MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	CAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846464
2	NC_021527	GTG	2	6	130	135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
3	NC_021527	GGT	2	6	164	169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
4	NC_021527	ATC	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846464
5	NC_021527	GTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
6	NC_021527	ACG	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021527	TGG	2	6	495	500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021527	TTG	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846465
9	NC_021527	AAG	2	6	554	559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846465
10	NC_021527	TAG	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846466
11	NC_021527	TAT	2	6	1066	1071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846466
12	NC_021527	CTG	2	6	1103	1108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846466
13	NC_021527	CTC	2	6	1115	1120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513846466
14	NC_021527	TCA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846466
15	NC_021527	CTG	2	6	1228	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846467
16	NC_021527	TGG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846467
17	NC_021527	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846467
18	NC_021527	AAC	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846467
19	NC_021527	ATT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846467
20	NC_021527	GAT	3	9	1613	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846467
21	NC_021527	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
22	NC_021527	GAC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
23	NC_021527	CAC	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846468
24	NC_021527	AGC	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
25	NC_021527	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
26	NC_021527	TAA	2	6	2051	2056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
27	NC_021527	TAG	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
28	NC_021527	CAG	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
29	NC_021527	GCC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846468
30	NC_021527	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
31	NC_021527	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
32	NC_021527	TCT	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
33	NC_021527	GTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846468
34	NC_021527	ATG	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
35	NC_021527	ACC	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846468
36	NC_021527	GCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
37	NC_021527	TGA	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
38	NC_021527	CTT	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
39	NC_021527	CAA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
40	NC_021527	ATA	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
41	NC_021527	AAC	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
42	NC_021527	CAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
43	NC_021527	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846468
44	NC_021527	GCT	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846468
45	NC_021527	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846468
46	NC_021527	AGT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
47	NC_021527	GGT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846468
48	NC_021527	TTC	2	6	2980	2985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
49	NC_021527	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
50	NC_021527	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
51	NC_021527	ATA	2	6	3175	3180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
52	NC_021527	ATT	2	6	3287	3292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846469
53	NC_021527	ATC	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846469
54	NC_021527	ATC	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846469
55	NC_021527	GCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
56	NC_021527	AGC	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846469
57	NC_021527	TTG	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846469
58	NC_021527	AAC	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
59	NC_021527	GTT	3	9	3979	3987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846469
60	NC_021527	ATG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846469
61	NC_021527	TGC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
62	NC_021527	AAC	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
63	NC_021527	CAA	2	6	4205	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
64	NC_021527	AAT	2	6	4233	4238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846469
65	NC_021527	GTC	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
66	NC_021527	CGT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
67	NC_021527	AAC	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
68	NC_021527	TGC	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
69	NC_021527	AGC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021527	ACC	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021527	AAT	2	6	4646	4651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021527	ATT	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021527	GAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021527	ATT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021527	CAA	2	6	4997	5002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
76	NC_021527	ACA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
77	NC_021527	TGA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846470
78	NC_021527	ATT	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846470
79	NC_021527	GCG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846470
80	NC_021527	ACG	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846470
81	NC_021527	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846470
82	NC_021527	AGC	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846470
83	NC_021527	CAA	2	6	5620	5625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
84	NC_021527	TCA	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846470
85	NC_021527	TGA	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846470
86	NC_021527	GAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021527	TAA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021527	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021527	ATT	2	6	5870	5875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021527	CTA	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021527	TCA	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846471
92	NC_021527	CTT	2	6	6314	6319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846472
93	NC_021527	CTA	2	6	6456	6461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
94	NC_021527	ATT	2	6	6525	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846472
95	NC_021527	GTT	2	6	6583	6588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846472
96	NC_021527	AAG	2	6	6608	6613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846472
97	NC_021527	TCA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
98	NC_021527	TCA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
99	NC_021527	GTT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846472
100	NC_021527	AAT	2	6	7098	7103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846472
101	NC_021527	ACC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846472
102	NC_021527	CTC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021527	CAG	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021527	AAT	2	6	7469	7474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021527	ACT	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021527	AGT	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021527	GGC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021527	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021527	ATG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021527	CAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
111	NC_021527	CAA	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
112	NC_021527	AAG	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846473
113	NC_021527	TAT	2	6	8516	8521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846473
114	NC_021527	TGA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
115	NC_021527	TAC	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846473
116	NC_021527	CGG	2	6	8634	8639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846473
117	NC_021527	CGG	2	6	8813	8818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846473
118	NC_021527	AAT	2	6	9254	9259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846473
119	NC_021527	GTA	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
120	NC_021527	ACA	2	6	9421	9426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
121	NC_021527	TTA	2	6	9482	9487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846473
122	NC_021527	AGA	2	6	9496	9501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846473
123	NC_021527	ACA	2	6	9514	9519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
124	NC_021527	TGA	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
125	NC_021527	GTT	2	6	9692	9697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021527	TTA	2	6	9701	9706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021527	GTC	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021527	CTC	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_021527	AGT	2	6	9835	9840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021527	TGA	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021527	AGT	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021527	TAA	3	9	9970	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846474
133	NC_021527	GGC	2	6	10007	10012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846474
134	NC_021527	GTT	2	6	10040	10045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846474
135	NC_021527	AGA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846474
136	NC_021527	TTA	2	6	10130	10135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846474
137	NC_021527	TAT	2	6	10251	10256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846474
138	NC_021527	TGG	3	9	10350	10358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846474
139	NC_021527	TTG	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846474
140	NC_021527	TAA	2	6	10441	10446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846474
141	NC_021527	GTG	2	6	10452	10457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846474
142	NC_021527	AAT	2	6	10487	10492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846474
143	NC_021527	ACA	2	6	10587	10592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846474
144	NC_021527	AAG	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846474
145	NC_021527	CAA	2	6	11436	11441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846474
146	NC_021527	GAA	2	6	11495	11500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846474
147	NC_021527	TCT	2	6	11546	11551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846474
148	NC_021527	ACT	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846474
149	NC_021527	CAA	2	6	12065	12070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846474
150	NC_021527	GAG	2	6	12230	12235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513846474
151	NC_021527	TGA	2	6	12265	12270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
152	NC_021527	ATG	2	6	12312	12317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
153	NC_021527	TGA	2	6	12520	12525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
154	NC_021527	TAT	2	6	12564	12569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021527	TGG	2	6	12600	12605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846475
156	NC_021527	GTC	2	6	12729	12734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846475
157	NC_021527	GTA	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846475
158	NC_021527	TGA	2	6	12801	12806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846475
159	NC_021527	AAT	2	6	12812	12817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846475
160	NC_021527	TCT	2	6	12864	12869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846475
161	NC_021527	GAT	2	6	12919	12924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846475
162	NC_021527	TCA	2	6	13011	13016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846475
163	NC_021527	GGT	2	6	13076	13081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846475
164	NC_021527	TTA	2	6	13130	13135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846475
165	NC_021527	AAC	2	6	13273	13278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846476
166	NC_021527	ATG	2	6	13303	13308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846476
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168	NC_021527	ATA	2	6	13393	13398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846476
169	NC_021527	ACC	2	6	13485	13490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846476
170	NC_021527	CAA	2	6	13494	13499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846476
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172	NC_021527	CAA	2	6	13563	13568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846476
173	NC_021527	ACG	2	6	13581	13586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846476
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175	NC_021527	GTT	2	6	13712	13717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846476
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178	NC_021527	AGG	2	6	13818	13823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021527	GGC	2	6	13951	13956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846477
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184	NC_021527	TGA	2	6	14481	14486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846477
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208	NC_021527	GGT	2	6	15979	15984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
209	NC_021527	TTA	2	6	16009	16014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846478
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239	NC_021527	TAA	2	6	17999	18004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_021527	TTA	2	6	18125	18130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_021527	AAG	2	6	18131	18136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
242	NC_021527	AAG	2	6	18310	18315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_021527	TAC	2	6	18353	18358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_021527	CAG	2	6	18366	18371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_021527	AGG	2	6	18402	18407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
246	NC_021527	CGT	2	6	18444	18449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_021527	TAG	2	6	18529	18534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021527	AAC	2	6	18546	18551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_021527	GTT	2	6	18562	18567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021527	AGG	2	6	18604	18609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_021527	CAA	2	6	18639	18644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846480
252	NC_021527	GTG	2	6	18645	18650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846480
253	NC_021527	ACG	2	6	18696	18701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846480
254	NC_021527	GAA	3	9	18942	18950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846480
255	NC_021527	TGA	2	6	18995	19000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846480
256	NC_021527	GAC	2	6	19050	19055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846480
257	NC_021527	CGC	2	6	19061	19066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846480
258	NC_021527	AGC	2	6	19073	19078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846480
259	NC_021527	TGA	2	6	19163	19168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846480
260	NC_021527	AAG	2	6	19182	19187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846480
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289	NC_021527	ATG	2	6	20891	20896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846485
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293	NC_021527	CAC	2	6	21030	21035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846485
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374	NC_021527	AGA	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
375	NC_021527	AAT	2	6	27788	27793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846494
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381	NC_021527	AAT	2	6	28057	28062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846494
382	NC_021527	AGC	2	6	28144	28149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846494
383	NC_021527	AAT	2	6	28163	28168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846494
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385	NC_021527	TAT	2	6	28432	28437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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