MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus CA-347 plasmid

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021552	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021552	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
3	NC_021552	A	7	7	486	492	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
4	NC_021552	A	7	7	969	975	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
5	NC_021552	A	6	6	1057	1062	100 %	0 %	0 %	0 %	514064934
6	NC_021552	A	7	7	1293	1299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021552	A	7	7	1458	1464	100 %	0 %	0 %	0 %	514064935
8	NC_021552	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021552	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021552	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021552	T	6	6	2201	2206	0 %	100 %	0 %	0 %	514064936
12	NC_021552	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021552	T	6	6	2648	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
14	NC_021552	T	7	7	2672	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
15	NC_021552	T	6	6	2723	2728	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
16	NC_021552	T	7	7	2828	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
17	NC_021552	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
18	NC_021552	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	514064937
19	NC_021552	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021552	T	7	7	3308	3314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021552	T	7	7	3463	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021552	A	6	6	3765	3770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021552	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021552	A	7	7	3978	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021552	A	6	6	4288	4293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021552	T	6	6	4575	4580	0 %	100 %	0 %	0 %	514064938
27	NC_021552	A	6	6	4788	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	514064938
28	NC_021552	T	6	6	5201	5206	0 %	100 %	0 %	0 %	514064939
29	NC_021552	A	6	6	5245	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	514064939
30	NC_021552	A	6	6	5512	5517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021552	A	6	6	5762	5767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021552	T	6	6	6246	6251	0 %	100 %	0 %	0 %	514064940
33	NC_021552	T	7	7	6300	6306	0 %	100 %	0 %	0 %	514064940
34	NC_021552	A	6	6	7431	7436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021552	A	6	6	7620	7625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021552	A	6	6	7689	7694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021552	T	6	6	7774	7779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021552	T	8	8	8209	8216	0 %	100 %	0 %	0 %	514064943
39	NC_021552	T	6	6	8283	8288	0 %	100 %	0 %	0 %	514064943
40	NC_021552	T	6	6	8376	8381	0 %	100 %	0 %	0 %	514064943
41	NC_021552	T	6	6	8535	8540	0 %	100 %	0 %	0 %	514064943
42	NC_021552	T	8	8	8691	8698	0 %	100 %	0 %	0 %	514064943
43	NC_021552	T	6	6	8956	8961	0 %	100 %	0 %	0 %	514064944
44	NC_021552	A	7	7	9320	9326	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
45	NC_021552	A	8	8	9361	9368	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
46	NC_021552	A	6	6	9754	9759	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
47	NC_021552	T	7	7	9849	9855	0 %	100 %	0 %	0 %	514064944
48	NC_021552	A	6	6	10402	10407	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
49	NC_021552	A	6	6	10613	10618	100 %	0 %	0 %	0 %	514064944
50	NC_021552	A	6	6	10706	10711	100 %	0 %	0 %	0 %	514064945
51	NC_021552	A	6	6	10802	10807	100 %	0 %	0 %	0 %	514064945
52	NC_021552	A	6	6	11213	11218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021552	A	6	6	11900	11905	100 %	0 %	0 %	0 %	514064947
54	NC_021552	A	7	7	13221	13227	100 %	0 %	0 %	0 %	514064947
55	NC_021552	A	6	6	13265	13270	100 %	0 %	0 %	0 %	514064947
56	NC_021552	T	6	6	13598	13603	0 %	100 %	0 %	0 %	514064948
57	NC_021552	A	6	6	14030	14035	100 %	0 %	0 %	0 %	514064948
58	NC_021552	T	7	7	14644	14650	0 %	100 %	0 %	0 %	514064950
59	NC_021552	A	6	6	15310	15315	100 %	0 %	0 %	0 %	514064950
60	NC_021552	A	6	6	16015	16020	100 %	0 %	0 %	0 %	514064951
61	NC_021552	A	7	7	16413	16419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021552	A	6	6	16873	16878	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
63	NC_021552	A	6	6	17101	17106	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
64	NC_021552	T	6	6	17110	17115	0 %	100 %	0 %	0 %	514064953
65	NC_021552	A	7	7	17262	17268	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
66	NC_021552	T	6	6	17314	17319	0 %	100 %	0 %	0 %	514064953
67	NC_021552	A	6	6	17689	17694	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
68	NC_021552	T	6	6	17757	17762	0 %	100 %	0 %	0 %	514064953
69	NC_021552	A	6	6	17816	17821	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
70	NC_021552	T	6	6	18016	18021	0 %	100 %	0 %	0 %	514064953
71	NC_021552	A	7	7	18146	18152	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
72	NC_021552	A	6	6	18190	18195	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
73	NC_021552	A	6	6	18216	18221	100 %	0 %	0 %	0 %	514064953
74	NC_021552	T	6	6	18230	18235	0 %	100 %	0 %	0 %	514064953
75	NC_021552	A	7	7	18989	18995	100 %	0 %	0 %	0 %	514064954
76	NC_021552	T	6	6	19011	19016	0 %	100 %	0 %	0 %	514064954
77	NC_021552	A	7	7	19157	19163	100 %	0 %	0 %	0 %	514064955
78	NC_021552	A	6	6	19325	19330	100 %	0 %	0 %	0 %	514064955
79	NC_021552	A	6	6	19443	19448	100 %	0 %	0 %	0 %	514064955
80	NC_021552	A	6	6	19478	19483	100 %	0 %	0 %	0 %	514064955
81	NC_021552	A	6	6	19789	19794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021552	T	6	6	19828	19833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021552	T	6	6	19860	19865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021552	A	6	6	19874	19879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021552	A	7	7	20151	20157	100 %	0 %	0 %	0 %	514064956
86	NC_021552	T	6	6	20288	20293	0 %	100 %	0 %	0 %	514064956
87	NC_021552	A	6	6	20447	20452	100 %	0 %	0 %	0 %	514064957
88	NC_021552	A	6	6	20574	20579	100 %	0 %	0 %	0 %	514064957
89	NC_021552	A	7	7	20872	20878	100 %	0 %	0 %	0 %	514064958
90	NC_021552	T	6	6	21288	21293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021552	C	6	6	21312	21317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_021552	G	6	6	21555	21560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021552	T	6	6	21649	21654	0 %	100 %	0 %	0 %	514064959
94	NC_021552	A	7	7	21717	21723	100 %	0 %	0 %	0 %	514064959
95	NC_021552	A	6	6	22189	22194	100 %	0 %	0 %	0 %	514064959
96	NC_021552	T	6	6	22395	22400	0 %	100 %	0 %	0 %	514064959
97	NC_021552	A	6	6	22719	22724	100 %	0 %	0 %	0 %	514064960
98	NC_021552	T	6	6	23040	23045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021552	T	6	6	23074	23079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021552	A	6	6	23585	23590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021552	T	7	7	23821	23827	0 %	100 %	0 %	0 %	514064962
102	NC_021552	T	6	6	23946	23951	0 %	100 %	0 %	0 %	514064962
103	NC_021552	T	8	8	24250	24257	0 %	100 %	0 %	0 %	514064962
104	NC_021552	T	6	6	24321	24326	0 %	100 %	0 %	0 %	514064962

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.