MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16I

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021528	CAT	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846968
2	NC_021528	GAC	2	6	69	74	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846968
3	NC_021528	AGA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
4	NC_021528	GCA	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846968
5	NC_021528	AAC	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846968
6	NC_021528	CCA	2	6	473	478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846968
7	NC_021528	AAG	3	9	491	499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
8	NC_021528	TCA	2	6	539	544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846968
9	NC_021528	GAA	2	6	657	662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
10	NC_021528	CCG	2	6	700	705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846968
11	NC_021528	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
12	NC_021528	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846968
13	NC_021528	AGG	2	6	798	803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513846968
14	NC_021528	AAG	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846969
15	NC_021528	GTA	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846969
16	NC_021528	AAG	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846969
17	NC_021528	TGT	3	9	1261	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846969
18	NC_021528	CGG	2	6	1361	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846969
19	NC_021528	CAT	2	6	1409	1414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846969
20	NC_021528	CGG	2	6	3596	3601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846970
21	NC_021528	AGC	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846970
22	NC_021528	CGG	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846970
23	NC_021528	ATA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846970
24	NC_021528	CAC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846970
25	NC_021528	TCA	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846970
26	NC_021528	TGA	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846970
27	NC_021528	CGA	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846970
28	NC_021528	CGC	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846970
29	NC_021528	ATT	2	6	4476	4481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846970
30	NC_021528	TGA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846970
31	NC_021528	TGA	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846971
32	NC_021528	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846971
33	NC_021528	ACA	3	9	5644	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846971
34	NC_021528	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846971
35	NC_021528	CAA	2	6	5709	5714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846971
36	NC_021528	AAG	2	6	5737	5742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846971
37	NC_021528	CAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846971
38	NC_021528	TTA	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846971
39	NC_021528	GTT	3	9	7338	7346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846972
40	NC_021528	CAG	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846972
41	NC_021528	TAA	2	6	7374	7379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846972
42	NC_021528	TTC	2	6	7517	7522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846972
43	NC_021528	TAA	2	6	9259	9264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846973
44	NC_021528	TGA	2	6	9337	9342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846973
45	NC_021528	GAA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846973
46	NC_021528	AGT	2	6	9563	9568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846973
47	NC_021528	ACT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846973
48	NC_021528	TTA	2	6	9705	9710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846973
49	NC_021528	AGA	2	6	9721	9726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846973
50	NC_021528	ATG	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846973
51	NC_021528	AAC	2	6	9961	9966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846973
52	NC_021528	CAG	2	6	10267	10272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846974
53	NC_021528	ATT	2	6	10391	10396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
54	NC_021528	AAT	2	6	10438	10443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846974
55	NC_021528	ATC	2	6	10464	10469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846974
56	NC_021528	AAG	2	6	10535	10540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846974
57	NC_021528	ATC	2	6	10570	10575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846974
58	NC_021528	ATT	2	6	10579	10584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
59	NC_021528	CTT	2	6	10656	10661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846974
60	NC_021528	ATT	2	6	10698	10703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
61	NC_021528	ACT	2	6	10738	10743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846974
62	NC_021528	ATT	2	6	10777	10782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846974
63	NC_021528	GAG	2	6	11530	11535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513846975
64	NC_021528	TTC	2	6	11570	11575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846975
65	NC_021528	TAT	2	6	11580	11585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846975
66	NC_021528	CTT	2	6	11591	11596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846975
67	NC_021528	ATC	2	6	11597	11602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846975
68	NC_021528	GTG	2	6	11619	11624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846975
69	NC_021528	AAT	2	6	11630	11635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846975
70	NC_021528	CAA	2	6	11744	11749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846975
71	NC_021528	TGA	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846975
72	NC_021528	GAA	2	6	11852	11857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846975
73	NC_021528	AAT	2	6	11872	11877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846975
74	NC_021528	GTT	2	6	11896	11901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846975
75	NC_021528	TTA	2	6	12083	12088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846975
76	NC_021528	CAA	3	9	12151	12159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846975
77	NC_021528	ATA	2	6	12240	12245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846975

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.