MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021555	GTTTT	2	10	17398	17407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021555	TTTGG	2	10	30957	30966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021555	TAGCT	2	10	34786	34795	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021555	TCAGA	2	10	35902	35911	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021555	AATTG	2	10	36129	36138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021555	CCCTC	2	10	42563	42572	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_021555	AACTT	2	10	42896	42905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021555	CAGCT	2	10	45162	45171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_021555	TTCTT	2	10	56443	56452	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021555	TTCTT	2	10	56498	56507	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021555	TTTTG	2	10	56577	56586	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021555	ATCAG	2	10	56664	56673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021555	ACCAA	2	10	56698	56707	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021555	CTTCA	2	10	59427	59436	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021555	CCCAA	2	10	62679	62688	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_021555	CTCCA	2	10	70848	70857	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_021555	AAAGA	2	10	70858	70867	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021555	CCTTT	2	10	78022	78031	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021555	GTTGG	2	10	108446	108455	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021555	CTTTG	2	10	112975	112984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021555	TTCAG	2	10	114596	114605	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021555	TAATT	2	10	121334	121343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021555	TCTTT	2	10	123531	123540	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021555	TAAAA	2	10	147773	147782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021555	GATGA	2	10	148847	148856	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021555	GGATG	2	10	149178	149187	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021555	ACACC	2	10	149758	149767	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_021555	ATGGC	2	10	150473	150482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021555	ACCCA	2	10	151034	151043	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_021555	CCAAC	2	10	151523	151532	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_021555	AAATT	2	10	151544	151553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021555	CACGA	2	10	152079	152088	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.