MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	AAAT	2	8	218	225	75 %	25 %	0 %	0 %	513846464
2	NC_021527	TTCC	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	513846468
3	NC_021527	CTTG	2	8	2036	2043	0 %	50 %	25 %	25 %	513846468
4	NC_021527	TTGA	2	8	3366	3373	25 %	50 %	25 %	0 %	513846469
5	NC_021527	TGAC	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	513846469
6	NC_021527	GCCA	2	8	3795	3802	25 %	0 %	25 %	50 %	513846469
7	NC_021527	GACA	2	8	4286	4293	50 %	0 %	25 %	25 %	513846469
8	NC_021527	CATG	2	8	5209	5216	25 %	25 %	25 %	25 %	513846470
9	NC_021527	TGAA	2	8	5607	5614	50 %	25 %	25 %	0 %	513846470
10	NC_021527	TTCT	2	8	6409	6416	0 %	75 %	0 %	25 %	513846472
11	NC_021527	TTGT	2	8	7131	7138	0 %	75 %	25 %	0 %	513846472
12	NC_021527	GATT	2	8	8077	8084	25 %	50 %	25 %	0 %	513846473
13	NC_021527	CGTC	2	8	8542	8549	0 %	25 %	25 %	50 %	513846473
14	NC_021527	GTGC	2	8	8576	8583	0 %	25 %	50 %	25 %	513846473
15	NC_021527	TTAA	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
16	NC_021527	TAAT	2	8	9030	9037	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
17	NC_021527	GCAA	2	8	9385	9392	50 %	0 %	25 %	25 %	513846473
18	NC_021527	TATC	2	8	10052	10059	25 %	50 %	0 %	25 %	513846474
19	NC_021527	TTGC	2	8	10826	10833	0 %	50 %	25 %	25 %	513846474
20	NC_021527	GCAA	2	8	10960	10967	50 %	0 %	25 %	25 %	513846474
21	NC_021527	CAAC	3	12	11483	11494	50 %	0 %	0 %	50 %	513846474
22	NC_021527	CAAA	2	8	12189	12196	75 %	0 %	0 %	25 %	513846474
23	NC_021527	ACCT	2	8	12612	12619	25 %	25 %	0 %	50 %	513846475
24	NC_021527	CAAA	2	8	12622	12629	75 %	0 %	0 %	25 %	513846475
25	NC_021527	AACT	2	8	14118	14125	50 %	25 %	0 %	25 %	513846477
26	NC_021527	GCTT	2	8	14854	14861	0 %	50 %	25 %	25 %	513846477
27	NC_021527	TTTC	2	8	15588	15595	0 %	75 %	0 %	25 %	513846477
28	NC_021527	CTGT	2	8	16055	16062	0 %	50 %	25 %	25 %	513846478
29	NC_021527	TATT	2	8	16075	16082	25 %	75 %	0 %	0 %	513846478
30	NC_021527	TGGC	2	8	16587	16594	0 %	25 %	50 %	25 %	513846478
31	NC_021527	GGTT	2	8	16716	16723	0 %	50 %	50 %	0 %	513846478
32	NC_021527	TAAA	2	8	16834	16841	75 %	25 %	0 %	0 %	513846478
33	NC_021527	GCGA	2	8	16890	16897	25 %	0 %	50 %	25 %	513846478
34	NC_021527	ACCC	2	8	19968	19975	25 %	0 %	0 %	75 %	513846482
35	NC_021527	AGTT	2	8	20340	20347	25 %	50 %	25 %	0 %	513846484
36	NC_021527	GAAC	2	8	20687	20694	50 %	0 %	25 %	25 %	513846484
37	NC_021527	GCCA	2	8	21304	21311	25 %	0 %	25 %	50 %	513846485
38	NC_021527	CGAA	2	8	21424	21431	50 %	0 %	25 %	25 %	513846485
39	NC_021527	AAAC	2	8	21580	21587	75 %	0 %	0 %	25 %	513846485
40	NC_021527	GGGT	2	8	22636	22643	0 %	25 %	75 %	0 %	513846487
41	NC_021527	CAAT	2	8	22720	22727	50 %	25 %	0 %	25 %	513846487
42	NC_021527	GTTA	2	8	22761	22768	25 %	50 %	25 %	0 %	513846488
43	NC_021527	AGCG	2	8	23056	23063	25 %	0 %	50 %	25 %	513846488
44	NC_021527	ACTT	2	8	23095	23102	25 %	50 %	0 %	25 %	513846488
45	NC_021527	GAAA	2	8	23115	23122	75 %	0 %	25 %	0 %	513846488
46	NC_021527	TTGA	2	8	23702	23709	25 %	50 %	25 %	0 %	513846489
47	NC_021527	TCAA	2	8	24222	24229	50 %	25 %	0 %	25 %	513846489
48	NC_021527	ACGG	2	8	24313	24320	25 %	0 %	50 %	25 %	513846489
49	NC_021527	GCAA	2	8	24496	24503	50 %	0 %	25 %	25 %	513846489
50	NC_021527	CGCT	2	8	24708	24715	0 %	25 %	25 %	50 %	513846489
51	NC_021527	GCTA	2	8	25049	25056	25 %	25 %	25 %	25 %	513846489
52	NC_021527	GCTG	2	8	25154	25161	0 %	25 %	50 %	25 %	513846489
53	NC_021527	ACCA	2	8	25181	25188	50 %	0 %	0 %	50 %	513846489
54	NC_021527	TAAT	2	8	25606	25613	50 %	50 %	0 %	0 %	513846490
55	NC_021527	TAGT	2	8	25627	25634	25 %	50 %	25 %	0 %	513846490
56	NC_021527	GCTT	2	8	25944	25951	0 %	50 %	25 %	25 %	513846490
57	NC_021527	ATGA	2	8	26098	26105	50 %	25 %	25 %	0 %	513846491
58	NC_021527	AAGG	2	8	26275	26282	50 %	0 %	50 %	0 %	513846491
59	NC_021527	TTTC	2	8	27981	27988	0 %	75 %	0 %	25 %	513846494
60	NC_021527	CCAG	2	8	29072	29079	25 %	0 %	25 %	50 %	513846495
61	NC_021527	TTAA	2	8	29857	29864	50 %	50 %	0 %	0 %	513846495
62	NC_021527	CAAT	2	8	30359	30366	50 %	25 %	0 %	25 %	513846495
63	NC_021527	ATTA	2	8	31409	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	513846496
64	NC_021527	CAGT	2	8	31961	31968	25 %	25 %	25 %	25 %	513846496
65	NC_021527	TTGA	2	8	32088	32095	25 %	50 %	25 %	0 %	513846496
66	NC_021527	TATT	2	8	32508	32515	25 %	75 %	0 %	0 %	513846498
67	NC_021527	CAGC	2	8	32614	32621	25 %	0 %	25 %	50 %	513846498
68	NC_021527	AGCC	2	8	33532	33539	25 %	0 %	25 %	50 %	513846499
69	NC_021527	GTTT	2	8	35212	35219	0 %	75 %	25 %	0 %	513846500
70	NC_021527	TTGA	2	8	35477	35484	25 %	50 %	25 %	0 %	513846501
71	NC_021527	TACT	2	8	36268	36275	25 %	50 %	0 %	25 %	513846501
72	NC_021527	GTCG	2	8	37099	37106	0 %	25 %	50 %	25 %	513846501
73	NC_021527	CAGG	2	8	37802	37809	25 %	0 %	50 %	25 %	513846502
74	NC_021527	ACTT	2	8	37913	37920	25 %	50 %	0 %	25 %	513846502
75	NC_021527	CGGC	2	8	38497	38504	0 %	0 %	50 %	50 %	513846503
76	NC_021527	GACT	2	8	38582	38589	25 %	25 %	25 %	25 %	513846503
77	NC_021527	GCTA	2	8	38609	38616	25 %	25 %	25 %	25 %	513846503
78	NC_021527	GTGG	2	8	38930	38937	0 %	25 %	75 %	0 %	513846503
79	NC_021527	CCAA	2	8	39477	39484	50 %	0 %	0 %	50 %	513846503
80	NC_021527	AAGA	2	8	40401	40408	75 %	0 %	25 %	0 %	513846503
81	NC_021527	CAAG	2	8	41055	41062	50 %	0 %	25 %	25 %	513846504
82	NC_021527	ATTA	2	8	41930	41937	50 %	50 %	0 %	0 %	513846506
83	NC_021527	ATGG	2	8	42055	42062	25 %	25 %	50 %	0 %	513846506
84	NC_021527	AGCC	2	8	42450	42457	25 %	0 %	25 %	50 %	513846506
85	NC_021527	CGCA	2	8	43384	43391	25 %	0 %	25 %	50 %	513846507
86	NC_021527	ACGC	2	8	43542	43549	25 %	0 %	25 %	50 %	513846507
87	NC_021527	TCGC	2	8	44361	44368	0 %	25 %	25 %	50 %	513846508
88	NC_021527	TAGA	2	8	45190	45197	50 %	25 %	25 %	0 %	513846509
89	NC_021527	GACA	2	8	45902	45909	50 %	0 %	25 %	25 %	513846509
90	NC_021527	TGAT	2	8	46866	46873	25 %	50 %	25 %	0 %	513846510
91	NC_021527	TGAT	2	8	48827	48834	25 %	50 %	25 %	0 %	513846512
92	NC_021527	TAAA	2	8	48933	48940	75 %	25 %	0 %	0 %	513846512
93	NC_021527	TTGA	2	8	49861	49868	25 %	50 %	25 %	0 %	513846513
94	NC_021527	TTTG	2	8	50359	50366	0 %	75 %	25 %	0 %	513846514
95	NC_021527	GTTT	2	8	50537	50544	0 %	75 %	25 %	0 %	513846514
96	NC_021527	ATCT	2	8	50645	50652	25 %	50 %	0 %	25 %	513846515
97	NC_021527	GTAT	2	8	50829	50836	25 %	50 %	25 %	0 %	513846515

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.