MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus CA-347 plasmid

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021552	TTTA	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021552	TAAA	2	8	157	164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021552	TAAA	2	8	173	180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021552	AAAG	2	8	268	275	75 %	0 %	25 %	0 %	514064934
5	NC_021552	CTAA	2	8	325	332	50 %	25 %	0 %	25 %	514064934
6	NC_021552	TAAA	2	8	536	543	75 %	25 %	0 %	0 %	514064934
7	NC_021552	GAAG	2	8	636	643	50 %	0 %	50 %	0 %	514064934
8	NC_021552	ATGA	2	8	781	788	50 %	25 %	25 %	0 %	514064934
9	NC_021552	TGTA	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021552	TTTG	2	8	1889	1896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021552	ATAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	514064936
12	NC_021552	TTTC	2	8	2912	2919	0 %	75 %	0 %	25 %	514064937
13	NC_021552	TAAG	2	8	3117	3124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021552	ATTT	2	8	3142	3149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021552	ATGA	2	8	3190	3197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021552	AAAG	2	8	3374	3381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021552	TTTC	2	8	3803	3810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021552	TATT	2	8	3819	3826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021552	TTTC	2	8	3827	3834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021552	AATT	2	8	3923	3930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021552	TTAT	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021552	TTAG	2	8	4653	4660	25 %	50 %	25 %	0 %	514064938
23	NC_021552	TGAA	2	8	4798	4805	50 %	25 %	25 %	0 %	514064938
24	NC_021552	TTAC	2	8	4920	4927	25 %	50 %	0 %	25 %	514064938
25	NC_021552	TTTA	2	8	5060	5067	25 %	75 %	0 %	0 %	514064938
26	NC_021552	TAAT	2	8	5730	5737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021552	CATT	2	8	6016	6023	25 %	50 %	0 %	25 %	514064940
28	NC_021552	AATT	2	8	6084	6091	50 %	50 %	0 %	0 %	514064940
29	NC_021552	ATTC	2	8	6441	6448	25 %	50 %	0 %	25 %	514064940
30	NC_021552	TAAC	2	8	6829	6836	50 %	25 %	0 %	25 %	514064940
31	NC_021552	ATAA	2	8	7398	7405	75 %	25 %	0 %	0 %	514064942
32	NC_021552	AAAT	2	8	7819	7826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021552	TATT	2	8	7922	7929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021552	TTAA	2	8	8152	8159	50 %	50 %	0 %	0 %	514064943
35	NC_021552	TTTA	2	8	8241	8248	25 %	75 %	0 %	0 %	514064943
36	NC_021552	TGCT	2	8	9023	9030	0 %	50 %	25 %	25 %	514064944
37	NC_021552	AAGT	2	8	9108	9115	50 %	25 %	25 %	0 %	514064944
38	NC_021552	AAAG	2	8	9596	9603	75 %	0 %	25 %	0 %	514064944
39	NC_021552	CATT	2	8	9739	9746	25 %	50 %	0 %	25 %	514064944
40	NC_021552	ATTA	2	8	9777	9784	50 %	50 %	0 %	0 %	514064944
41	NC_021552	AATT	2	8	9818	9825	50 %	50 %	0 %	0 %	514064944
42	NC_021552	AAAG	2	8	10030	10037	75 %	0 %	25 %	0 %	514064944
43	NC_021552	ATTT	2	8	10072	10079	25 %	75 %	0 %	0 %	514064944
44	NC_021552	TGGA	2	8	10318	10325	25 %	25 %	50 %	0 %	514064944
45	NC_021552	ATTT	2	8	10838	10845	25 %	75 %	0 %	0 %	514064945
46	NC_021552	TAAG	2	8	11172	11179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021552	TAGA	2	8	11474	11481	50 %	25 %	25 %	0 %	514064946
48	NC_021552	AACG	2	8	11527	11534	50 %	0 %	25 %	25 %	514064946
49	NC_021552	ACTT	2	8	11738	11745	25 %	50 %	0 %	25 %	514064946
50	NC_021552	CTAA	2	8	11873	11880	50 %	25 %	0 %	25 %	514064946
51	NC_021552	TTCA	2	8	12948	12955	25 %	50 %	0 %	25 %	514064947
52	NC_021552	CATT	2	8	12961	12968	25 %	50 %	0 %	25 %	514064947
53	NC_021552	AATT	2	8	13206	13213	50 %	50 %	0 %	0 %	514064947
54	NC_021552	AAGA	2	8	13813	13820	75 %	0 %	25 %	0 %	514064948
55	NC_021552	TAAA	2	8	14039	14046	75 %	25 %	0 %	0 %	514064948
56	NC_021552	TGTA	2	8	14387	14394	25 %	50 %	25 %	0 %	514064949
57	NC_021552	TGTT	2	8	14703	14710	0 %	75 %	25 %	0 %	514064950
58	NC_021552	GTAA	2	8	14888	14895	50 %	25 %	25 %	0 %	514064950
59	NC_021552	GTAT	2	8	15285	15292	25 %	50 %	25 %	0 %	514064950
60	NC_021552	AACA	2	8	15349	15356	75 %	0 %	0 %	25 %	514064950
61	NC_021552	ATTT	2	8	15742	15749	25 %	75 %	0 %	0 %	514064951
62	NC_021552	TTGA	2	8	15922	15929	25 %	50 %	25 %	0 %	514064951
63	NC_021552	AACG	2	8	16217	16224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021552	TATT	2	8	16316	16323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021552	TCAT	2	8	17537	17544	25 %	50 %	0 %	25 %	514064953
66	NC_021552	TTAA	2	8	17917	17924	50 %	50 %	0 %	0 %	514064953
67	NC_021552	GGAT	2	8	18160	18167	25 %	25 %	50 %	0 %	514064953
68	NC_021552	AAAG	2	8	19463	19470	75 %	0 %	25 %	0 %	514064955
69	NC_021552	CATA	2	8	19778	19785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021552	TAAG	2	8	20095	20102	50 %	25 %	25 %	0 %	514064956
71	NC_021552	ATTA	2	8	20231	20238	50 %	50 %	0 %	0 %	514064956
72	NC_021552	AGAT	2	8	20470	20477	50 %	25 %	25 %	0 %	514064957
73	NC_021552	AAAG	2	8	21001	21008	75 %	0 %	25 %	0 %	514064958
74	NC_021552	TCAA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	0 %	25 %	514064958
75	NC_021552	GATA	2	8	21151	21158	50 %	25 %	25 %	0 %	514064958
76	NC_021552	TTTG	2	8	21270	21277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021552	ATTT	2	8	21644	21651	25 %	75 %	0 %	0 %	514064959
78	NC_021552	AGAT	2	8	22274	22281	50 %	25 %	25 %	0 %	514064959
79	NC_021552	AGAA	2	8	22379	22386	75 %	0 %	25 %	0 %	514064959
80	NC_021552	TCCT	2	8	22637	22644	0 %	50 %	0 %	50 %	514064960
81	NC_021552	ATTT	2	8	22669	22676	25 %	75 %	0 %	0 %	514064960
82	NC_021552	TTAA	2	8	22695	22702	50 %	50 %	0 %	0 %	514064960
83	NC_021552	TTTC	2	8	22802	22809	0 %	75 %	0 %	25 %	514064960
84	NC_021552	CATT	2	8	22835	22842	25 %	50 %	0 %	25 %	514064960
85	NC_021552	TCAT	2	8	23159	23166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021552	ATAA	2	8	23287	23294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021552	ATTT	2	8	23375	23382	25 %	75 %	0 %	0 %	514064961
88	NC_021552	TTTG	2	8	23624	23631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021552	CAAA	2	8	23724	23731	75 %	0 %	0 %	25 %	514064962
90	NC_021552	TCTT	2	8	24097	24104	0 %	75 %	0 %	25 %	514064962
91	NC_021552	CATC	2	8	24554	24561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.