MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	GTCAA	2	10	471	480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021527	CAGTT	2	10	753	762	20 %	40 %	20 %	20 %	513846465
3	NC_021527	GATTT	2	10	816	825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021527	AATTT	2	10	3247	3256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021527	TTAAA	2	10	3269	3278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021527	TTGAA	2	10	3591	3600	40 %	40 %	20 %	0 %	513846469
7	NC_021527	GCCAC	2	10	5479	5488	20 %	0 %	20 %	60 %	513846470
8	NC_021527	AAATC	2	10	5764	5773	60 %	20 %	0 %	20 %	513846470
9	NC_021527	GGTTA	2	10	10281	10290	20 %	40 %	40 %	0 %	513846474
10	NC_021527	TGGCA	2	10	17025	17034	20 %	20 %	40 %	20 %	513846478
11	NC_021527	AAGTG	2	10	19430	19439	40 %	20 %	40 %	0 %	513846480
12	NC_021527	AAGAT	2	10	19507	19516	60 %	20 %	20 %	0 %	513846480
13	NC_021527	AAAAT	2	10	22407	22416	80 %	20 %	0 %	0 %	513846487
14	NC_021527	CCAAG	2	10	24969	24978	40 %	0 %	20 %	40 %	513846489
15	NC_021527	GCAAT	2	10	26324	26333	40 %	20 %	20 %	20 %	513846491
16	NC_021527	TTCGT	2	10	26953	26962	0 %	60 %	20 %	20 %	513846493
17	NC_021527	GGGCT	2	10	28491	28500	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021527	ATTAA	2	10	29017	29026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021527	CAGAC	2	10	29542	29551	40 %	0 %	20 %	40 %	513846495
20	NC_021527	GAGTG	2	10	37660	37669	20 %	20 %	60 %	0 %	513846502
21	NC_021527	TCAAT	2	10	39908	39917	40 %	40 %	0 %	20 %	513846503
22	NC_021527	CAAAT	2	10	43067	43076	60 %	20 %	0 %	20 %	513846507
23	NC_021527	CAGAT	2	10	43465	43474	40 %	20 %	20 %	20 %	513846507
24	NC_021527	AGATA	2	10	45131	45140	60 %	20 %	20 %	0 %	513846509
25	NC_021527	TCAAT	2	10	47317	47326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021527	TCATA	2	10	47547	47556	40 %	40 %	0 %	20 %	513846511
27	NC_021527	AGTTT	2	10	49032	49041	20 %	60 %	20 %	0 %	513846512

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.