MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16I

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021528	GAAC	2	8	821	828	50 %	0 %	25 %	25 %	513846969
2	NC_021528	GCCA	2	8	1059	1066	25 %	0 %	25 %	50 %	513846969
3	NC_021528	TAAT	2	8	1725	1732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021528	TTAT	2	8	2664	2671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021528	GATA	2	8	2675	2682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021528	AGTA	2	8	3087	3094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021528	CAGT	2	8	3393	3400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021528	ATGG	2	8	3785	3792	25 %	25 %	50 %	0 %	513846970
9	NC_021528	TGAT	2	8	3875	3882	25 %	50 %	25 %	0 %	513846970
10	NC_021528	TCCG	2	8	4091	4098	0 %	25 %	25 %	50 %	513846970
11	NC_021528	ACCA	2	8	4283	4290	50 %	0 %	0 %	50 %	513846970
12	NC_021528	TTGT	2	8	4643	4650	0 %	75 %	25 %	0 %	513846970
13	NC_021528	ATTT	2	8	5045	5052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021528	TTCA	2	8	5098	5105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021528	GTGC	2	8	5119	5126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021528	AGCT	2	8	5242	5249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021528	TAAA	2	8	5293	5300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021528	ATCA	2	8	5787	5794	50 %	25 %	0 %	25 %	513846971
19	NC_021528	AACT	2	8	6478	6485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021528	CTAA	2	8	6642	6649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021528	ATTT	2	8	6692	6699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021528	CCGC	2	8	6756	6763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021528	CGTG	2	8	6766	6773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021528	CTAC	2	8	6984	6991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021528	ATGT	2	8	8270	8277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021528	AACT	2	8	8560	8567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021528	GTGA	2	8	8694	8701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021528	GAAT	2	8	8753	8760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021528	AGTT	2	8	9153	9160	25 %	50 %	25 %	0 %	513846973
30	NC_021528	AACC	2	8	9312	9319	50 %	0 %	0 %	50 %	513846973
31	NC_021528	GAAA	2	8	9821	9828	75 %	0 %	25 %	0 %	513846973
32	NC_021528	CAAG	2	8	10022	10029	50 %	0 %	25 %	25 %	513846973
33	NC_021528	TTGA	2	8	10127	10134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021528	AGTA	2	8	10174	10181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021528	AAAT	2	8	10227	10234	75 %	25 %	0 %	0 %	513846974
36	NC_021528	ATAA	2	8	10857	10864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021528	TAAA	2	8	11188	11195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021528	TAAA	2	8	11733	11740	75 %	25 %	0 %	0 %	513846975
39	NC_021528	TGCC	2	8	12055	12062	0 %	25 %	25 %	50 %	513846975
40	NC_021528	CGAA	2	8	12415	12422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021528	AATC	2	8	12794	12801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021528	ATCG	2	8	12923	12930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021528	ACTA	2	8	12994	13001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.