	1929583	1929590	75 %	0 %	25 %	0 %	518653304
5056	NC_021592	GGTA	2	8	1930009	1930016	25 %	25 %	50 %	0 %	518653304
5057	NC_021592	AATG	2	8	1930582	1930589	50 %	25 %	25 %	0 %	518653304
5058	NC_021592	CATA	2	8	1930817	1930824	50 %	25 %	0 %	25 %	518653305
5059	NC_021592	AATT	2	8	1930910	1930917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021592	TTTA	2	8	1931043	1931050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021592	ATTT	2	8	1931727	1931734	25 %	75 %	0 %	0 %	518653306
5062	NC_021592	TATT	2	8	1932367	1932374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021592	CTTT	2	8	1932445	1932452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_021592	TTAT	2	8	1932453	1932460	25 %	75 %	0 %	0 %	518653307
5065	NC_021592	TTAT	2	8	1932723	1932730	25 %	75 %	0 %	0 %	518653308
5066	NC_021592	TTCT	2	8	1932917	1932924	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_021592	TTAA	2	8	1932945	1932952	50 %	50 %	0 %	0 %	518653309
5068	NC_021592	TGTC	2	8	1933809	1933816	0 %	50 %	25 %	25 %	518653310
5069	NC_021592	TTTG	2	8	1934047	1934054	0 %	75 %	25 %	0 %	518653310
5070	NC_021592	TATT	2	8	1934211	1934218	25 %	75 %	0 %	0 %	518653310

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.