MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia plymuthica 4Rx13

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021591	CAAGGC	2	12	50708	50719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021591	AAACCT	2	12	92956	92967	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021591	AGGTTT	2	12	93002	93013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021591	GCCTTT	2	12	130815	130826	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021591	GAAATG	2	12	141697	141708	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021591	CCTTGT	14	84	157317	157400	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021591	ACAGCA	2	12	219815	219826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021591	CAGTGA	2	12	221867	221878	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021591	GCAACA	2	12	222103	222114	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021591	TAAGAC	2	12	254100	254111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021591	GGAAGG	2	12	259252	259263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021591	TAAGAC	2	12	293427	293438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021591	TGAAAA	2	12	311696	311707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021591	ATTTTT	2	12	331908	331919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021591	GGCAGT	2	12	375989	376000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021591	AATGCA	2	12	508627	508638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021591	TTATCA	2	12	564688	564699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021591	AGCGGC	2	12	579015	579026	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021591	TTAACC	2	12	621280	621291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021591	CCCACG	2	12	659213	659224	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021591	GGTAAC	2	12	713402	713413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021591	CTCTGC	2	12	734226	734237	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021591	GTGCGG	2	12	738898	738909	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021591	AATTTA	2	12	777556	777567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021591	TTTATT	2	12	806950	806961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021591	TAAGAC	2	12	822136	822147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021591	ATCTTG	2	12	847375	847386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021591	CTTTCT	2	12	879516	879527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021591	AAAAAG	2	12	879653	879664	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021591	ATTTTA	2	12	901491	901502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021591	TCATTT	2	12	906826	906837	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021591	TTTGAT	2	12	921105	921116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021591	TCGTTA	2	12	926559	926570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021591	TTTTAC	2	12	1034986	1034997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021591	CTTTCT	2	12	1118119	1118130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021591	CCAGTA	2	12	1126456	1126467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021591	CCAGAC	2	12	1132085	1132096	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021591	TCCGGC	2	12	1133694	1133705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021591	TGTTGA	2	12	1158884	1158895	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021591	GTTAAT	2	12	1176709	1176720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021591	CTGTCA	2	12	1182342	1182353	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021591	AGTAAA	2	12	1194380	1194391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021591	GGCGCT	2	12	1266712	1266723	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021591	TTTTTA	2	12	1338670	1338681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021591	CTGCGT	2	12	1364265	1364276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021591	TCAGCG	2	12	1370531	1370542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021591	TAATTT	2	12	1373292	1373303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021591	ATAAAT	2	12	1374481	1374492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021591	GCGCGG	2	12	1393396	1393407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021591	GGCGCT	2	12	1465711	1465722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021591	TATCTC	2	12	1533788	1533799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021591	TTTCTT	2	12	1539426	1539437	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021591	ATCATA	2	12	1590460	1590471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021591	AGCACC	2	12	1667301	1667312	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021591	CAAAGG	2	12	1683941	1683952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021591	CGTTGC	2	12	1711070	1711081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021591	CAATAA	2	12	1711154	1711165	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021591	GTGCCG	2	12	1738129	1738140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021591	CAAAAA	2	12	1754826	1754837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021591	AAAGGG	2	12	1784131	1784142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021591	ACTAAC	2	12	1786179	1786190	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021591	ATAAGG	2	12	1815296	1815307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021591	CTTTTT	2	12	1829763	1829774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021591	AGGCTA	2	12	1829977	1829988	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021591	TTCTAT	2	12	1841750	1841761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021591	CGGTAG	2	12	1843618	1843629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021591	ACGTTA	2	12	1857204	1857215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021591	GAACGG	2	12	1953474	1953485	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021591	CTGTTT	2	12	1963968	1963979	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021591	TTTTTC	2	12	1978628	1978639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021591	GCTTTT	2	12	1988306	1988317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021591	TTGATC	2	12	2024889	2024900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021591	ATAAAA	2	12	2028099	2028110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021591	TAAACT	2	12	2039336	2039347	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021591	CAGAAA	2	12	2051036	2051047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021591	CACCCG	2	12	2059881	2059892	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021591	TGCGCC	2	12	2076219	2076230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021591	TATTTT	2	12	2085112	2085123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021591	GGTAAC	2	12	2118412	2118423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021591	AAATGA	2	12	2119428	2119439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021591	TAGCGG	2	12	2128732	2128743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021591	AGAGGA	2	12	2132666	2132677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021591	CTTTTT	2	12	2136402	2136413	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021591	TTTATC	2	12	2164716	2164727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021591	GCAAAT	2	12	2180180	2180191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021591	CAATAA	2	12	2194869	2194880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021591	ATCAGG	2	12	2197412	2197423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021591	GGAGCG	2	12	2252395	2252406	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021591	GTTTTT	2	12	2271184	2271195	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021591	GCAACG	2	12	2339267	2339278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021591	CATTTT	2	12	2349511	2349522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021591	TCGTTT	2	12	2392352	2392363	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021591	GTTTGA	2	12	2408001	2408012	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021591	AATATC	2	12	2477787	2477798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021591	ATGATT	2	12	2496899	2496910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021591	CCTAAC	2	12	2496944	2496955	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021591	ACATTT	2	12	2503104	2503115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021591	GATGAA	2	12	2583162	2583173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021591	CCGCGC	2	12	2630095	2630106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021591	GTTATC	2	12	2631997	2632008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021591	AATAAA	2	12	2683493	2683504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021591	TATCAC	2	12	2785076	2785087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021591	ATAATG	2	12	2816934	2816945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021591	TTTACC	2	12	2821248	2821259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021591	ACAAAA	2	12	2842737	2842748	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021591	TAAAAT	2	12	2856857	2856868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021591	TGAAGA	2	12	2869352	2869363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021591	AGTAAT	2	12	2909698	2909709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021591	AAAAGG	2	12	2921207	2921218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021591	TAAAAT	2	12	2926247	2926258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021591	TAAAAA	2	12	2926360	2926371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021591	TTATCT	2	12	2949169	2949180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021591	CTAAAA	2	12	2963949	2963960	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021591	ACCGCA	2	12	3017325	3017336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021591	AACAAA	2	12	3048103	3048114	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021591	GAAAAT	2	12	3050802	3050813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021591	ATAAAA	2	12	3069263	3069274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021591	TAAATA	2	12	3081603	3081614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021591	TAACGC	2	12	3083924	3083935	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021591	AAAGGT	2	12	3132833	3132844	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021591	TTTTAA	2	12	3151328	3151339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021591	GCTATA	2	12	3166587	3166598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021591	CGCTGA	2	12	3173883	3173894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021591	TTATTG	2	12	3202004	3202015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021591	GAAAGA	2	12	3240903	3240914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021591	ATGAGC	2	12	3267505	3267516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021591	GCTTTT	2	12	3303143	3303154	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021591	CCGGTT	2	12	3309158	3309169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021591	CCATGC	2	12	3328665	3328676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021591	GGCAAC	2	12	3340884	3340895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021591	GAGAAT	2	12	3389492	3389503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021591	ATTAAC	2	12	3420450	3420461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021591	GTCAGG	2	12	3455330	3455341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_021591	CACAAA	2	12	3741660	3741671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021591	CTCAAC	2	12	3767244	3767255	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_021591	TTTTAA	2	12	3805900	3805911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021591	GATGCT	2	12	4077261	4077272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_021591	GGGCCG	2	12	4100321	4100332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021591	GACGCC	2	12	4117560	4117571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.