MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021554	ATAAAT	2	12	3319	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021554	TTTAAA	2	12	3497	3508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021554	AAATCA	2	12	17190	17201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021554	AAAAAT	2	12	42679	42690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021554	ATTTTT	2	12	69111	69122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021554	AATATA	2	12	124741	124752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021554	GATTTT	2	12	189902	189913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021554	TTTATA	2	12	219508	219519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021554	ATTAAT	2	12	219531	219542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021554	ATATGA	2	12	265063	265074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021554	AGTGGA	2	12	283282	283293	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021554	ATATAG	2	12	304515	304526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021554	ATTTTC	2	12	309832	309843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021554	ATAATT	2	12	310782	310793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021554	AATTAT	2	12	315454	315465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021554	AACGAT	2	12	318126	318137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021554	TAACTT	2	12	326085	326096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021554	TTAGAA	2	12	349299	349310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021554	TAAAAT	2	12	380651	380662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021554	ATATGA	2	12	380695	380706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021554	TTGTAA	2	12	389154	389165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021554	TATAAA	2	12	403151	403162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021554	AATTTG	2	12	428219	428230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021554	TAAAGA	2	12	430493	430504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021554	TAATAT	2	12	447777	447788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021554	ATTGAA	2	12	452113	452124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021554	TAAAAT	2	12	456478	456489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021554	TCAAAA	2	12	467280	467291	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021554	TTTTTA	2	12	481066	481077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021554	AAAATG	2	12	486492	486503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021554	ACGTTG	2	12	506934	506945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021554	TTATAA	2	12	527375	527386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021554	AAATTT	2	12	534134	534145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021554	AATTTT	2	12	566574	566585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021554	TATAAC	2	12	578826	578837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021554	TTATAA	2	12	589420	589431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021554	GTTATA	2	12	590091	590102	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021554	CTTAAA	2	12	598523	598534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021554	ACATGT	2	12	608461	608472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021554	TAAAGT	2	12	628865	628876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021554	ATTGCG	2	12	637884	637895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021554	TAAAAT	2	12	657220	657231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021554	TTTTAA	2	12	663967	663978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021554	CATTAT	2	12	680580	680591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021554	CATCAA	2	12	691173	691184	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021554	TAATTT	2	12	695413	695424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021554	TGAATA	2	12	711894	711905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021554	GGATTC	2	12	723254	723265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021554	CAATTA	2	12	723490	723501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021554	TTTAAT	2	12	734602	734613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021554	TTAAAA	2	12	738030	738041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021554	TAGTTA	2	12	742458	742469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021554	TGAAAA	2	12	768986	768997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021554	ATAGTT	2	12	789309	789320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021554	GGTTTT	2	12	820783	820794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021554	ACAATA	2	12	828401	828412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021554	TAGAAT	2	12	856127	856138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021554	TAAAAA	2	12	858255	858266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021554	ATATAA	2	12	866258	866269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021554	TTTTGA	2	12	868706	868717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021554	TCATTT	2	12	874699	874710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021554	TAAAAA	2	12	877786	877797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021554	AAATTA	2	12	884617	884628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021554	AAGCAC	2	12	893349	893360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021554	ATGATT	2	12	893455	893466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021554	TAAAAT	2	12	901112	901123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021554	AGTTAG	2	12	931771	931782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021554	TTTAAT	2	12	971780	971791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021554	AACGGA	2	12	1003699	1003710	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021554	TACATA	2	12	1007703	1007714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021554	AAAAGC	2	12	1008244	1008255	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021554	CATTTA	2	12	1031575	1031586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021554	ATCATA	2	12	1033480	1033491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021554	TCAAAA	2	12	1033623	1033634	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021554	TCAAAA	2	12	1039784	1039795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021554	TATGTA	2	12	1053555	1053566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021554	TTTTCT	2	12	1053650	1053661	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021554	TTTATA	2	12	1089663	1089674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021554	GAATTA	2	12	1096236	1096247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021554	TGATTT	2	12	1113426	1113437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021554	ATTTTT	2	12	1113601	1113612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021554	ATAATT	2	12	1114398	1114409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021554	TCATTA	2	12	1119685	1119696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021554	TAATGA	2	12	1127777	1127788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021554	GAAAAA	2	12	1134974	1134985	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021554	AAATAT	2	12	1137390	1137401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021554	ATTTAT	2	12	1146192	1146203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021554	AAATTT	2	12	1150918	1150929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021554	AAGTAA	2	12	1172614	1172625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021554	TCGTTT	2	12	1175210	1175221	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021554	TTAATT	2	12	1185927	1185938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021554	AATTAA	2	12	1188715	1188726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021554	TGATTT	2	12	1193681	1193692	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021554	GAAATT	2	12	1233615	1233626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021554	AATGAT	2	12	1246389	1246400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021554	TAAAGA	2	12	1260867	1260878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021554	TATATT	2	12	1281326	1281337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021554	TTAAAG	2	12	1320977	1320988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021554	ATTAAA	2	12	1349983	1349994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021554	GTATAT	2	12	1357387	1357398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021554	ATATAA	2	12	1357652	1357663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021554	AAAATA	2	12	1371719	1371730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021554	GTTTTA	2	12	1387467	1387478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021554	AAATAA	2	12	1390518	1390529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021554	ATCATT	2	12	1391586	1391597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021554	ATTAAG	2	12	1392155	1392166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021554	ATACTT	2	12	1392204	1392215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021554	ATTTAA	2	12	1395690	1395701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021554	TAAAAT	2	12	1403045	1403056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021554	TATCTT	2	12	1424850	1424861	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021554	TTGATT	2	12	1424913	1424924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021554	TTCAAA	2	12	1425202	1425213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021554	ATTCTA	2	12	1433758	1433769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021554	AATAAA	2	12	1436610	1436621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021554	TTTTCT	2	12	1450905	1450916	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021554	TACTTG	2	12	1492866	1492877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021554	TCATAA	2	12	1496296	1496307	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021554	TTAATC	2	12	1506357	1506368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021554	TGAAAA	2	12	1525798	1525809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021554	TTATTT	2	12	1575383	1575394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021554	AATAAA	2	12	1595626	1595637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021554	ATAAAA	2	12	1599414	1599425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021554	ACAAGA	2	12	1604989	1605000	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021554	TTATTT	2	12	1617768	1617779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021554	TAAAAA	2	12	1617890	1617901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021554	TTATAG	2	12	1627022	1627033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021554	AGCCAA	2	12	1662943	1662954	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021554	TTGACT	2	12	1662962	1662973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021554	TTTAAC	2	12	1667846	1667857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021554	TTATAA	2	12	1670271	1670282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021554	ACCTTT	2	12	1680228	1680239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021554	AGTTTT	2	12	1708585	1708596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021554	AATTAA	2	12	1709830	1709841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021554	TAAAAC	2	12	1712969	1712980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021554	AATTTA	2	12	1722779	1722790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021554	ATTTTC	2	12	1728814	1728825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021554	TTTTAG	2	12	1741600	1741611	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021554	TAAAAA	2	12	1768277	1768288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021554	TACTTT	2	12	1782954	1782965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_021554	CATTAT	2	12	1783111	1783122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_021554	TTTCAT	2	12	1788155	1788166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_021554	TATTTA	2	12	1807377	1807388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021554	TAATTA	2	12	1821715	1821726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021554	TATCAA	2	12	1825619	1825630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_021554	ATTTTA	2	12	1832962	1832973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021554	ATTTGT	2	12	1833029	1833040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021554	TCAAAA	2	12	1847093	1847104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_021554	ATTATA	2	12	1897587	1897598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021554	TAAATA	2	12	1899441	1899452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021554	GAATAA	2	12	1907212	1907223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021554	TATTTT	2	12	1935690	1935701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021554	TTTAAC	2	12	1943453	1943464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_021554	ATTTAC	2	12	1980554	1980565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_021554	TTTTAA	2	12	2021453	2021464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021554	TAATTT	2	12	2031428	2031439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021554	ATTCTT	2	12	2034843	2034854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_021554	ATTATG	2	12	2041412	2041423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021554	AATTTA	2	12	2080827	2080838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021554	TTTAAA	2	12	2081198	2081209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021554	AATTTT	2	12	2083152	2083163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_021554	TTTTTA	2	12	2141708	2141719	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021554	CCTATT	2	12	2141777	2141788	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_021554	ATCATT	2	12	2302724	2302735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.