MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	AAAT	2	8	218	225	75 %	25 %	0 %	0 %	513846464
2	NC_021527	CGAC	2	8	339	346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021527	AAAG	2	8	486	493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021527	TTCC	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	513846468
5	NC_021527	CTTG	2	8	2036	2043	0 %	50 %	25 %	25 %	513846468
6	NC_021527	TTGA	2	8	3366	3373	25 %	50 %	25 %	0 %	513846469
7	NC_021527	TGAC	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	513846469
8	NC_021527	GCCA	2	8	3795	3802	25 %	0 %	25 %	50 %	513846469
9	NC_021527	GACA	2	8	4286	4293	50 %	0 %	25 %	25 %	513846469
10	NC_021527	TCAT	2	8	4542	4549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021527	CTCG	2	8	4553	4560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021527	AAAG	2	8	4816	4823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021527	CATG	2	8	5209	5216	25 %	25 %	25 %	25 %	513846470
14	NC_021527	TGAA	2	8	5607	5614	50 %	25 %	25 %	0 %	513846470
15	NC_021527	TTCT	2	8	6409	6416	0 %	75 %	0 %	25 %	513846472
16	NC_021527	TTGT	2	8	7131	7138	0 %	75 %	25 %	0 %	513846472
17	NC_021527	ACAA	2	8	7388	7395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021527	GCTA	2	8	7540	7547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021527	CATA	2	8	7645	7652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021527	TTTG	2	8	7703	7710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021527	TAAA	2	8	7778	7785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021527	GATT	2	8	8077	8084	25 %	50 %	25 %	0 %	513846473
23	NC_021527	CGTC	2	8	8542	8549	0 %	25 %	25 %	50 %	513846473
24	NC_021527	GTGC	2	8	8576	8583	0 %	25 %	50 %	25 %	513846473
25	NC_021527	TTAA	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
26	NC_021527	TAAT	2	8	9030	9037	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
27	NC_021527	GCAA	2	8	9385	9392	50 %	0 %	25 %	25 %	513846473
28	NC_021527	TTGG	2	8	9640	9647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021527	TATC	2	8	10052	10059	25 %	50 %	0 %	25 %	513846474
30	NC_021527	TTGC	2	8	10826	10833	0 %	50 %	25 %	25 %	513846474
31	NC_021527	GCAA	2	8	10960	10967	50 %	0 %	25 %	25 %	513846474
32	NC_021527	CAAC	3	12	11483	11494	50 %	0 %	0 %	50 %	513846474
33	NC_021527	CAAA	2	8	12189	12196	75 %	0 %	0 %	25 %	513846474
34	NC_021527	AGGA	2	8	12554	12561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021527	ACCT	2	8	12612	12619	25 %	25 %	0 %	50 %	513846475
36	NC_021527	CAAA	2	8	12622	12629	75 %	0 %	0 %	25 %	513846475
37	NC_021527	AACT	2	8	14118	14125	50 %	25 %	0 %	25 %	513846477
38	NC_021527	GCTT	2	8	14854	14861	0 %	50 %	25 %	25 %	513846477
39	NC_021527	TTTC	2	8	15588	15595	0 %	75 %	0 %	25 %	513846477
40	NC_021527	CTGT	2	8	16055	16062	0 %	50 %	25 %	25 %	513846478
41	NC_021527	TATT	2	8	16075	16082	25 %	75 %	0 %	0 %	513846478
42	NC_021527	TGGC	2	8	16587	16594	0 %	25 %	50 %	25 %	513846478
43	NC_021527	GGTT	2	8	16716	16723	0 %	50 %	50 %	0 %	513846478
44	NC_021527	TAAA	2	8	16834	16841	75 %	25 %	0 %	0 %	513846478
45	NC_021527	GCGA	2	8	16890	16897	25 %	0 %	50 %	25 %	513846478
46	NC_021527	AGAA	2	8	17807	17814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021527	TTGT	2	8	18172	18179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021527	GTTA	2	8	18495	18502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021527	CTGA	2	8	18516	18523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021527	ACCC	2	8	19968	19975	25 %	0 %	0 %	75 %	513846482
51	NC_021527	AGTT	2	8	20340	20347	25 %	50 %	25 %	0 %	513846484
52	NC_021527	GAAC	2	8	20687	20694	50 %	0 %	25 %	25 %	513846484
53	NC_021527	GCCA	2	8	21304	21311	25 %	0 %	25 %	50 %	513846485
54	NC_021527	CGAA	2	8	21424	21431	50 %	0 %	25 %	25 %	513846485
55	NC_021527	AAAC	2	8	21580	21587	75 %	0 %	0 %	25 %	513846485
56	NC_021527	TGGC	2	8	21787	21794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021527	GGGT	2	8	22636	22643	0 %	25 %	75 %	0 %	513846487
58	NC_021527	CAAT	2	8	22720	22727	50 %	25 %	0 %	25 %	513846487
59	NC_021527	GGGA	2	8	22746	22753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021527	GTTA	2	8	22761	22768	25 %	50 %	25 %	0 %	513846488
61	NC_021527	AGCG	2	8	23056	23063	25 %	0 %	50 %	25 %	513846488
62	NC_021527	ACTT	2	8	23095	23102	25 %	50 %	0 %	25 %	513846488
63	NC_021527	GAAA	2	8	23115	23122	75 %	0 %	25 %	0 %	513846488
64	NC_021527	TTGA	2	8	23702	23709	25 %	50 %	25 %	0 %	513846489
65	NC_021527	TCAA	2	8	24222	24229	50 %	25 %	0 %	25 %	513846489
66	NC_021527	ACGG	2	8	24313	24320	25 %	0 %	50 %	25 %	513846489
67	NC_021527	GCAA	2	8	24496	24503	50 %	0 %	25 %	25 %	513846489
68	NC_021527	CGCT	2	8	24708	24715	0 %	25 %	25 %	50 %	513846489
69	NC_021527	GCTA	2	8	25049	25056	25 %	25 %	25 %	25 %	513846489
70	NC_021527	GCTG	2	8	25154	25161	0 %	25 %	50 %	25 %	513846489
71	NC_021527	ACCA	2	8	25181	25188	50 %	0 %	0 %	50 %	513846489
72	NC_021527	TAAT	2	8	25606	25613	50 %	50 %	0 %	0 %	513846490
73	NC_021527	TAGT	2	8	25627	25634	25 %	50 %	25 %	0 %	513846490
74	NC_021527	GCTT	2	8	25944	25951	0 %	50 %	25 %	25 %	513846490
75	NC_021527	AAAT	2	8	26071	26078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021527	ATGA	2	8	26098	26105	50 %	25 %	25 %	0 %	513846491
77	NC_021527	AAGG	2	8	26275	26282	50 %	0 %	50 %	0 %	513846491
78	NC_021527	TGAG	2	8	26433	26440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021527	TGGT	2	8	27647	27654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021527	CAGC	2	8	27715	27722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021527	TTTC	2	8	27981	27988	0 %	75 %	0 %	25 %	513846494
82	NC_021527	AGAT	2	8	28553	28560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021527	CAAT	2	8	28734	28741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021527	GTGC	2	8	28928	28935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021527	CCAG	2	8	29072	29079	25 %	0 %	25 %	50 %	513846495
86	NC_021527	TTAA	2	8	29857	29864	50 %	50 %	0 %	0 %	513846495
87	NC_021527	CAAT	2	8	30359	30366	50 %	25 %	0 %	25 %	513846495
88	NC_021527	ATTA	2	8	31252	31259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021527	ATTA	2	8	31409	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	513846496
90	NC_021527	CAGT	2	8	31961	31968	25 %	25 %	25 %	25 %	513846496
91	NC_021527	TTGA	2	8	32088	32095	25 %	50 %	25 %	0 %	513846496
92	NC_021527	TATT	2	8	32508	32515	25 %	75 %	0 %	0 %	513846498
93	NC_021527	CAGC	2	8	32614	32621	25 %	0 %	25 %	50 %	513846498
94	NC_021527	AGCC	2	8	33532	33539	25 %	0 %	25 %	50 %	513846499
95	NC_021527	GTTT	2	8	35212	35219	0 %	75 %	25 %	0 %	513846500
96	NC_021527	TTGA	2	8	35477	35484	25 %	50 %	25 %	0 %	513846501
97	NC_021527	TACT	2	8	36268	36275	25 %	50 %	0 %	25 %	513846501
98	NC_021527	GTCG	2	8	37099	37106	0 %	25 %	50 %	25 %	513846501
99	NC_021527	CAGG	2	8	37802	37809	25 %	0 %	50 %	25 %	513846502
100	NC_021527	ACTT	2	8	37913	37920	25 %	50 %	0 %	25 %	513846502
101	NC_021527	CGGC	2	8	38497	38504	0 %	0 %	50 %	50 %	513846503
102	NC_021527	GACT	2	8	38582	38589	25 %	25 %	25 %	25 %	513846503
103	NC_021527	GCTA	2	8	38609	38616	25 %	25 %	25 %	25 %	513846503
104	NC_021527	GTGG	2	8	38930	38937	0 %	25 %	75 %	0 %	513846503
105	NC_021527	CCAA	2	8	39477	39484	50 %	0 %	0 %	50 %	513846503
106	NC_021527	AAGA	2	8	40401	40408	75 %	0 %	25 %	0 %	513846503
107	NC_021527	CAAG	2	8	41055	41062	50 %	0 %	25 %	25 %	513846504
108	NC_021527	CTTA	2	8	41755	41762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021527	ATTT	2	8	41794	41801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021527	ATTA	2	8	41930	41937	50 %	50 %	0 %	0 %	513846506
111	NC_021527	ATGG	2	8	42055	42062	25 %	25 %	50 %	0 %	513846506
112	NC_021527	AGCC	2	8	42450	42457	25 %	0 %	25 %	50 %	513846506
113	NC_021527	TTGG	2	8	42802	42809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021527	ATTA	2	8	42864	42871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021527	CGCA	2	8	43384	43391	25 %	0 %	25 %	50 %	513846507
116	NC_021527	ACGC	2	8	43542	43549	25 %	0 %	25 %	50 %	513846507
117	NC_021527	ACTT	2	8	43621	43628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021527	TATT	2	8	43752	43759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021527	AGTT	2	8	43849	43856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021527	TCGC	2	8	44361	44368	0 %	25 %	25 %	50 %	513846508
121	NC_021527	TAGA	2	8	45190	45197	50 %	25 %	25 %	0 %	513846509
122	NC_021527	GACA	2	8	45902	45909	50 %	0 %	25 %	25 %	513846509
123	NC_021527	TGAT	2	8	46866	46873	25 %	50 %	25 %	0 %	513846510
124	NC_021527	CAAA	2	8	47095	47102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021527	TAAG	2	8	48102	48109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021527	TGAT	2	8	48827	48834	25 %	50 %	25 %	0 %	513846512
127	NC_021527	TAAA	2	8	48933	48940	75 %	25 %	0 %	0 %	513846512
128	NC_021527	TTGA	2	8	49861	49868	25 %	50 %	25 %	0 %	513846513
129	NC_021527	GGTG	2	8	50123	50130	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021527	TTTG	2	8	50359	50366	0 %	75 %	25 %	0 %	513846514
131	NC_021527	GTTT	2	8	50537	50544	0 %	75 %	25 %	0 %	513846514
132	NC_021527	ATCT	2	8	50645	50652	25 %	50 %	0 %	25 %	513846515
133	NC_021527	GTAT	2	8	50829	50836	25 %	50 %	25 %	0 %	513846515
134	NC_021527	TAAA	2	8	51705	51712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021527	CACC	2	8	51800	51807	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.