MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus CA-347 plasmid

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021552	AATAT	2	10	1193	1202	60 %	40 %	0 %	0 %	514064934
2	NC_021552	TTAAA	2	10	1740	1749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021552	TAGAT	2	10	3447	3456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021552	TGTGA	2	10	5154	5163	20 %	40 %	40 %	0 %	514064939
5	NC_021552	GCTGT	2	10	5683	5692	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021552	CTTTT	2	10	6321	6330	0 %	80 %	0 %	20 %	514064940
7	NC_021552	ATGAT	2	10	6950	6959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021552	AGAAA	2	10	7310	7319	80 %	0 %	20 %	0 %	514064942
9	NC_021552	TAGCT	2	10	7474	7483	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021552	TAATT	2	10	8305	8314	40 %	60 %	0 %	0 %	514064943
11	NC_021552	CATAA	2	10	9130	9139	60 %	20 %	0 %	20 %	514064944
12	NC_021552	GATAC	2	10	9334	9343	40 %	20 %	20 %	20 %	514064944
13	NC_021552	CTCAA	2	10	10262	10271	40 %	20 %	0 %	40 %	514064944
14	NC_021552	AATTA	2	10	10274	10283	60 %	40 %	0 %	0 %	514064944
15	NC_021552	AATAT	2	10	10691	10700	60 %	40 %	0 %	0 %	514064945
16	NC_021552	TAATT	2	10	11640	11649	40 %	60 %	0 %	0 %	514064946
17	NC_021552	GTTTA	2	10	13930	13939	20 %	60 %	20 %	0 %	514064948
18	NC_021552	GGAAA	2	10	15796	15805	60 %	0 %	40 %	0 %	514064951
19	NC_021552	AACAA	2	10	16393	16402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021552	TATTT	2	10	16448	16457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021552	AAACA	2	10	16768	16777	80 %	0 %	0 %	20 %	514064952
22	NC_021552	ATAAA	2	10	18092	18101	80 %	20 %	0 %	0 %	514064953
23	NC_021552	TACTT	2	10	19253	19262	20 %	60 %	0 %	20 %	514064955
24	NC_021552	ATGAA	2	10	21596	21605	60 %	20 %	20 %	0 %	514064959
25	NC_021552	TAACG	2	10	23107	23116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.