MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347 plasmid

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021552	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021552	ACT	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021552	TAA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021552	TAT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021552	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021552	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021552	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021552	TGA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021552	CGA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021552	TAA	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021552	GAA	2	6	2261	2266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021552	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021552	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021552	AAT	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021552	TCT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021552	TCG	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021552	GTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021552	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021552	ACG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021552	TAA	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021552	GAA	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021552	ATT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021552	TCT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021552	GAC	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021552	TAA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021552	CAT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021552	TCA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021552	TAT	2	6	5697	5702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021552	CAA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021552	ACT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021552	TAG	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021552	CTT	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021552	TTG	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021552	ATT	2	6	7021	7026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021552	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021552	CTA	2	6	7527	7532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021552	TAA	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021552	TAT	2	6	7590	7595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021552	ATT	2	6	7667	7672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021552	TGA	2	6	7732	7737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021552	TAT	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021552	ATA	2	6	7834	7839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021552	ATA	2	6	7883	7888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021552	ATA	2	6	7895	7900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021552	AAT	2	6	8830	8835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021552	TAT	2	6	8866	8871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021552	AAG	2	6	8882	8887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021552	ATA	2	6	11043	11048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021552	TTA	2	6	11072	11077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021552	CTT	2	6	11155	11160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021552	CAA	2	6	11209	11214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021552	AAT	2	6	14058	14063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021552	AGG	2	6	14093	14098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021552	TAA	2	6	16145	16150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021552	ATG	2	6	16239	16244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021552	ATT	2	6	16263	16268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021552	GTT	2	6	16339	16344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021552	ATA	2	6	16365	16370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021552	ATT	2	6	16429	16434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021552	TAA	2	6	16468	16473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021552	GTT	2	6	16493	16498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021552	TGA	2	6	19867	19872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021552	TAA	2	6	19923	19928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021552	AGA	2	6	21220	21225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021552	AGA	2	6	21229	21234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021552	ATT	2	6	21284	21289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021552	CAA	2	6	21385	21390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021552	ATA	2	6	21474	21479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021552	AGT	2	6	21481	21486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021552	TAA	2	6	21548	21553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021552	ATT	2	6	22478	22483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021552	AGA	2	6	22941	22946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021552	TAT	2	6	23069	23074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021552	ATG	2	6	23141	23146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021552	CCT	2	6	23175	23180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021552	GAC	2	6	23210	23215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021552	TCT	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021552	TAA	2	6	23262	23267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021552	TGT	2	6	23269	23274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021552	GAT	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021552	ATT	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021552	ATC	2	6	24460	24465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021552	TAA	3	9	24522	24530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021552	TAA	2	6	24537	24542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.