MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	AG	3	6	612	617	50 %	0 %	50 %	0 %	513846465
2	NC_021527	TC	3	6	896	901	0 %	50 %	0 %	50 %	513846466
3	NC_021527	GC	3	6	1885	1890	0 %	0 %	50 %	50 %	513846468
4	NC_021527	TC	3	6	3183	3188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021527	AT	3	6	4427	4432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021527	AT	3	6	6127	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	513846471
7	NC_021527	AT	3	6	6146	6151	50 %	50 %	0 %	0 %	513846471
8	NC_021527	AT	3	6	6538	6543	50 %	50 %	0 %	0 %	513846472
9	NC_021527	AT	3	6	7249	7254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021527	AG	3	6	10162	10167	50 %	0 %	50 %	0 %	513846474
11	NC_021527	GC	3	6	12702	12707	0 %	0 %	50 %	50 %	513846475
12	NC_021527	GC	3	6	13209	13214	0 %	0 %	50 %	50 %	513846476
13	NC_021527	TG	3	6	13960	13965	0 %	50 %	50 %	0 %	513846477
14	NC_021527	GC	3	6	16465	16470	0 %	0 %	50 %	50 %	513846478
15	NC_021527	AC	3	6	16746	16751	50 %	0 %	0 %	50 %	513846478
16	NC_021527	TG	3	6	16820	16825	0 %	50 %	50 %	0 %	513846478
17	NC_021527	TA	3	6	17476	17481	50 %	50 %	0 %	0 %	513846479
18	NC_021527	TG	3	6	18233	18238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021527	CT	3	6	18342	18347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021527	CG	3	6	23085	23090	0 %	0 %	50 %	50 %	513846488
21	NC_021527	GC	3	6	23504	23509	0 %	0 %	50 %	50 %	513846489
22	NC_021527	CT	3	6	24126	24131	0 %	50 %	0 %	50 %	513846489
23	NC_021527	AG	3	6	24356	24361	50 %	0 %	50 %	0 %	513846489
24	NC_021527	TA	3	6	25999	26004	50 %	50 %	0 %	0 %	513846490
25	NC_021527	CA	3	6	26417	26422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021527	TA	3	6	28666	28671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021527	AC	3	6	29173	29178	50 %	0 %	0 %	50 %	513846495
28	NC_021527	TA	3	6	29663	29668	50 %	50 %	0 %	0 %	513846495
29	NC_021527	CA	3	6	31227	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021527	CG	3	6	31685	31690	0 %	0 %	50 %	50 %	513846496
31	NC_021527	GC	3	6	32081	32086	0 %	0 %	50 %	50 %	513846496
32	NC_021527	AC	3	6	32686	32691	50 %	0 %	0 %	50 %	513846498
33	NC_021527	GT	3	6	33658	33663	0 %	50 %	50 %	0 %	513846499
34	NC_021527	CG	3	6	35393	35398	0 %	0 %	50 %	50 %	513846501
35	NC_021527	GC	4	8	38400	38407	0 %	0 %	50 %	50 %	513846503
36	NC_021527	CA	3	6	38483	38488	50 %	0 %	0 %	50 %	513846503
37	NC_021527	AT	3	6	40620	40625	50 %	50 %	0 %	0 %	513846504
38	NC_021527	CG	3	6	43229	43234	0 %	0 %	50 %	50 %	513846507
39	NC_021527	TA	3	6	46294	46299	50 %	50 %	0 %	0 %	513846510
40	NC_021527	TA	4	8	46889	46896	50 %	50 %	0 %	0 %	513846510
41	NC_021527	AC	3	6	47104	47109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021527	AT	3	6	47632	47637	50 %	50 %	0 %	0 %	513846511
43	NC_021527	AT	3	6	50551	50556	50 %	50 %	0 %	0 %	513846514
44	NC_021527	AT	3	6	50810	50815	50 %	50 %	0 %	0 %	513846515
45	NC_021527	AG	3	6	51541	51546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021527	AT	3	6	51601	51606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021527	TA	3	6	51613	51618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021527	CA	3	6	51827	51832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.