MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16I

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021528	CAT	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846968
2	NC_021528	GAC	2	6	69	74	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846968
3	NC_021528	AGA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
4	NC_021528	GCA	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846968
5	NC_021528	AAC	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846968
6	NC_021528	CCA	2	6	473	478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846968
7	NC_021528	AAG	3	9	491	499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
8	NC_021528	TCA	2	6	539	544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846968
9	NC_021528	GAA	2	6	657	662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
10	NC_021528	CCG	2	6	700	705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846968
11	NC_021528	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
12	NC_021528	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
13	NC_021528	AGG	2	6	798	803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513846968
14	NC_021528	AAG	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846969
15	NC_021528	GTA	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846969
16	NC_021528	AAG	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846969
17	NC_021528	TGT	3	9	1261	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846969
18	NC_021528	CGG	2	6	1361	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846969
19	NC_021528	CAT	2	6	1409	1414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846969
20	NC_021528	TCA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021528	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021528	ACG	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021528	GTA	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021528	TTG	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021528	GTA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021528	TTG	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021528	ACA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021528	CAA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021528	TGT	2	6	2831	2836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021528	TTA	2	6	2837	2842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021528	CAA	2	6	2850	2855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021528	AAC	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021528	TAT	2	6	2926	2931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021528	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021528	GAA	2	6	3045	3050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021528	TAC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021528	TTA	2	6	3148	3153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021528	GTA	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021528	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021528	ACA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021528	AAC	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021528	CGG	2	6	3596	3601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846970
43	NC_021528	AGC	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846970
44	NC_021528	CGG	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846970
45	NC_021528	ATA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846970
46	NC_021528	CAC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846970
47	NC_021528	TCA	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846970
48	NC_021528	TGA	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846970
49	NC_021528	CGA	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846970
50	NC_021528	CGC	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846970
51	NC_021528	ATT	2	6	4476	4481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846970
52	NC_021528	TGA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846970
53	NC_021528	TAG	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021528	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021528	TGA	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846971
56	NC_021528	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846971
57	NC_021528	ACA	3	9	5644	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846971
58	NC_021528	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846971
59	NC_021528	CAA	2	6	5709	5714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846971
60	NC_021528	AAG	2	6	5737	5742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846971
61	NC_021528	CAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846971
62	NC_021528	TTA	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846971
63	NC_021528	TGG	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021528	TCA	2	6	6183	6188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021528	ACT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021528	GTA	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021528	CAC	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021528	AAC	2	6	6392	6397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021528	GAA	3	9	6558	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021528	TGT	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021528	GTT	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021528	GCC	2	6	6776	6781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021528	GCG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021528	TAG	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021528	ACT	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021528	GTT	3	9	7338	7346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846972
77	NC_021528	CAG	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846972
78	NC_021528	TAA	2	6	7374	7379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846972
79	NC_021528	TTC	2	6	7517	7522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846972
80	NC_021528	ATG	2	6	7841	7846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021528	ATC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021528	CTT	2	6	7905	7910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021528	GGC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021528	GCT	2	6	7966	7971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021528	TAA	2	6	8054	8059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021528	TAG	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021528	AAC	2	6	8218	8223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021528	AAT	2	6	8349	8354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021528	AAG	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021528	ATT	2	6	8393	8398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021528	TAA	2	6	9259	9264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846973
92	NC_021528	TGA	2	6	9337	9342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846973
93	NC_021528	GAA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846973
94	NC_021528	AGT	2	6	9563	9568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846973
95	NC_021528	ACT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846973
96	NC_021528	TTA	2	6	9705	9710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846973
97	NC_021528	AGA	2	6	9721	9726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846973
98	NC_021528	ATG	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846973
99	NC_021528	AAC	2	6	9961	9966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846973
100	NC_021528	ATC	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021528	CAG	2	6	10267	10272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846974
102	NC_021528	ATT	2	6	10391	10396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
103	NC_021528	AAT	2	6	10438	10443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846974
104	NC_021528	ATC	2	6	10464	10469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846974
105	NC_021528	AAG	2	6	10535	10540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846974
106	NC_021528	ATC	2	6	10570	10575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846974
107	NC_021528	ATT	2	6	10579	10584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
108	NC_021528	CTT	2	6	10656	10661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846974
109	NC_021528	ATT	2	6	10698	10703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
110	NC_021528	ACT	2	6	10738	10743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846974
111	NC_021528	ATT	2	6	10777	10782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
112	NC_021528	TTA	2	6	10886	10891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021528	CTT	2	6	10915	10920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021528	ATG	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021528	TGG	2	6	11107	11112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021528	ATA	2	6	11247	11252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021528	TGC	3	9	11290	11298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021528	ACA	2	6	11310	11315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021528	GAG	2	6	11530	11535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513846975
120	NC_021528	TTC	2	6	11570	11575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846975
121	NC_021528	TAT	2	6	11580	11585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846975
122	NC_021528	CTT	2	6	11591	11596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846975
123	NC_021528	ATC	2	6	11597	11602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846975
124	NC_021528	GTG	2	6	11619	11624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846975
125	NC_021528	AAT	2	6	11630	11635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846975
126	NC_021528	CAA	2	6	11744	11749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846975
127	NC_021528	TGA	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846975
128	NC_021528	GAA	2	6	11852	11857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846975
129	NC_021528	AAT	2	6	11872	11877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846975
130	NC_021528	GTT	2	6	11896	11901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846975
131	NC_021528	TTA	2	6	12083	12088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846975
132	NC_021528	CAA	3	9	12151	12159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846975
133	NC_021528	ATA	2	6	12240	12245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846975
134	NC_021528	CAA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021528	CTA	2	6	12681	12686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021528	ATG	2	6	12830	12835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021528	TTA	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021528	GAC	2	6	12970	12975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021528	GTA	2	6	13140	13145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021528	ACG	3	9	13223	13231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.