MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021555	CCT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021555	ATG	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021555	TGC	2	6	12090	12095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021555	GAA	2	6	13468	13473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021555	ACA	2	6	13504	13509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021555	CTT	2	6	14676	14681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021555	AAC	2	6	16107	16112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021555	GAG	2	6	17511	17516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021555	AAT	2	6	17521	17526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021555	TTA	2	6	17545	17550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021555	ATT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021555	CAT	2	6	19572	19577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021555	CAG	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021555	TAA	2	6	22101	22106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021555	AGG	2	6	22177	22182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021555	TAT	2	6	22212	22217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021555	TAA	2	6	23282	23287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021555	AAC	2	6	26752	26757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021555	GAT	2	6	26800	26805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021555	CAT	2	6	26829	26834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021555	AAG	2	6	26900	26905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021555	GAG	3	9	29444	29452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021555	AAG	2	6	30690	30695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021555	TAA	2	6	31006	31011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021555	CTT	2	6	31064	31069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021555	AGA	2	6	31254	31259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021555	TGC	2	6	31369	31374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021555	AGG	2	6	31387	31392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021555	GGA	2	6	31398	31403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021555	AGC	3	9	31502	31510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021555	TCA	2	6	34629	34634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021555	TTC	2	6	34769	34774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021555	AAT	2	6	34802	34807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021555	TTG	2	6	34814	34819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021555	GGT	2	6	34852	34857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021555	TCC	2	6	34886	34891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021555	GCA	2	6	35074	35079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021555	TGA	2	6	35089	35094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021555	TAA	2	6	35185	35190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021555	GGA	2	6	35290	35295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021555	TCT	2	6	35335	35340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021555	TCT	2	6	35392	35397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021555	TGG	2	6	35409	35414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021555	CAT	2	6	35508	35513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021555	TGT	2	6	35532	35537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021555	ACC	3	9	35586	35594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021555	TTA	2	6	35667	35672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021555	TTG	2	6	35700	35705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021555	CTA	2	6	35717	35722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021555	CTA	2	6	35725	35730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021555	ACT	2	6	35811	35816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021555	AAC	2	6	35867	35872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021555	TGC	2	6	35916	35921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021555	TGT	2	6	36072	36077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021555	GAT	2	6	36117	36122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021555	TGA	2	6	36251	36256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021555	GAG	2	6	36315	36320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021555	TGG	2	6	42467	42472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021555	CAG	2	6	42912	42917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021555	TTC	2	6	42925	42930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021555	GAA	2	6	42946	42951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021555	AAC	2	6	42964	42969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021555	AGA	2	6	43017	43022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021555	TTG	2	6	43056	43061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021555	CAG	2	6	45311	45316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021555	GCT	2	6	45328	45333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021555	AAC	2	6	45348	45353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021555	AAG	2	6	49213	49218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021555	CAA	2	6	49232	49237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021555	TCC	2	6	53504	53509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021555	CTT	2	6	53592	53597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021555	CTT	2	6	53634	53639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021555	ACC	2	6	53683	53688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021555	GTT	2	6	56364	56369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021555	TTC	2	6	56479	56484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021555	TGC	2	6	56627	56632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021555	CTT	2	6	58117	58122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021555	CCA	2	6	58162	58167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021555	AGA	2	6	58200	58205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021555	CTG	2	6	59398	59403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021555	AAT	2	6	59789	59794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021555	TGA	2	6	59812	59817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021555	GTT	2	6	59836	59841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021555	CTG	2	6	62785	62790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021555	TAG	2	6	62891	62896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021555	GGA	2	6	65025	65030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021555	GGT	2	6	65063	65068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021555	TCA	2	6	65072	65077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021555	GAG	2	6	65092	65097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021555	CTC	2	6	65103	65108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021555	CAA	2	6	65336	65341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021555	CTT	2	6	65391	65396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021555	TGA	2	6	65429	65434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021555	GTG	2	6	65453	65458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021555	CTA	2	6	65478	65483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021555	AGC	2	6	65537	65542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021555	ACA	2	6	65589	65594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021555	TAA	2	6	70765	70770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021555	AGC	2	6	70802	70807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021555	CAG	2	6	70819	70824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021555	AAG	2	6	70868	70873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021555	TCT	2	6	70949	70954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021555	AGT	2	6	73480	73485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021555	TTG	2	6	73499	73504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021555	CTC	2	6	74638	74643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021555	TTG	2	6	76138	76143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021555	AGT	2	6	76148	76153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021555	AAG	2	6	76849	76854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021555	AGC	2	6	76911	76916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021555	CAG	2	6	76981	76986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021555	CCA	2	6	77066	77071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021555	TCC	2	6	78740	78745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021555	GCT	2	6	79333	79338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021555	TTG	2	6	79811	79816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021555	TGG	2	6	79826	79831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021555	GAG	2	6	84018	84023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021555	TAC	2	6	84046	84051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021555	TAA	2	6	84093	84098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021555	TGG	3	9	84102	84110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021555	AGA	2	6	89832	89837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021555	AAC	2	6	91746	91751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021555	GGT	2	6	98796	98801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021555	GTG	2	6	98805	98810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021555	CTG	2	6	98848	98853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021555	CTT	3	9	99489	99497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021555	AGG	2	6	103836	103841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021555	GGC	2	6	103857	103862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021555	AGA	2	6	104721	104726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021555	GTT	2	6	104821	104826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021555	CTG	2	6	104941	104946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021555	CCT	2	6	105078	105083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021555	CAG	2	6	106521	106526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021555	TGG	2	6	106991	106996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021555	CTT	2	6	108435	108440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021555	TGA	2	6	108477	108482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021555	AGC	2	6	115106	115111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021555	CTG	2	6	115123	115128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021555	TGC	2	6	115159	115164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021555	AAT	2	6	117655	117660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021555	TGG	2	6	117669	117674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021555	AAT	2	6	119023	119028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_021555	GGC	2	6	119056	119061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_021555	AAG	2	6	148475	148480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_021555	GCC	2	6	149458	149463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.